78 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_7786 on replicon NC_011887
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011887  Mnod_7786  hypothetical protein  100 
 
 		 107 aa  213  5e-55  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.0016591  n/a   
 
 
-
 
NC_010518  Mrad2831_6463  integrase catalytic region  70.42 
 
 		 301 aa  94.7  4e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  0.666389 
 
 
-
 
NC_010517  Mrad2831_6426  integrase catalytic region  70.42 
 
 		 301 aa  94.7  4e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4707  hypothetical protein  77.59 
 
 		 102 aa  90.1  9e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02252  ISPsy21, transposase OrfB  65.52 
 
 		 228 aa  80.1  0.00000000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03920  ISPsy21, transposase OrfB  63.79 
 
 		 170 aa  78.6  0.00000000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.67034  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02392  ISPsy21, transposase OrfB  63.79 
 
 		 257 aa  78.6  0.00000000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.406166  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4212  integrase catalytic subunit  58.62 
 
 		 301 aa  73.2  0.000000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.955324  n/a   
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9898  transposase  52.11 
 
 		 301 aa  69.3  0.00000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9838  transposase  52.11 
 
 		 301 aa  69.3  0.00000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3162  integrase catalytic subunit  55.17 
 
 		 301 aa  67  0.00000000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.116464  normal  0.334205 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3846  integrase catalytic subunit  53.52 
 
 		 301 aa  67  0.00000000009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.386301 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2120  integrase, catalytic region  56.9 
 
 		 301 aa  65.5  0.0000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.824405  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1572  integrase, catalytic region  56.9 
 
 		 301 aa  65.5  0.0000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2709  integrase catalytic subunit  53.45 
 
 		 299 aa  65.5  0.0000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2937  integrase catalytic subunit  53.45 
 
 		 299 aa  65.5  0.0000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.529853  normal  0.799386 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3476  hypothetical protein  55.17 
 
 		 218 aa  63.5  0.0000000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.184573 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1630  hypothetical protein  54.9 
 
 		 68 aa  58.2  0.00000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.334739 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3736  integrase catalytic region  50.91 
 
 		 301 aa  57  0.00000008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3705  integrase catalytic region  50.91 
 
 		 301 aa  57  0.00000008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1426  Integrase catalytic region  51.85 
 
 		 304 aa  55.8  0.0000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0450418  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1795  transposase  35.45 
 
 		 125 aa  54.3  0.0000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.246406  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5725  integrase catalytic region  50 
 
 		 303 aa  53.1  0.000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2820  Integrase catalytic region  50 
 
 		 304 aa  53.1  0.000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1141  integrase catalytic region  50 
 
 		 183 aa  52  0.000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.555646  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1286  hypothetical protein  61.11 
 
 		 185 aa  51.6  0.000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.350643  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0907  integrase catalytic subunit  48.15 
 
 		 304 aa  51.2  0.000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3889  hypothetical protein  34.34 
 
 		 134 aa  48.5  0.00003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2843  IS629, transposase orfB  45.28 
 
 		 296 aa  47.8  0.00005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.69714 
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0297  IS629 transposase orfB  45.28 
 
 		 296 aa  47.8  0.00005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000478745  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2789  IS629, transposase orfB  45.28 
 
 		 296 aa  47.8  0.00005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.194228  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2932  IS629, transposase orfB  45.28 
 
 		 296 aa  47.8  0.00005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.529947  hitchhiker  0.00000000000000217145 
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0041  IS629, transposase orfB  45.28 
 
 		 295 aa  47.8  0.00005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0291  IS629, transposase orfB  45.28 
 
 		 296 aa  47.8  0.00005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.638063 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1170  IS629, transposase orfB  45.28 
 
 		 296 aa  47.8  0.00005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.728097  normal  0.563398 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1178  IS629, transposase orfB  45.28 
 
 		 296 aa  47.8  0.00005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1657  IS629, transposase orfB  45.28 
 
 		 296 aa  47.8  0.00005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.000000216946  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2286  IS629, transposase orfB  45.28 
 
 		 296 aa  47.8  0.00005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.292769  hitchhiker  5.1383e-16 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2492  IS629, transposase orfB  45.28 
 
 		 295 aa  47.8  0.00005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0208  IS629 transposase orfB  45.28 
 
 		 296 aa  47.8  0.00005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3232  IS629, transposase orfB  45.28 
 
 		 296 aa  47.8  0.00005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.312429  hitchhiker  0.000944743 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3386  IS629, transposase orfB  45.28 
 
 		 296 aa  47.8  0.00005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3516  IS629, transposase orfB  45.28 
 
 		 296 aa  47.8  0.00005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0367503 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3874  IS629, transposase orfB  45.28 
 
 		 296 aa  47.8  0.00005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.816642 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4591  IS629, transposase orfB  45.28 
 
 		 296 aa  47.8  0.00005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.987029  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1240  IS1203 transposase orfB  45.28 
 
 		 296 aa  47.8  0.00005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.605  n/a   
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0102  IS629 transposase orfB  45.28 
 
 		 295 aa  47.8  0.00005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0471323  hitchhiker  0.000157883 
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0221  IS629 transposase orfB  45.28 
 
 		 296 aa  47.8  0.00005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4771  IS1203 transposase orfB  45.28 
 
 		 296 aa  47.8  0.00005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.220432  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4791  IS1203 transposase orfB  45.28 
 
 		 296 aa  47.8  0.00005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.2388 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1664  IS1203 transposase orfB  45.28 
 
 		 296 aa  47.8  0.00006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0102  IS629, transposase orfB  45.28 
 
 		 295 aa  47.4  0.00007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.147873  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2680  IS629, transposase orfB  45.28 
 
 		 295 aa  47.4  0.00007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00648038  normal  0.0200158 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1379  IS629, transposase orfB  45.28 
 
 		 295 aa  47.4  0.00007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.822294  normal  0.0945096 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1303  IS629, transposase orfB  45.28 
 
 		 295 aa  47.4  0.00007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0035  IS629, transposase orfB  45.28 
 
 		 295 aa  47.4  0.00007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4441  integrase catalytic region  42.47 
 
 		 284 aa  47  0.00008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5064  integrase catalytic region  42.47 
 
 		 284 aa  47  0.00008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5344  integrase catalytic region  42.47 
 
 		 284 aa  47  0.00008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.438366  normal  0.0855179 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5555  integrase catalytic region  42.47 
 
 		 284 aa  47  0.00008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.884215 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2665  transposase  45.28 
 
 		 229 aa  47  0.00008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000236219 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1896  ISMca3, transposase, OrfB  55.56 
 
 		 282 aa  46.6  0.0001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0247  IS629 transposase orfB  45.28 
 
 		 296 aa  46.6  0.0001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.45525  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0231  IS1203 transposase orfB  45.28 
 
 		 296 aa  46.6  0.0001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0117658  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0134  IS629 transposase orfB  45.28 
 
 		 296 aa  46.6  0.0001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4763  IS1203 transposase orfB  45.28 
 
 		 296 aa  46.6  0.0001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4642  IS629 transposase orfB  45.28 
 
 		 296 aa  46.6  0.0001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.835933  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1924  IS629 transposase orfB  45.28 
 
 		 296 aa  46.6  0.0001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.454462  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1592  IS629 transposase orfB  45.28 
 
 		 296 aa  46.6  0.0001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0988  IS629 transposase orfB  45.28 
 
 		 296 aa  46.6  0.0001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2258  IS629 transposase orfB  45.28 
 
 		 296 aa  46.6  0.0001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0735  ISMca3, transposase, OrfB  55.56 
 
 		 282 aa  46.6  0.0001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.990065  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2528  Integrase catalytic region  38.18 
 
 		 301 aa  41.2  0.005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000000564647  hitchhiker  0.00383779 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3483  Integrase catalytic region  38.18 
 
 		 301 aa  41.2  0.005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00971742  hitchhiker  0.00375901 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3608  Integrase catalytic region  38.18 
 
 		 301 aa  41.2  0.005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0251528  normal  0.0493713 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5204  integrase catalytic subunit  40.62 
 
 		 282 aa  40.8  0.007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.184454  normal  0.989225 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5122  integrase catalytic subunit  40.62 
 
 		 282 aa  40.8  0.007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.184507 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1216  Integrase catalytic region  46.03 
 
 		 311 aa  40  0.01  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>