More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic_1141 on replicon NC_010682
Organism: Ralstonia pickettii 12J



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010682  Rpic_1141  integrase catalytic region  100 
 
 		 183 aa  375  1e-103  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.555646  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5725  integrase catalytic region  94.77 
 
 		 303 aa  340  9e-93  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2820  Integrase catalytic region  77.33 
 
 		 304 aa  281  3.0000000000000004e-75  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0907  integrase catalytic subunit  76.74 
 
 		 304 aa  281  5.000000000000001e-75  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1426  Integrase catalytic region  76.74 
 
 		 304 aa  277  6e-74  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0450418  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5122  integrase catalytic subunit  80.92 
 
 		 282 aa  253  9e-67  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.184507 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5204  integrase catalytic subunit  80.92 
 
 		 282 aa  253  9e-67  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.184454  normal  0.989225 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3255  Integrase catalytic region  78.29 
 
 		 283 aa  249  2e-65  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0735  ISMca3, transposase, OrfB  78.95 
 
 		 282 aa  247  5e-65  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.990065  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1896  ISMca3, transposase, OrfB  78.95 
 
 		 282 aa  247  5e-65  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02392  ISPsy21, transposase OrfB  67.44 
 
 		 257 aa  240  7e-63  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.406166  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5555  integrase catalytic region  76.97 
 
 		 284 aa  237  6.999999999999999e-62  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.884215 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5064  integrase catalytic region  76.97 
 
 		 284 aa  237  6.999999999999999e-62  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4441  integrase catalytic region  76.97 
 
 		 284 aa  237  6.999999999999999e-62  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5344  integrase catalytic region  76.97 
 
 		 284 aa  237  6.999999999999999e-62  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.438366  normal  0.0855179 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02252  ISPsy21, transposase OrfB  66.28 
 
 		 228 aa  236  1e-61  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4953  integrase catalytic region  78.29 
 
 		 283 aa  235  3e-61  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010518  Mrad2831_6463  integrase catalytic region  63.91 
 
 		 301 aa  219  1.9999999999999999e-56  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  0.666389 
 
 
-
 
NC_010517  Mrad2831_6426  integrase catalytic region  63.91 
 
 		 301 aa  219  1.9999999999999999e-56  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2709  integrase catalytic subunit  63.37 
 
 		 299 aa  218  6e-56  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2937  integrase catalytic subunit  63.37 
 
 		 299 aa  218  6e-56  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.529853  normal  0.799386 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3846  integrase catalytic subunit  60.36 
 
 		 301 aa  216  2e-55  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.386301 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3736  integrase catalytic region  61.05 
 
 		 301 aa  214  7e-55  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3705  integrase catalytic region  61.05 
 
 		 301 aa  214  7e-55  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1572  integrase, catalytic region  61.68 
 
 		 301 aa  211  5.999999999999999e-54  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2120  integrase, catalytic region  61.68 
 
 		 301 aa  211  5.999999999999999e-54  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.824405  normal  1 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6067  transposase catalytic site ISRme15  67.97 
 
 		 285 aa  208  3e-53  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.415785 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0008  Integrase catalytic region  67.97 
 
 		 285 aa  208  3e-53  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.230626  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1826  Integrase catalytic region  67.97 
 
 		 285 aa  208  3e-53  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.456922  normal  0.0211966 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5541  transposase catalytic site ISRme15  67.97 
 
 		 285 aa  208  3e-53  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0740  Integrase catalytic region  67.97 
 
 		 285 aa  208  3e-53  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0332591  normal  0.114218 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3162  integrase catalytic subunit  57.4 
 
 		 301 aa  207  1e-52  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.116464  normal  0.334205 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03920  ISPsy21, transposase OrfB  66 
 
 		 170 aa  205  3e-52  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.67034  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1286  hypothetical protein  63.91 
 
 		 185 aa  200  7e-51  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.350643  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2977  Tn4652, transposase subunit B  60.71 
 
 		 301 aa  198  3e-50  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0471013 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4212  integrase catalytic subunit  56.8 
 
 		 301 aa  198  3e-50  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.955324  n/a   
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9838  transposase  56.21 
 
 		 301 aa  197  7e-50  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9898  transposase  56.21 
 
 		 301 aa  197  7e-50  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3476  hypothetical protein  55.03 
 
 		 218 aa  193  1e-48  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.184573 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1240  IS1203 transposase orfB  58.72 
 
 		 296 aa  192  3e-48  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.605  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0297  IS629 transposase orfB  58.72 
 
 		 296 aa  192  3e-48  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000478745  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0208  IS629 transposase orfB  58.72 
 
 		 296 aa  192  3e-48  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0221  IS629 transposase orfB  58.72 
 
 		 296 aa  192  3e-48  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2258  IS629 transposase orfB  58.72 
 
 		 296 aa  192  3e-48  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0247  IS629 transposase orfB  59.3 
 
 		 296 aa  191  4e-48  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.45525  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4763  IS1203 transposase orfB  58.72 
 
 		 296 aa  191  4e-48  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0231  IS1203 transposase orfB  59.3 
 
 		 296 aa  191  4e-48  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0117658  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0134  IS629 transposase orfB  59.3 
 
 		 296 aa  191  4e-48  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4642  IS629 transposase orfB  58.72 
 
 		 296 aa  191  4e-48  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.835933  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1592  IS629 transposase orfB  59.3 
 
 		 296 aa  191  4e-48  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0988  IS629 transposase orfB  59.3 
 
 		 296 aa  191  4e-48  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1924  IS629 transposase orfB  59.3 
 
 		 296 aa  191  4e-48  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.454462  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4791  IS1203 transposase orfB  58.14 
 
 		 296 aa  191  5e-48  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.2388 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4771  IS1203 transposase orfB  58.72 
 
 		 296 aa  191  6e-48  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.220432  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0291  IS629, transposase orfB  58.72 
 
 		 296 aa  191  6e-48  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.638063 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1170  IS629, transposase orfB  58.72 
 
 		 296 aa  191  6e-48  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.728097  normal  0.563398 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1178  IS629, transposase orfB  58.72 
 
 		 296 aa  191  6e-48  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2789  IS629, transposase orfB  58.72 
 
 		 296 aa  191  6e-48  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.194228  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1657  IS629, transposase orfB  58.72 
 
 		 296 aa  191  6e-48  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.000000216946  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3386  IS629, transposase orfB  58.72 
 
 		 296 aa  191  6e-48  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3516  IS629, transposase orfB  58.72 
 
 		 296 aa  191  6e-48  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0367503 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3874  IS629, transposase orfB  58.72 
 
 		 296 aa  191  6e-48  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.816642 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4591  IS629, transposase orfB  58.72 
 
 		 296 aa  191  6e-48  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.987029  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2286  IS629, transposase orfB  58.72 
 
 		 296 aa  191  6e-48  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.292769  hitchhiker  5.1383e-16 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2843  IS629, transposase orfB  58.72 
 
 		 296 aa  191  6e-48  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.69714 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3232  IS629, transposase orfB  58.72 
 
 		 296 aa  191  6e-48  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.312429  hitchhiker  0.000944743 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2932  IS629, transposase orfB  58.72 
 
 		 296 aa  191  6e-48  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.529947  hitchhiker  0.00000000000000217145 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2680  IS629, transposase orfB  59.52 
 
 		 295 aa  190  8e-48  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00648038  normal  0.0200158 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1303  IS629, transposase orfB  59.52 
 
 		 295 aa  190  8e-48  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1379  IS629, transposase orfB  59.52 
 
 		 295 aa  190  8e-48  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.822294  normal  0.0945096 
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0102  IS629, transposase orfB  58.93 
 
 		 295 aa  190  1e-47  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.147873  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1664  IS1203 transposase orfB  58.14 
 
 		 296 aa  190  1e-47  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0035  IS629, transposase orfB  58.93 
 
 		 295 aa  189  2e-47  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2665  transposase  58.93 
 
 		 229 aa  189  2e-47  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000236219 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1663  Integrase catalytic region  57.4 
 
 		 301 aa  186  2e-46  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0041  IS629, transposase orfB  58.93 
 
 		 295 aa  186  2e-46  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1753  Integrase catalytic region  57.4 
 
 		 301 aa  186  2e-46  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.289897  normal  0.869594 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1597  Integrase catalytic region  57.4 
 
 		 301 aa  186  2e-46  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.369801  normal  1 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0102  IS629 transposase orfB  58.93 
 
 		 295 aa  185  2e-46  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0471323  hitchhiker  0.000157883 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2513  Integrase catalytic region  57.4 
 
 		 301 aa  185  2e-46  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.298059 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2492  IS629, transposase orfB  58.33 
 
 		 295 aa  185  2e-46  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1216  Integrase catalytic region  54.49 
 
 		 311 aa  184  6e-46  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3483  Integrase catalytic region  57.14 
 
 		 301 aa  172  1.9999999999999998e-42  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00971742  hitchhiker  0.00375901 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2528  Integrase catalytic region  57.14 
 
 		 301 aa  172  1.9999999999999998e-42  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000000564647  hitchhiker  0.00383779 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3608  Integrase catalytic region  57.14 
 
 		 301 aa  172  1.9999999999999998e-42  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0251528  normal  0.0493713 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2222  integrase catalytic subunit  57.24 
 
 		 278 aa  164  5.9999999999999996e-40  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.21419  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12048  transposase  54.82 
 
 		 294 aa  162  3e-39  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  1.2114e-18  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11785  transposase  54.82 
 
 		 294 aa  162  3e-39  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  6.8775e-79  hitchhiker  0.0000000184324 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11806  transposase  54.82 
 
 		 294 aa  162  3e-39  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  2.55346e-33  hitchhiker  0.00499729 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11739  transposase  54.82 
 
 		 294 aa  162  3e-39  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  3.46568e-46  normal  0.519629 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10852  transposase  54.82 
 
 		 294 aa  162  3e-39  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  5.901690000000001e-44  decreased coverage  0.0000000161998 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11792  transposase  54.82 
 
 		 294 aa  162  3e-39  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  3.87208e-50  hitchhiker  0.00000308071 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12114  hypothetical protein  54.82 
 
 		 294 aa  162  3e-39  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  6.76426e-46  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12378  transposase  54.82 
 
 		 294 aa  162  3e-39  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  2.6977900000000003e-18  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12381  transposase  54.82 
 
 		 294 aa  162  3e-39  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  1.55066e-37  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12828  transposase  54.82 
 
 		 294 aa  162  3e-39  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  1.44608e-31  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13206  transposase  54.82 
 
 		 294 aa  162  3e-39  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  2.3114300000000003e-18  normal  0.570802 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13132  transposase  54.82 
 
 		 294 aa  162  3e-39  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000174572  normal  0.138383 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12416  transposase  54.82 
 
 		 294 aa  162  3e-39  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  1.46754e-28  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13357  transposase  54.82 
 
 		 294 aa  162  3e-39  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  3.77516e-37  normal  0.294919 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>