64 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene AFE_1608 on replicon NC_011761
Organism: Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011761  AFE_1608    100 
 
 		 916 bp  1816    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1426  Integrase catalytic region  98.91 
 
 		 915 bp  1729    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0450418  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5122  integrase catalytic subunit  81.7 
 
 		 849 bp  264  4e-68  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.184507 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5204  integrase catalytic subunit  81.7 
 
 		 849 bp  264  4e-68  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.184454  normal  0.989225 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3255  Integrase catalytic region  80.48 
 
 		 852 bp  210  5e-52  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3906    80.28 
 
 		 912 bp  202  1.0000000000000001e-49  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.414091  normal  0.612395 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4953  integrase catalytic region  78.84 
 
 		 852 bp  192  1e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4441  integrase catalytic region  79.74 
 
 		 855 bp  178  1.9999999999999998e-42  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5064  integrase catalytic region  79.74 
 
 		 855 bp  178  1.9999999999999998e-42  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5344  integrase catalytic region  79.74 
 
 		 855 bp  178  1.9999999999999998e-42  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.438366  normal  0.0855179 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5555  integrase catalytic region  79.74 
 
 		 855 bp  178  1.9999999999999998e-42  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.884215 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1896  ISMca3, transposase, OrfB  80.73 
 
 		 849 bp  174  3e-41  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0735  ISMca3, transposase, OrfB  80.73 
 
 		 849 bp  174  3e-41  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.990065  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5725  integrase catalytic region  80.65 
 
 		 912 bp  163  1e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2820  Integrase catalytic region  79.54 
 
 		 915 bp  155  3e-35  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5541  transposase catalytic site ISRme15  79.8 
 
 		 858 bp  149  2e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0008  Integrase catalytic region  79.8 
 
 		 858 bp  149  2e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.230626  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1826  Integrase catalytic region  79.8 
 
 		 858 bp  149  2e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.456922  normal  0.0211966 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6067  transposase catalytic site ISRme15  79.8 
 
 		 858 bp  149  2e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.415785 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0740  Integrase catalytic region  79.8 
 
 		 858 bp  149  2e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0332591  normal  0.114218 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0907  integrase catalytic subunit  78.7 
 
 		 915 bp  133  1.0000000000000001e-28  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1719    85.21 
 
 		 473 bp  115  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.184214  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2492    92.96 
 
 		 565 bp  101  3e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.552533  normal  0.0258476 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3375    86.54 
 
 		 279 bp  95.6  2e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.292751 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3563    82.1 
 
 		 943 bp  91.7  3e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.452743  normal  0.133184 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1141  integrase catalytic region  90.14 
 
 		 552 bp  85.7  0.00000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.555646  normal  1 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6153    87.21 
 
 		 327 bp  83.8  0.00000000000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2709  integrase catalytic subunit  84.55 
 
 		 900 bp  83.8  0.00000000000008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2937  integrase catalytic subunit  84.55 
 
 		 900 bp  83.8  0.00000000000008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.529853  normal  0.799386 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0119  transposase subunit; putative  83.2 
 
 		 339 bp  81.8  0.0000000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0827163  n/a   
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6152    89.71 
 
 		 249 bp  79.8  0.000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.897664 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6731    87.84 
 
 		 2015 bp  75.8  0.00000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.144839 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1616    82.79 
 
 		 793 bp  75.8  0.00000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2120  integrase, catalytic region  81.21 
 
 		 906 bp  73.8  0.00000000008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.824405  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3846  integrase catalytic subunit  87.01 
 
 		 906 bp  73.8  0.00000000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.386301 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1572  integrase, catalytic region  81.21 
 
 		 906 bp  73.8  0.00000000008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1286  hypothetical protein  83.84 
 
 		 558 bp  69.9  0.000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.350643  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1263  transposase subunit; putative  84.27 
 
 		 165 bp  65.9  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3544    93.18 
 
 		 802 bp  63.9  0.00000008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010518  Mrad2831_6463  integrase catalytic region  97.22 
 
 		 906 bp  63.9  0.00000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  0.666389 
 
 
-
 
NC_010517  Mrad2831_6426  integrase catalytic region  97.22 
 
 		 906 bp  63.9  0.00000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1337  integrase, catalytic region  91.49 
 
 		 120 bp  61.9  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8478    91.49 
 
 		 102 bp  61.9  0.0000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.744353  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2741  Integrase catalytic region  91.11 
 
 		 450 bp  58  0.000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0894729  normal  0.05514 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2513  Integrase catalytic region  91.11 
 
 		 906 bp  58  0.000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.298059 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1663  Integrase catalytic region  91.11 
 
 		 906 bp  58  0.000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1636    91.11 
 
 		 906 bp  58  0.000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.138484  normal  0.363265 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1597  Integrase catalytic region  91.11 
 
 		 906 bp  58  0.000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.369801  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0760  integrase catalytic subunit  86.15 
 
 		 735 bp  58  0.000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2037  transposase subunit; putative  80.8 
 
 		 279 bp  58  0.000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1309    83.15 
 
 		 165 bp  58  0.000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.631688  n/a   
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9838  transposase  81.48 
 
 		 906 bp  56  0.00002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9898  transposase  81.48 
 
 		 906 bp  56  0.00002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1703    100 
 
 		 641 bp  56  0.00002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2687    85.71 
 
 		 267 bp  54  0.00007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5392    90.2 
 
 		 124 bp  54  0.00007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.619468  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02392  ISPsy21, transposase OrfB  79.33 
 
 		 774 bp  52  0.0003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.406166  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02252  ISPsy21, transposase OrfB  79.33 
 
 		 687 bp  52  0.0003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3162  integrase catalytic subunit  88 
 
 		 906 bp  52  0.0003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.116464  normal  0.334205 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1793    85.96 
 
 		 180 bp  50.1  0.001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.331278  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1753  Integrase catalytic region  88.89 
 
 		 906 bp  50.1  0.001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.289897  normal  0.869594 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01694  TnpB  86.79 
 
 		 300 bp  50.1  0.001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2457    96.55 
 
 		 893 bp  50.1  0.001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2845    96.55 
 
 		 965 bp  50.1  0.001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.133213 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>