37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MCA1703 on replicon NC_002977
Organism: Methylococcus capsulatus str. Bath



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002977  MCA1703    100 
 
 		 641 bp  1271    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1572  integrase, catalytic region  89.71 
 
 		 906 bp  79.8  0.0000000000009  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2120  integrase, catalytic region  89.71 
 
 		 906 bp  79.8  0.0000000000009  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.824405  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0760  integrase catalytic subunit  93.48 
 
 		 735 bp  67.9  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2709  integrase catalytic subunit  93.18 
 
 		 900 bp  63.9  0.00000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2937  integrase catalytic subunit  93.18 
 
 		 900 bp  63.9  0.00000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.529853  normal  0.799386 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4212  integrase catalytic subunit  91.3 
 
 		 906 bp  60  0.0000008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.955324  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1286  hypothetical protein  85.14 
 
 		 558 bp  60  0.0000008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.350643  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0133  transposase subunit; putative  94.74 
 
 		 207 bp  60  0.0000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5725  integrase catalytic region  94.74 
 
 		 912 bp  60  0.0000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8255  transposase  92.68 
 
 		 369 bp  58  0.000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0325797  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1608    100 
 
 		 916 bp  56  0.00001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1426  Integrase catalytic region  100 
 
 		 915 bp  56  0.00001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0450418  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3544    85.48 
 
 		 802 bp  52  0.0002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02252  ISPsy21, transposase OrfB  90.48 
 
 		 687 bp  52  0.0002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03920  ISPsy21, transposase OrfB  90.48 
 
 		 513 bp  52  0.0002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.67034  n/a   
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9898  transposase  89.13 
 
 		 906 bp  52  0.0002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9838  transposase  89.13 
 
 		 906 bp  52  0.0002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2492    94.12 
 
 		 565 bp  52  0.0002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.552533  normal  0.0258476 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6731    84.62 
 
 		 2015 bp  50.1  0.0008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.144839 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2528  Integrase catalytic region  90 
 
 		 906 bp  48.1  0.003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000000564647  hitchhiker  0.00383779 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2043    90 
 
 		 2389 bp  48.1  0.003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.153153  hitchhiker  0.00767267 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1236  Integrase catalytic region  90 
 
 		 876 bp  48.1  0.003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.305005 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3483  Integrase catalytic region  90 
 
 		 906 bp  48.1  0.003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00971742  hitchhiker  0.00375901 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2687    91.67 
 
 		 267 bp  48.1  0.003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3608  Integrase catalytic region  90 
 
 		 906 bp  48.1  0.003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0251528  normal  0.0493713 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2741  Integrase catalytic region  91.67 
 
 		 450 bp  48.1  0.003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0894729  normal  0.05514 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2513  Integrase catalytic region  91.67 
 
 		 906 bp  48.1  0.003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.298059 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1753  Integrase catalytic region  91.67 
 
 		 906 bp  48.1  0.003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.289897  normal  0.869594 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1663  Integrase catalytic region  91.67 
 
 		 906 bp  48.1  0.003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1636    91.67 
 
 		 906 bp  48.1  0.003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.138484  normal  0.363265 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1597  Integrase catalytic region  91.67 
 
 		 906 bp  48.1  0.003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.369801  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02392  ISPsy21, transposase OrfB  90 
 
 		 774 bp  48.1  0.003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.406166  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1445    91.67 
 
 		 324 bp  48.1  0.003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1295    96.43 
 
 		 279 bp  48.1  0.003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3375    93.75 
 
 		 279 bp  48.1  0.003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.292751 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3162  integrase catalytic subunit  83.82 
 
 		 906 bp  48.1  0.003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.116464  normal  0.334205 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>