More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_5037 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011894  Mnod_5037  Integrase catalytic region  100 
 
 
274 aa  561  1.0000000000000001e-159  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7791  Integrase catalytic region  83.94 
 
 
323 aa  481  1e-135  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.562755  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4022  Integrase catalytic region  82.72 
 
 
330 aa  449  1e-125  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.500717  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0021  putative integrase  64.13 
 
 
332 aa  376  1e-103  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.468061 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0793  putative integrase  64.13 
 
 
343 aa  377  1e-103  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.638394 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8690  putative integrase  89.17 
 
 
157 aa  293  3e-78  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2660  integrase catalytic subunit  43.6 
 
 
323 aa  196  4.0000000000000005e-49  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.271661 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1401  integrase catalytic subunit  44.62 
 
 
323 aa  191  7e-48  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1424  integrase catalytic subunit  44.62 
 
 
323 aa  190  2e-47  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2535  integrase catalytic subunit  43.85 
 
 
323 aa  182  4.0000000000000006e-45  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.557756 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1631  Integrase catalytic region  41.89 
 
 
329 aa  181  1e-44  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3709  Integrase catalytic region  39.93 
 
 
325 aa  177  2e-43  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  normal  0.108327 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0344  Integrase catalytic region  39.93 
 
 
325 aa  177  2e-43  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000845152  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1251  integrase catalytic subunit  42.8 
 
 
333 aa  169  3e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.093017 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1301  integrase catalytic subunit  42.8 
 
 
321 aa  169  3e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.117909 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4152  transposase ISRme5 (copy d)  42.8 
 
 
321 aa  169  3e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.29962  normal  0.334182 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1280  integrase catalytic subunit  42.8 
 
 
463 aa  168  7e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.722165  normal  0.296416 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0120  hypothetical protein  38.33 
 
 
497 aa  159  4e-38  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2728  putative transposase  38.06 
 
 
441 aa  159  4e-38  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1378  putative integrase  38.06 
 
 
325 aa  159  5e-38  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00372186  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1782  putative integrase  38.06 
 
 
325 aa  159  5e-38  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2179  transposase  38.06 
 
 
325 aa  159  6e-38  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2194  putative transposase  38.06 
 
 
329 aa  159  6e-38  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2250  putative transposase  38.06 
 
 
333 aa  159  6e-38  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2493  transposase, putative  38.06 
 
 
325 aa  159  6e-38  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0917  transposase  38.06 
 
 
327 aa  159  7e-38  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3372  integrase catalytic region  34.84 
 
 
321 aa  152  5e-36  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1176  hypothetical protein  34.75 
 
 
284 aa  150  2e-35  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.118975 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2291  Integrase catalytic region  35.59 
 
 
348 aa  149  5e-35  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.152349 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0692  Integrase catalytic region  35.59 
 
 
330 aa  149  6e-35  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.229145  normal  0.133209 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3258  Integrase catalytic region  35.59 
 
 
330 aa  149  6e-35  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1668  Integrase catalytic region  35.59 
 
 
330 aa  149  6e-35  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.412192  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2721  Integrase catalytic region  35.59 
 
 
330 aa  149  6e-35  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.562875  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1875  Integrase catalytic region  35.62 
 
 
355 aa  149  6e-35  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0702445 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0952  hypothetical protein  32.87 
 
 
320 aa  148  1.0000000000000001e-34  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2422  Integrase catalytic region  35.25 
 
 
330 aa  147  2.0000000000000003e-34  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2917  integrase, catalytic region  33.91 
 
 
321 aa  147  2.0000000000000003e-34  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.437302 
 
 
-
 
NC_002978  WD0176  transposase, putative  32.01 
 
 
320 aa  143  3e-33  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25530  Integrase, catalytic domain-containing protein  34.32 
 
 
265 aa  143  3e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0224  integrase catalytic subunit  35.48 
 
 
316 aa  142  4e-33  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1054  integrase catalytic subunit  35.48 
 
 
316 aa  143  4e-33  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.161609  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1353  integrase catalytic subunit  35.48 
 
 
316 aa  143  4e-33  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.4232  normal  0.0729626 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1767  integrase catalytic subunit  35.48 
 
 
316 aa  142  4e-33  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.417793 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1780  integrase catalytic subunit  35.48 
 
 
316 aa  143  4e-33  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0228632  normal  0.851382 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2400  integrase catalytic subunit  35.48 
 
 
316 aa  143  4e-33  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.61618  normal  0.0278741 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0554  hypothetical protein  32.98 
 
 
314 aa  141  9.999999999999999e-33  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    unclonable  0.000000000279647 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1273  hypothetical protein  33.57 
 
 
314 aa  140  1.9999999999999998e-32  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0999856 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0366  integrase, catalytic region  32.65 
 
 
329 aa  139  7e-32  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.680873 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2225  integrase, catalytic region  32.65 
 
 
316 aa  139  7e-32  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  hitchhiker  0.00213091  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01280  transposase  43 
 
 
216 aa  139  7e-32  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0995831  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00518  transposase  43 
 
 
216 aa  139  7e-32  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0308  integrase, catalytic region  32.65 
 
 
316 aa  138  1e-31  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0481  integrase, catalytic region  32.65 
 
 
316 aa  138  1e-31  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.791017  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1097  integrase, catalytic region  32.65 
 
 
316 aa  138  1e-31  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.495543  normal  0.303219 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1293  integrase, catalytic region  32.65 
 
 
329 aa  137  1e-31  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.345302  normal  0.407109 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1296  integrase, catalytic region  32.65 
 
 
316 aa  138  1e-31  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1717  integrase, catalytic region  32.65 
 
 
316 aa  138  1e-31  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0171721  normal  0.307075 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2818  integrase, catalytic region  32.65 
 
 
316 aa  138  1e-31  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2899  integrase, catalytic region  32.65 
 
 
327 aa  137  1e-31  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.0219368 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2918  integrase, catalytic region  32.65 
 
 
316 aa  138  1e-31  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.423404 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1814  integrase catalytic subunit  33.45 
 
 
319 aa  136  3.0000000000000003e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0485004  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0053  integrase catalytic subunit  33.45 
 
 
319 aa  136  3.0000000000000003e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.142705  normal  0.776199 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3743  hypothetical protein  33.45 
 
 
319 aa  136  3.0000000000000003e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3839  hypothetical protein  33.45 
 
 
319 aa  136  3.0000000000000003e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.247548  normal  0.0595051 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0481  integrase catalytic region  32.78 
 
 
463 aa  135  8e-31  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2447  integrase catalytic subunit  48.51 
 
 
238 aa  125  6e-28  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7134  Integrase catalytic core  32.02 
 
 
303 aa  114  2.0000000000000002e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5447  Integrase catalytic region  32.79 
 
 
277 aa  111  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.681137  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2850  integrase, catalytic region  33.03 
 
 
329 aa  110  3e-23  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0838  integrase, catalytic region  33.03 
 
 
286 aa  109  4.0000000000000004e-23  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.204021  hitchhiker  0.00436144 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3474  hypothetical protein  33.5 
 
 
206 aa  105  7e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.180544 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0529  integrase, catalytic core  36.9 
 
 
259 aa  105  8e-22  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1371  Fis family transcriptional regulator  40.12 
 
 
179 aa  102  7e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0199142  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0122  integrase, catalytic region  33.81 
 
 
221 aa  100  2e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3295  integrase catalytic subunit  32.77 
 
 
316 aa  99.8  4e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.102565  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0801  integrase catalytic region  32.77 
 
 
316 aa  99.8  4e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5566  integrase catalytic region  32.77 
 
 
316 aa  100  4e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0200505  normal  0.0677233 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4870  integrase catalytic subunit  32.77 
 
 
316 aa  99.8  4e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6848  integrase catalytic subunit  32.77 
 
 
316 aa  99  8e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3960  Integrase catalytic region  31.01 
 
 
314 aa  97.8  2e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.382194  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0719  Integrase catalytic region  31.01 
 
 
314 aa  97.8  2e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.499878 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1887  Integrase catalytic region  31.01 
 
 
314 aa  97.8  2e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.282535 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0361  Integrase catalytic region  31.01 
 
 
314 aa  97.8  2e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1886  Integrase catalytic region  31.01 
 
 
314 aa  97.8  2e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.280908 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0754  integrase catalytic subunit  38.57 
 
 
315 aa  97.8  2e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.597244 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1515  integrase catalytic region  39.16 
 
 
178 aa  95.1  1e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.60322  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3736  transposase  28.47 
 
 
481 aa  95.1  1e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.455215  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6859  integrase catalytic region  31.42 
 
 
316 aa  94.4  2e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0984063  normal  0.439407 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0733  transposase, putative  37.28 
 
 
229 aa  92  9e-18  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1510  integrase catalytic subunit  32.59 
 
 
325 aa  90.5  2e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.201568  n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4313  integrase catalytic subunit  32.59 
 
 
309 aa  90.5  3e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0419733  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2557  integrase, catalytic region  34.34 
 
 
188 aa  90.1  4e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.805017  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0788  Integrase catalytic region  28.21 
 
 
347 aa  88.2  1e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3083  Integrase catalytic region  28.16 
 
 
330 aa  87.8  2e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00428734  hitchhiker  0.0000289484 
 
 
-
 
NC_004310  BR0513  ISBm3, transposase, programmed frameshift  31.14 
 
 
313 aa  87.8  2e-16  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3733  Integrase catalytic region  28.52 
 
 
330 aa  86.7  3e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0167687  normal  0.270652 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5264  Integrase catalytic region  28.16 
 
 
330 aa  86.7  3e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4853  Integrase catalytic region  28.16 
 
 
330 aa  86.7  4e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4847  Integrase catalytic region  30.07 
 
 
328 aa  86.7  4e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3394  integrase catalytic subunit  33.33 
 
 
315 aa  84.7  0.000000000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.164038 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>