95 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_2043 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_2528  Integrase catalytic region  100 
 
 		 906 bp  936    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000000564647  hitchhiker  0.00383779 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1236  Integrase catalytic region  99.79 
 
 		 876 bp  928    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.305005 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2043    100 
 
 		 2389 bp  4736    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.153153  hitchhiker  0.00767267 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2049    99.27 
 
 		 2995 bp  2902    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0144762  decreased coverage  0.00465483 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3483  Integrase catalytic region  100 
 
 		 906 bp  936    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00971742  hitchhiker  0.00375901 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3608  Integrase catalytic region  100 
 
 		 906 bp  936    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0251528  normal  0.0493713 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3628    96.46 
 
 		 4277 bp  2405    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0797695  decreased coverage  0.00230701 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3888    85.77 
 
 		 2845 bp  210  1e-51  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0687901  normal  0.0695799 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1589    84.55 
 
 		 2527 bp  176  2e-41  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.330656  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0760  integrase catalytic subunit  84.57 
 
 		 735 bp  143  3.0000000000000003e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4212  integrase catalytic subunit  85.26 
 
 		 906 bp  127  1.9999999999999998e-26  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.955324  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3424    86.23 
 
 		 2811 bp  123  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.212829  normal  0.19279 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1572  integrase, catalytic region  82.14 
 
 		 906 bp  95.6  6e-17  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2120  integrase, catalytic region  82.14 
 
 		 906 bp  95.6  6e-17  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.824405  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2741  Integrase catalytic region  91.55 
 
 		 450 bp  93.7  2e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0894729  normal  0.05514 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2513  Integrase catalytic region  91.55 
 
 		 906 bp  93.7  2e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.298059 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1597  Integrase catalytic region  91.55 
 
 		 906 bp  93.7  2e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.369801  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1636    91.55 
 
 		 906 bp  93.7  2e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.138484  normal  0.363265 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1663  Integrase catalytic region  91.55 
 
 		 906 bp  93.7  2e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6731    82.24 
 
 		 2015 bp  87.7  0.00000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.144839 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1753  Integrase catalytic region  90.14 
 
 		 906 bp  85.7  0.00000000000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.289897  normal  0.869594 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2937  integrase catalytic subunit  84.07 
 
 		 900 bp  81.8  0.0000000000008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.529853  normal  0.799386 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2709  integrase catalytic subunit  84.07 
 
 		 900 bp  81.8  0.0000000000008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3162  integrase catalytic subunit  80.95 
 
 		 906 bp  79.8  0.000000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.116464  normal  0.334205 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02392  ISPsy21, transposase OrfB  90.62 
 
 		 774 bp  79.8  0.000000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.406166  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01694  TnpB  88.16 
 
 		 300 bp  79.8  0.000000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010517  Mrad2831_6426  integrase catalytic region  87.34 
 
 		 906 bp  77.8  0.00000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010518  Mrad2831_6463  integrase catalytic region  87.34 
 
 		 906 bp  77.8  0.00000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  0.666389 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3544    88.73 
 
 		 802 bp  77.8  0.00000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1445    84.31 
 
 		 324 bp  75.8  0.00000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5122  integrase catalytic subunit  92.31 
 
 		 849 bp  71.9  0.0000000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.184507 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5725  integrase catalytic region  82.76 
 
 		 912 bp  71.9  0.0000000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5204  integrase catalytic subunit  92.31 
 
 		 849 bp  71.9  0.0000000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.184454  normal  0.989225 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1015    87.14 
 
 		 351 bp  67.9  0.00000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000847594  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3846  integrase catalytic subunit  83.33 
 
 		 906 bp  67.9  0.00000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.386301 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5555  integrase catalytic region  87.88 
 
 		 855 bp  67.9  0.00000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.884215 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5344  integrase catalytic region  87.88 
 
 		 855 bp  67.9  0.00000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.438366  normal  0.0855179 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5064  integrase catalytic region  87.88 
 
 		 855 bp  67.9  0.00000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4441  integrase catalytic region  87.88 
 
 		 855 bp  67.9  0.00000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1896  ISMca3, transposase, OrfB  93.18 
 
 		 849 bp  63.9  0.0000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0735  ISMca3, transposase, OrfB  93.18 
 
 		 849 bp  63.9  0.0000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.990065  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2820  Integrase catalytic region  91.67 
 
 		 915 bp  63.9  0.0000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0008  Integrase catalytic region  81.51 
 
 		 858 bp  61.9  0.0000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.230626  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1826  Integrase catalytic region  81.51 
 
 		 858 bp  61.9  0.0000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.456922  normal  0.0211966 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3736  integrase catalytic region  89.09 
 
 		 906 bp  61.9  0.0000008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3705  integrase catalytic region  89.09 
 
 		 906 bp  61.9  0.0000008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0740  Integrase catalytic region  81.51 
 
 		 858 bp  61.9  0.0000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0332591  normal  0.114218 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12381  transposase  82.52 
 
 		 885 bp  61.9  0.0000008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  1.55066e-37  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2687    91.49 
 
 		 267 bp  61.9  0.0000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13206  transposase  82.52 
 
 		 885 bp  61.9  0.0000008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  2.3114300000000003e-18  normal  0.570802 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6067  transposase catalytic site ISRme15  81.51 
 
 		 858 bp  61.9  0.0000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.415785 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6152    82.93 
 
 		 249 bp  61.9  0.0000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.897664 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5541  transposase catalytic site ISRme15  81.51 
 
 		 858 bp  61.9  0.0000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2222  integrase catalytic subunit  91.49 
 
 		 837 bp  61.9  0.0000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.21419  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10852  transposase  82.52 
 
 		 885 bp  61.9  0.0000008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  5.901690000000001e-44  decreased coverage  0.0000000161998 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11348  transposase  82.52 
 
 		 837 bp  61.9  0.0000008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  4.0645000000000005e-27  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11738    82.52 
 
 		 1775 bp  61.9  0.0000008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  6.28559e-27  normal  0.52056 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11739  transposase  82.52 
 
 		 885 bp  61.9  0.0000008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  3.46568e-46  normal  0.519629 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11773  transposase  82.52 
 
 		 885 bp  61.9  0.0000008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  1.63075e-23  hitchhiker  0.0000000024473 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11780  transposase  82.52 
 
 		 885 bp  61.9  0.0000008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  8.89938e-72  hitchhiker  0.00000000193173 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11785  transposase  82.52 
 
 		 885 bp  61.9  0.0000008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  6.8775e-79  hitchhiker  0.0000000184324 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11792  transposase  82.52 
 
 		 885 bp  61.9  0.0000008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  3.87208e-50  hitchhiker  0.00000308071 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11806  transposase  82.52 
 
 		 885 bp  61.9  0.0000008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  2.55346e-33  hitchhiker  0.00499729 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12047    82.52 
 
 		 2615 bp  61.9  0.0000008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0256543  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12048  transposase  82.52 
 
 		 885 bp  61.9  0.0000008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  1.2114e-18  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12114  hypothetical protein  82.52 
 
 		 885 bp  61.9  0.0000008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  6.76426e-46  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12378  transposase  82.52 
 
 		 885 bp  61.9  0.0000008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  2.6977900000000003e-18  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12415    82.52 
 
 		 1916 bp  61.9  0.0000008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000185069  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12416  transposase  82.52 
 
 		 885 bp  61.9  0.0000008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  1.46754e-28  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12828  transposase  82.52 
 
 		 885 bp  61.9  0.0000008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  1.44608e-31  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13130    82.52 
 
 		 2027 bp  61.9  0.0000008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.000997502  normal  0.0691909 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13132  transposase  82.52 
 
 		 885 bp  61.9  0.0000008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000174572  normal  0.138383 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13357  transposase  82.52 
 
 		 885 bp  61.9  0.0000008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  3.77516e-37  normal  0.294919 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2457    100 
 
 		 893 bp  60  0.000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4855  hypothetical protein  97.06 
 
 		 498 bp  60  0.000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20940    94.74 
 
 		 243 bp  60  0.000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.114124  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2845    100 
 
 		 965 bp  60  0.000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.133213 
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9898  transposase  80.29 
 
 		 906 bp  58  0.00001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4953  integrase catalytic region  84.42 
 
 		 852 bp  58  0.00001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9838  transposase  80.29 
 
 		 906 bp  58  0.00001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2977  Tn4652, transposase subunit B  87.5 
 
 		 906 bp  56  0.00005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0471013 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0907  integrase catalytic subunit  90.91 
 
 		 915 bp  56  0.00005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3906    90.91 
 
 		 912 bp  56  0.00005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.414091  normal  0.612395 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1815  hypothetical protein  85.29 
 
 		 309 bp  56  0.00005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3255  Integrase catalytic region  90.91 
 
 		 852 bp  56  0.00005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1295    83.54 
 
 		 279 bp  54  0.0002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3384  hypothetical protein  83.54 
 
 		 345 bp  54  0.0002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2492    87.27 
 
 		 565 bp  54  0.0002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.552533  normal  0.0258476 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3563    81.31 
 
 		 943 bp  54  0.0002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.452743  normal  0.133184 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0133  transposase subunit; putative  94.12 
 
 		 207 bp  52  0.0008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3288  Integrase catalytic region  96.67 
 
 		 963 bp  52  0.0008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2455  hypothetical protein  100 
 
 		 1047 bp  50.1  0.003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.927217  decreased coverage  0.005432 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1426  Integrase catalytic region  90.24 
 
 		 915 bp  50.1  0.003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0450418  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3929    90.24 
 
 		 216 bp  50.1  0.003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1501  Integrase catalytic region  90.24 
 
 		 969 bp  50.1  0.003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>