86 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_2687 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_2687    100 
 
 		 267 bp  529  1e-148  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010518  Mrad2831_6463  integrase catalytic region  85.51 
 
 		 906 bp  178  5e-43  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  0.666389 
 
 
-
 
NC_010517  Mrad2831_6426  integrase catalytic region  85.51 
 
 		 906 bp  178  5e-43  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3929    84.8 
 
 		 216 bp  159  5.0000000000000005e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1445    85.87 
 
 		 324 bp  159  5.0000000000000005e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7785  integrase catalytic region  88.1 
 
 		 135 bp  131  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  hitchhiker  0.00395813  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6731    88 
 
 		 2015 bp  129  4.0000000000000003e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.144839 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6829    83.51 
 
 		 255 bp  115  6e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3162  integrase catalytic subunit  84.29 
 
 		 906 bp  103  2e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.116464  normal  0.334205 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3544    87.04 
 
 		 802 bp  103  2e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3563    83.8 
 
 		 943 bp  99.6  4e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.452743  normal  0.133184 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5037  Integrase catalytic region  94.83 
 
 		 825 bp  91.7  9e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1295    93.44 
 
 		 279 bp  89.7  4e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0760  integrase catalytic subunit  84.48 
 
 		 735 bp  87.7  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1572  integrase, catalytic region  83.2 
 
 		 906 bp  81.8  0.00000000000009  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2120  integrase, catalytic region  83.2 
 
 		 906 bp  81.8  0.00000000000009  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.824405  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3946    95.74 
 
 		 314 bp  77.8  0.000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3846  integrase catalytic subunit  82.54 
 
 		 906 bp  75.8  0.000000000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.386301 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2709  integrase catalytic subunit  94 
 
 		 900 bp  75.8  0.000000000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2937  integrase catalytic subunit  94 
 
 		 900 bp  75.8  0.000000000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.529853  normal  0.799386 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4212  integrase catalytic subunit  83.64 
 
 		 906 bp  75.8  0.000000000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.955324  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4022  Integrase catalytic region  95.65 
 
 		 993 bp  75.8  0.000000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.500717  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02392  ISPsy21, transposase OrfB  95.35 
 
 		 774 bp  69.9  0.0000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.406166  n/a   
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9898  transposase  81.97 
 
 		 906 bp  67.9  0.000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7791  Integrase catalytic region  89.66 
 
 		 972 bp  67.9  0.000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.562755  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8690  putative integrase  89.66 
 
 		 474 bp  67.9  0.000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9838  transposase  81.97 
 
 		 906 bp  67.9  0.000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7786  hypothetical protein  97.37 
 
 		 324 bp  67.9  0.000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.0016591  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5392    91.67 
 
 		 124 bp  63.9  0.00000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.619468  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5122  integrase catalytic subunit  91.67 
 
 		 849 bp  63.9  0.00000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.184507 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5204  integrase catalytic subunit  91.67 
 
 		 849 bp  63.9  0.00000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.184454  normal  0.989225 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01694  TnpB  93.18 
 
 		 300 bp  63.9  0.00000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3608  Integrase catalytic region  91.49 
 
 		 906 bp  61.9  0.00000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0251528  normal  0.0493713 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2043    91.49 
 
 		 2389 bp  61.9  0.00000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.153153  hitchhiker  0.00767267 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2528  Integrase catalytic region  91.49 
 
 		 906 bp  61.9  0.00000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000000564647  hitchhiker  0.00383779 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3483  Integrase catalytic region  91.49 
 
 		 906 bp  61.9  0.00000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00971742  hitchhiker  0.00375901 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2741  Integrase catalytic region  92.68 
 
 		 450 bp  58  0.000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0894729  normal  0.05514 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2513  Integrase catalytic region  92.68 
 
 		 906 bp  58  0.000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.298059 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1663  Integrase catalytic region  92.68 
 
 		 906 bp  58  0.000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1636    92.68 
 
 		 906 bp  58  0.000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.138484  normal  0.363265 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1597  Integrase catalytic region  92.68 
 
 		 906 bp  58  0.000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.369801  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1895    92.68 
 
 		 162 bp  58  0.000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.912531  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1287  hypothetical protein  82.47 
 
 		 189 bp  58  0.000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.868264  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0740  Integrase catalytic region  89.58 
 
 		 858 bp  56  0.000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0332591  normal  0.114218 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1236  Integrase catalytic region  90.91 
 
 		 876 bp  56  0.000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.305005 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3384  hypothetical protein  81.25 
 
 		 345 bp  56  0.000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1826  Integrase catalytic region  89.58 
 
 		 858 bp  56  0.000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.456922  normal  0.0211966 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6067  transposase catalytic site ISRme15  89.58 
 
 		 858 bp  56  0.000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.415785 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5541  transposase catalytic site ISRme15  89.58 
 
 		 858 bp  56  0.000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0008  Integrase catalytic region  89.58 
 
 		 858 bp  56  0.000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.230626  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1216  Integrase catalytic region  90.7 
 
 		 936 bp  54  0.00002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1204  Integrase catalytic region  82.76 
 
 		 867 bp  54  0.00002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8546    83.54 
 
 		 96 bp  54  0.00002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.661978  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1608    85.71 
 
 		 916 bp  54  0.00002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0907  integrase catalytic subunit  90.24 
 
 		 915 bp  50.1  0.0003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3906    88.89 
 
 		 912 bp  50.1  0.0003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.414091  normal  0.612395 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3255  Integrase catalytic region  88.89 
 
 		 852 bp  50.1  0.0003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1753  Integrase catalytic region  90.24 
 
 		 906 bp  50.1  0.0003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.289897  normal  0.869594 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2820  Integrase catalytic region  90.24 
 
 		 915 bp  50.1  0.0003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1703    91.67 
 
 		 641 bp  48.1  0.001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2743    80.17 
 
 		 123 bp  48.1  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1426  Integrase catalytic region  91.67 
 
 		 915 bp  48.1  0.001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0450418  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11738    89.74 
 
 		 1775 bp  46.1  0.005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  6.28559e-27  normal  0.52056 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11739  transposase  89.74 
 
 		 885 bp  46.1  0.005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  3.46568e-46  normal  0.519629 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11773  transposase  89.74 
 
 		 885 bp  46.1  0.005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  1.63075e-23  hitchhiker  0.0000000024473 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11348  transposase  89.74 
 
 		 837 bp  46.1  0.005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  4.0645000000000005e-27  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10852  transposase  89.74 
 
 		 885 bp  46.1  0.005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  5.901690000000001e-44  decreased coverage  0.0000000161998 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0539  transposase  84.75 
 
 		 300 bp  46.1  0.005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11780  transposase  89.74 
 
 		 885 bp  46.1  0.005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  8.89938e-72  hitchhiker  0.00000000193173 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11785  transposase  89.74 
 
 		 885 bp  46.1  0.005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  6.8775e-79  hitchhiker  0.0000000184324 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12114  hypothetical protein  89.74 
 
 		 885 bp  46.1  0.005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  6.76426e-46  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11792  transposase  89.74 
 
 		 885 bp  46.1  0.005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  3.87208e-50  hitchhiker  0.00000308071 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11806  transposase  89.74 
 
 		 885 bp  46.1  0.005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  2.55346e-33  hitchhiker  0.00499729 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12047    89.74 
 
 		 2615 bp  46.1  0.005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0256543  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12048  transposase  89.74 
 
 		 885 bp  46.1  0.005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  1.2114e-18  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12378  transposase  89.74 
 
 		 885 bp  46.1  0.005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  2.6977900000000003e-18  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12381  transposase  89.74 
 
 		 885 bp  46.1  0.005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  1.55066e-37  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12415    89.74 
 
 		 1916 bp  46.1  0.005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000185069  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12416  transposase  89.74 
 
 		 885 bp  46.1  0.005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  1.46754e-28  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12828  transposase  89.74 
 
 		 885 bp  46.1  0.005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  1.44608e-31  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13130    89.74 
 
 		 2027 bp  46.1  0.005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.000997502  normal  0.0691909 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13132  transposase  89.74 
 
 		 885 bp  46.1  0.005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000174572  normal  0.138383 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13206  transposase  89.74 
 
 		 885 bp  46.1  0.005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  2.3114300000000003e-18  normal  0.570802 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13357  transposase  89.74 
 
 		 885 bp  46.1  0.005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  3.77516e-37  normal  0.294919 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01280  transposase  91.43 
 
 		 651 bp  46.1  0.005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0995831  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00518  transposase  91.43 
 
 		 651 bp  46.1  0.005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>