73 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_1722 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_0582  integrase catalytic region  100 
 
 		 1401 bp  2777    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00633094 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5592  integrase catalytic region  100 
 
 		 1401 bp  2777    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4011  integrase catalytic region  100 
 
 		 1401 bp  2777    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4006  integrase catalytic region  100 
 
 		 1401 bp  2777    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3807  integrase catalytic region  100 
 
 		 1401 bp  2777    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.123497  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3368  integrase catalytic region  100 
 
 		 1401 bp  2777    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2930    99.93 
 
 		 1400 bp  2761    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.185436 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2900  integrase catalytic region  99.93 
 
 		 1401 bp  2769    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2801  integrase catalytic region  100 
 
 		 1401 bp  2777    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2800    100 
 
 		 3468 bp  2888    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2519  integrase catalytic region  100 
 
 		 1446 bp  2714    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.352374  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1915    99.93 
 
 		 1400 bp  2761    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.590164  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1723  integrase catalytic region  100 
 
 		 1401 bp  2777    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1722    100 
 
 		 3771 bp  7475    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1496  integrase catalytic region  100 
 
 		 1401 bp  2777    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1446  integrase catalytic region  100 
 
 		 1401 bp  2777    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6731    100 
 
 		 2015 bp  2888    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.144839 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6732  integrase catalytic region  100 
 
 		 1401 bp  2777    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.120235 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6913  integrase catalytic region  99.86 
 
 		 1401 bp  2761    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3475  hypothetical protein  90.79 
 
 		 1209 bp  95.6  9e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.214234 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0476  IS30 family transposase  90.79 
 
 		 903 bp  95.6  9e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.15798 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3970  metal dependent phosphohydrolase  87.5 
 
 		 2379 bp  87.7  0.00000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1134  Integrase catalytic region  85.44 
 
 		 1374 bp  85.7  0.00000000000009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.34752  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2953    85.44 
 
 		 2534 bp  85.7  0.00000000000009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.100648  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2697  Integrase catalytic region  85.44 
 
 		 1374 bp  85.7  0.00000000000009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1947  Integrase catalytic region  85.44 
 
 		 1374 bp  85.7  0.00000000000009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.666461  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1842  Integrase catalytic region  85.44 
 
 		 1374 bp  85.7  0.00000000000009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.112569  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17800    93.22 
 
 		 2354 bp  85.7  0.00000000000009  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.750484  normal  0.695499 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17810  transposase, IS30 family  93.22 
 
 		 1398 bp  85.7  0.00000000000009  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.749123 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1979  metal dependent phosphohydrolase  83.46 
 
 		 2199 bp  85.7  0.00000000000009  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  decreased coverage  0.0000184282  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1841    85.44 
 
 		 2619 bp  85.7  0.00000000000009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.348274  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1540  Integrase catalytic region  85.44 
 
 		 1374 bp  85.7  0.00000000000009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.790818  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3459  Integrase catalytic region  85.44 
 
 		 1374 bp  85.7  0.00000000000009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  decreased coverage  0.00200761  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3877    85.44 
 
 		 2364 bp  85.7  0.00000000000009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4088  Integrase catalytic region  85.44 
 
 		 1374 bp  85.7  0.00000000000009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4055  Integrase catalytic region  85.44 
 
 		 1374 bp  85.7  0.00000000000009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3879  Integrase catalytic region  85.44 
 
 		 1374 bp  85.7  0.00000000000009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2955  Integrase catalytic region  85.44 
 
 		 1374 bp  85.7  0.00000000000009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0298669  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02701  crispr-associated helicase Cas3 domain protein  90.77 
 
 		 2169 bp  81.8  0.000000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0428162  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31630  CRISPR-associated helicase Cas3  88.73 
 
 		 1986 bp  77.8  0.00000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0515    84.62 
 
 		 1415 bp  69.9  0.000000005  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0167322  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21080  transposase, IS30 family  89.83 
 
 		 1362 bp  69.9  0.000000005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.656818  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2225  integrase catalytic subunit  90.38 
 
 		 1113 bp  63.9  0.0000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0694  Integrase catalytic region  88.14 
 
 		 1266 bp  61.9  0.000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0508  IS30 family transposase  83.72 
 
 		 1272 bp  60  0.000005  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0560  IS30 family transposase  83.72 
 
 		 1272 bp  60  0.000005  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.404036  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1270  IS30 family transposase  83.72 
 
 		 1272 bp  60  0.000005  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0058  IS30 family transposase  83.72 
 
 		 1272 bp  60  0.000005  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0712    87.1 
 
 		 2569 bp  60  0.000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0710    87.1 
 
 		 5675 bp  60  0.000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0255  IS30 family transposase  83.72 
 
 		 1272 bp  60  0.000005  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.455504  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0065  integrase catalytic subunit  86.15 
 
 		 1440 bp  58  0.00002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1161  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  88.68 
 
 		 2385 bp  58  0.00002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2030  integrase catalytic subunit  86.15 
 
 		 1440 bp  58  0.00002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20930  transpose, IS30 family  88.68 
 
 		 1443 bp  58  0.00002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00500  transposase, IS30 family  88.68 
 
 		 1443 bp  58  0.00002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0572    86.15 
 
 		 2253 bp  58  0.00002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0573  integrase catalytic subunit  86.15 
 
 		 1440 bp  58  0.00002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_2978  metal dependent phosphohydrolase  82.29 
 
 		 2238 bp  56  0.00008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6587  integrase catalytic region  94.29 
 
 		 1158 bp  54  0.0003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6641  integrase catalytic region  94.29 
 
 		 1158 bp  54  0.0003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000123291 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0118  hypothetical protein  86.44 
 
 		 387 bp  54  0.0003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.19217  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4210  integrase  83.13 
 
 		 981 bp  54  0.0003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1971  CRISPR-associated helicase Cas3  83.33 
 
 		 2223 bp  52  0.001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1433  integrase catalytic subunit  96.67 
 
 		 1161 bp  52  0.001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0828  CRISPR-associated helicase Cas3 family protein protein  86.21 
 
 		 2259 bp  52  0.001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3959  integrase catalytic subunit  96.67 
 
 		 1161 bp  52  0.001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3422  Integrase catalytic region  96.55 
 
 		 1017 bp  50.1  0.005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2436  Integrase catalytic region  96.55 
 
 		 1017 bp  50.1  0.005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000220198 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0439  Integrase catalytic region  96.55 
 
 		 1017 bp  50.1  0.005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1864    88.89 
 
 		 1154 bp  50.1  0.005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0429575 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1127  hypothetical protein  100 
 
 		 1023 bp  50.1  0.005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00160448 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3618  PhoH family protein  91.89 
 
 		 1029 bp  50.1  0.005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>