57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_1445 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_1445    100 
 
 		 324 bp  642    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6731    86.43 
 
 		 2015 bp  234  1e-59  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.144839 
 
 
-
 
NC_010518  Mrad2831_6463  integrase catalytic region  84.09 
 
 		 906 bp  190  2e-46  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  0.666389 
 
 
-
 
NC_010517  Mrad2831_6426  integrase catalytic region  84.09 
 
 		 906 bp  190  2e-46  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2687    85.87 
 
 		 267 bp  159  6e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1572  integrase, catalytic region  83.72 
 
 		 906 bp  149  6e-34  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2120  integrase, catalytic region  83.72 
 
 		 906 bp  149  6e-34  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.824405  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3162  integrase catalytic subunit  83.17 
 
 		 906 bp  135  7.999999999999999e-30  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.116464  normal  0.334205 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4212  integrase catalytic subunit  83.01 
 
 		 906 bp  131  1.0000000000000001e-28  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.955324  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0760  integrase catalytic subunit  82.84 
 
 		 735 bp  127  2e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3544    83.33 
 
 		 802 bp  123  3e-26  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6829    83.43 
 
 		 255 bp  121  9.999999999999999e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3929    83.15 
 
 		 216 bp  119  5e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9898  transposase  82.95 
 
 		 906 bp  111  1e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9838  transposase  82.95 
 
 		 906 bp  111  1e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1295    90.59 
 
 		 279 bp  105  8e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7785  integrase catalytic region  82.96 
 
 		 135 bp  85.7  0.000000000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  hitchhiker  0.00395813  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2709  integrase catalytic subunit  91.94 
 
 		 900 bp  83.8  0.00000000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2937  integrase catalytic subunit  91.94 
 
 		 900 bp  83.8  0.00000000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.529853  normal  0.799386 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2741  Integrase catalytic region  89.04 
 
 		 450 bp  81.8  0.0000000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0894729  normal  0.05514 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2513  Integrase catalytic region  89.04 
 
 		 906 bp  81.8  0.0000000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.298059 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1663  Integrase catalytic region  89.04 
 
 		 906 bp  81.8  0.0000000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1636    89.04 
 
 		 906 bp  81.8  0.0000000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.138484  normal  0.363265 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1597  Integrase catalytic region  89.04 
 
 		 906 bp  81.8  0.0000000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.369801  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2043    84.31 
 
 		 2389 bp  75.8  0.000000000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.153153  hitchhiker  0.00767267 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3483  Integrase catalytic region  84.31 
 
 		 906 bp  75.8  0.000000000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00971742  hitchhiker  0.00375901 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2528  Integrase catalytic region  84.31 
 
 		 906 bp  75.8  0.000000000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000000564647  hitchhiker  0.00383779 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3608  Integrase catalytic region  84.31 
 
 		 906 bp  75.8  0.000000000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0251528  normal  0.0493713 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02392  ISPsy21, transposase OrfB  90.16 
 
 		 774 bp  73.8  0.00000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.406166  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3563    87.67 
 
 		 943 bp  73.8  0.00000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.452743  normal  0.133184 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1753  Integrase catalytic region  87.67 
 
 		 906 bp  73.8  0.00000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.289897  normal  0.869594 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1895    84.38 
 
 		 162 bp  71.9  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.912531  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3846  integrase catalytic subunit  80.12 
 
 		 906 bp  67.9  0.000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.386301 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1236  Integrase catalytic region  83.33 
 
 		 876 bp  67.9  0.000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.305005 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3384  hypothetical protein  82.3 
 
 		 345 bp  65.9  0.000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7786  hypothetical protein  100 
 
 		 324 bp  61.9  0.0000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.0016591  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1287  hypothetical protein  83.16 
 
 		 189 bp  61.9  0.0000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.868264  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01694  TnpB  84.42 
 
 		 300 bp  58  0.000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0008  Integrase catalytic region  88.24 
 
 		 858 bp  54  0.00002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.230626  normal  1 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6067  transposase catalytic site ISRme15  88.24 
 
 		 858 bp  54  0.00002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.415785 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5541  transposase catalytic site ISRme15  88.24 
 
 		 858 bp  54  0.00002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0740  Integrase catalytic region  88.24 
 
 		 858 bp  54  0.00002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0332591  normal  0.114218 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5392    89.36 
 
 		 124 bp  54  0.00002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.619468  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5204  integrase catalytic subunit  94.29 
 
 		 849 bp  54  0.00002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.184454  normal  0.989225 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1826  Integrase catalytic region  88.24 
 
 		 858 bp  54  0.00002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.456922  normal  0.0211966 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5122  integrase catalytic subunit  94.29 
 
 		 849 bp  54  0.00002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.184507 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0539  transposase  81.91 
 
 		 300 bp  52  0.0001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4441  integrase catalytic region  90.48 
 
 		 855 bp  52  0.0001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5064  integrase catalytic region  90.48 
 
 		 855 bp  52  0.0001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5344  integrase catalytic region  90.48 
 
 		 855 bp  52  0.0001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.438366  normal  0.0855179 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5555  integrase catalytic region  90.48 
 
 		 855 bp  52  0.0001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.884215 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0854  hypothetical protein  84.62 
 
 		 135 bp  50.1  0.0004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1703    91.67 
 
 		 641 bp  48.1  0.002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1015    96.43 
 
 		 351 bp  48.1  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000847594  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0907  integrase catalytic subunit  91.67 
 
 		 915 bp  48.1  0.002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2820  Integrase catalytic region  91.67 
 
 		 915 bp  48.1  0.002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2262  TatD-related deoxyribonuclease  96.3 
 
 		 828 bp  46.1  0.006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.225639  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>