169 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_6731 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_0582  integrase catalytic region  100 
 
 		 1401 bp  2777    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00633094 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1446  integrase catalytic region  100 
 
 		 1401 bp  2777    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1496  integrase catalytic region  100 
 
 		 1401 bp  2777    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1722    100 
 
 		 3771 bp  2888    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1723  integrase catalytic region  100 
 
 		 1401 bp  2777    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1915    99.93 
 
 		 1400 bp  2761    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.590164  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2519  integrase catalytic region  100 
 
 		 1446 bp  2714    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.352374  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2800    100 
 
 		 3468 bp  2886    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2801  integrase catalytic region  100 
 
 		 1401 bp  2777    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2900  integrase catalytic region  99.93 
 
 		 1401 bp  2769    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2930    99.93 
 
 		 1400 bp  2761    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.185436 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3368  integrase catalytic region  100 
 
 		 1401 bp  2777    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3807  integrase catalytic region  100 
 
 		 1401 bp  2777    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.123497  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4006  integrase catalytic region  100 
 
 		 1401 bp  2777    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4011  integrase catalytic region  100 
 
 		 1401 bp  2777    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5592  integrase catalytic region  100 
 
 		 1401 bp  2777    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6731    100 
 
 		 2015 bp  3994    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.144839 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6732  integrase catalytic region  100 
 
 		 1401 bp  2777    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.120235 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6913  integrase catalytic region  99.86 
 
 		 1401 bp  2761    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1445    86.43 
 
 		 324 bp  234  8e-59  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010518  Mrad2831_6463  integrase catalytic region  84.42 
 
 		 906 bp  206  1.9999999999999998e-50  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  0.666389 
 
 
-
 
NC_010517  Mrad2831_6426  integrase catalytic region  84.42 
 
 		 906 bp  206  1.9999999999999998e-50  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1572  integrase, catalytic region  87.03 
 
 		 906 bp  176  2e-41  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2120  integrase, catalytic region  87.03 
 
 		 906 bp  176  2e-41  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.824405  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4707  hypothetical protein  84.32 
 
 		 309 bp  174  6e-41  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3162  integrase catalytic subunit  84.43 
 
 		 906 bp  159  4e-36  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.116464  normal  0.334205 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0760  integrase catalytic subunit  86.84 
 
 		 735 bp  143  2e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6829    85.96 
 
 		 255 bp  139  3.9999999999999996e-30  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7786  hypothetical protein  82.68 
 
 		 324 bp  135  6e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.0016591  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1295    84.57 
 
 		 279 bp  133  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2687    88 
 
 		 267 bp  129  3e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9898  transposase  85.09 
 
 		 906 bp  129  3e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9838  transposase  85.09 
 
 		 906 bp  129  3e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3544    83.91 
 
 		 802 bp  123  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4212  integrase catalytic subunit  84.97 
 
 		 906 bp  121  7.999999999999999e-25  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.955324  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2709  integrase catalytic subunit  88.18 
 
 		 900 bp  115  5e-23  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2937  integrase catalytic subunit  88.18 
 
 		 900 bp  115  5e-23  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.529853  normal  0.799386 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3846  integrase catalytic subunit  84.25 
 
 		 906 bp  107  1e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.386301 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3563    84.67 
 
 		 943 bp  105  5e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.452743  normal  0.133184 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3384  hypothetical protein  84.67 
 
 		 345 bp  105  5e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1286  hypothetical protein  90.48 
 
 		 558 bp  103  2e-19  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.350643  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0476  IS30 family transposase  90.79 
 
 		 903 bp  95.6  5e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.15798 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3475  hypothetical protein  90.79 
 
 		 1209 bp  95.6  5e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.214234 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3929    85.32 
 
 		 216 bp  89.7  0.000000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3608  Integrase catalytic region  82.24 
 
 		 906 bp  87.7  0.00000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0251528  normal  0.0493713 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2043    82.24 
 
 		 2389 bp  87.7  0.00000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.153153  hitchhiker  0.00767267 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3483  Integrase catalytic region  82.24 
 
 		 906 bp  87.7  0.00000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00971742  hitchhiker  0.00375901 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2528  Integrase catalytic region  82.24 
 
 		 906 bp  87.7  0.00000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000000564647  hitchhiker  0.00383779 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4088  Integrase catalytic region  85.44 
 
 		 1374 bp  85.7  0.00000000000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2953    85.44 
 
 		 2534 bp  85.7  0.00000000000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.100648  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3459  Integrase catalytic region  85.44 
 
 		 1374 bp  85.7  0.00000000000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  decreased coverage  0.00200761  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2955  Integrase catalytic region  85.44 
 
 		 1374 bp  85.7  0.00000000000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0298669  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4055  Integrase catalytic region  85.44 
 
 		 1374 bp  85.7  0.00000000000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1842  Integrase catalytic region  85.44 
 
 		 1374 bp  85.7  0.00000000000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.112569  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1841    85.44 
 
 		 2619 bp  85.7  0.00000000000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.348274  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1947  Integrase catalytic region  85.44 
 
 		 1374 bp  85.7  0.00000000000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.666461  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2697  Integrase catalytic region  85.44 
 
 		 1374 bp  85.7  0.00000000000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1134  Integrase catalytic region  85.44 
 
 		 1374 bp  85.7  0.00000000000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.34752  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1540  Integrase catalytic region  85.44 
 
 		 1374 bp  85.7  0.00000000000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.790818  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17800    93.22 
 
 		 2354 bp  85.7  0.00000000000005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.750484  normal  0.695499 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17810  transposase, IS30 family  93.22 
 
 		 1398 bp  85.7  0.00000000000005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.749123 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3879  Integrase catalytic region  85.44 
 
 		 1374 bp  85.7  0.00000000000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3877    85.44 
 
 		 2364 bp  85.7  0.00000000000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5122  integrase catalytic subunit  89.71 
 
 		 849 bp  79.8  0.000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.184507 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5204  integrase catalytic subunit  89.71 
 
 		 849 bp  79.8  0.000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.184454  normal  0.989225 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1236  Integrase catalytic region  81.58 
 
 		 876 bp  79.8  0.000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.305005 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1608    87.84 
 
 		 916 bp  75.8  0.00000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03920  ISPsy21, transposase OrfB  89.23 
 
 		 513 bp  73.8  0.0000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.67034  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02252  ISPsy21, transposase OrfB  89.23 
 
 		 687 bp  73.8  0.0000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0539  transposase  87.01 
 
 		 300 bp  73.8  0.0000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3906    88.24 
 
 		 912 bp  71.9  0.0000000007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.414091  normal  0.612395 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3255  Integrase catalytic region  88.24 
 
 		 852 bp  71.9  0.0000000007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1616    86.67 
 
 		 793 bp  69.9  0.000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21080  transposase, IS30 family  89.83 
 
 		 1362 bp  69.9  0.000000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.656818  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0515    84.62 
 
 		 1415 bp  69.9  0.000000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0167322  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02392  ISPsy21, transposase OrfB  90.91 
 
 		 774 bp  69.9  0.000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.406166  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5555  integrase catalytic region  92.16 
 
 		 855 bp  69.9  0.000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.884215 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4441  integrase catalytic region  92.16 
 
 		 855 bp  69.9  0.000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5064  integrase catalytic region  92.16 
 
 		 855 bp  69.9  0.000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5344  integrase catalytic region  92.16 
 
 		 855 bp  69.9  0.000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.438366  normal  0.0855179 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1815  hypothetical protein  80.99 
 
 		 309 bp  67.9  0.00000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2820  Integrase catalytic region  85.9 
 
 		 915 bp  67.9  0.00000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0536    85.71 
 
 		 456 bp  65.9  0.00000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.193561  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0008  Integrase catalytic region  87.69 
 
 		 858 bp  65.9  0.00000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.230626  normal  1 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6067  transposase catalytic site ISRme15  87.69 
 
 		 858 bp  65.9  0.00000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.415785 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5541  transposase catalytic site ISRme15  87.69 
 
 		 858 bp  65.9  0.00000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01694  TnpB  95.12 
 
 		 300 bp  65.9  0.00000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1826  Integrase catalytic region  87.69 
 
 		 858 bp  65.9  0.00000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.456922  normal  0.0211966 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1895    87.69 
 
 		 162 bp  65.9  0.00000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.912531  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0740  Integrase catalytic region  87.69 
 
 		 858 bp  65.9  0.00000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0332591  normal  0.114218 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2225  integrase catalytic subunit  90.38 
 
 		 1113 bp  63.9  0.0000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3476  hypothetical protein  91.67 
 
 		 657 bp  63.9  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.184573 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5725  integrase catalytic region  86.76 
 
 		 912 bp  63.9  0.0000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0694  Integrase catalytic region  88.14 
 
 		 1266 bp  61.9  0.0000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1597  Integrase catalytic region  91.49 
 
 		 906 bp  61.9  0.0000007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.369801  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1663  Integrase catalytic region  91.49 
 
 		 906 bp  61.9  0.0000007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1636    91.49 
 
 		 906 bp  61.9  0.0000007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.138484  normal  0.363265 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2741  Integrase catalytic region  91.49 
 
 		 450 bp  61.9  0.0000007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0894729  normal  0.05514 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2513  Integrase catalytic region  91.49 
 
 		 906 bp  61.9  0.0000007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.298059 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0710    87.1 
 
 		 5675 bp  60  0.000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>