40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_1295 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_1295    100 
 
 		 279 bp  553  1e-156  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010517  Mrad2831_6426  integrase catalytic region  83.52 
 
 		 906 bp  176  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010518  Mrad2831_6463  integrase catalytic region  83.52 
 
 		 906 bp  176  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  0.666389 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1572  integrase, catalytic region  89.19 
 
 		 906 bp  151  1.0000000000000001e-34  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2120  integrase, catalytic region  89.19 
 
 		 906 bp  151  1.0000000000000001e-34  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.824405  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6731    84.57 
 
 		 2015 bp  133  3e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.144839 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3162  integrase catalytic subunit  86 
 
 		 906 bp  131  1.0000000000000001e-28  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.116464  normal  0.334205 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3544    81.45 
 
 		 802 bp  127  2e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1445    90.59 
 
 		 324 bp  105  6e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3563    84.56 
 
 		 943 bp  103  3e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.452743  normal  0.133184 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2687    93.44 
 
 		 267 bp  89.7  4e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2709  integrase catalytic subunit  84.55 
 
 		 900 bp  83.8  0.00000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2937  integrase catalytic subunit  84.55 
 
 		 900 bp  83.8  0.00000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.529853  normal  0.799386 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4212  integrase catalytic subunit  83.8 
 
 		 906 bp  83.8  0.00000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.955324  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3846  integrase catalytic subunit  82.68 
 
 		 906 bp  77.8  0.000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.386301 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3929    88 
 
 		 216 bp  77.8  0.000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0760  integrase catalytic subunit  82.09 
 
 		 735 bp  75.8  0.000000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0740  Integrase catalytic region  84 
 
 		 858 bp  71.9  0.00000000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0332591  normal  0.114218 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0008  Integrase catalytic region  84 
 
 		 858 bp  71.9  0.00000000009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.230626  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1826  Integrase catalytic region  84 
 
 		 858 bp  71.9  0.00000000009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.456922  normal  0.0211966 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5541  transposase catalytic site ISRme15  84 
 
 		 858 bp  71.9  0.00000000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6067  transposase catalytic site ISRme15  84 
 
 		 858 bp  71.9  0.00000000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.415785 
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9838  transposase  83.17 
 
 		 906 bp  65.9  0.000000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3384  hypothetical protein  82.3 
 
 		 345 bp  65.9  0.000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9898  transposase  83.17 
 
 		 906 bp  65.9  0.000000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0539  transposase  83.33 
 
 		 300 bp  63.9  0.00000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1616    83 
 
 		 793 bp  63.9  0.00000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6829    83.53 
 
 		 255 bp  58  0.000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0536    82.29 
 
 		 456 bp  56  0.000005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.193561  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2043    83.54 
 
 		 2389 bp  54  0.00002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.153153  hitchhiker  0.00767267 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2528  Integrase catalytic region  83.54 
 
 		 906 bp  54  0.00002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000000564647  hitchhiker  0.00383779 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3483  Integrase catalytic region  83.54 
 
 		 906 bp  54  0.00002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00971742  hitchhiker  0.00375901 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3608  Integrase catalytic region  83.54 
 
 		 906 bp  54  0.00002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0251528  normal  0.0493713 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7786  hypothetical protein  92.11 
 
 		 324 bp  52  0.00008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.0016591  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02392  ISPsy21, transposase OrfB  87.04 
 
 		 774 bp  52  0.00008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.406166  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5392    86.21 
 
 		 124 bp  52  0.00008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.619468  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5725  integrase catalytic region  81.19 
 
 		 912 bp  50.1  0.0003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3375    81.52 
 
 		 279 bp  48.1  0.001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.292751 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1703    96.43 
 
 		 641 bp  48.1  0.001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1236  Integrase catalytic region  82.28 
 
 		 876 bp  46.1  0.005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.305005 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>