12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_3946 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_3946    100 
 
 		 314 bp  622  1e-176  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4022  Integrase catalytic region  88.65 
 
 		 993 bp  153  3e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.500717  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7791  Integrase catalytic region  86.29 
 
 		 972 bp  111  1e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.562755  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8691    85.29 
 
 		 487 bp  111  1e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5037  Integrase catalytic region  92.5 
 
 		 825 bp  111  1e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1857    84.06 
 
 		 474 bp  99.6  4e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2687    95.74 
 
 		 267 bp  77.8  0.000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6851    82.01 
 
 		 676 bp  77.8  0.000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.57372  n/a   
 
 
-
 
NC_010373  M446_7029    82.11 
 
 		 183 bp  69.9  0.0000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  decreased coverage  0.000000656657  normal  0.0755622 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8690  putative integrase  88.71 
 
 		 474 bp  67.9  0.000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1965    81.6 
 
 		 548 bp  65.9  0.000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3240  hypothetical protein  96.55 
 
 		 321 bp  50.1  0.0004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>