185 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ksed_17800 on replicon NC_013169
Organism: Kytococcus sedentarius DSM 20547



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013169  Ksed_17810  transposase, IS30 family  100 
 
 		 1398 bp  2771    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.749123 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17800    100 
 
 		 2354 bp  4666    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.750484  normal  0.695499 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23470    98.95 
 
 		 844 bp  541  1e-151  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23540  transposase  98.6 
 
 		 873 bp  533  1e-149  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21070    98.25 
 
 		 288 bp  525  1e-146  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.866093  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20160  transposase  98.25 
 
 		 873 bp  525  1e-146  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.204187  normal  0.0283567 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18720  transposase  96.84 
 
 		 873 bp  494  1e-137  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2569    86.13 
 
 		 513 bp  121  1.0000000000000001e-24  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.266812  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2272  Integrase catalytic region  86.26 
 
 		 822 bp  117  2.0000000000000002e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2396  Integrase catalytic region  86.26 
 
 		 822 bp  117  2.0000000000000002e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2849  Integrase catalytic region  86.26 
 
 		 822 bp  117  2.0000000000000002e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.413634 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4467  integrase catalytic region  92.68 
 
 		 1401 bp  115  6e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0065  integrase catalytic subunit  86.05 
 
 		 1440 bp  113  2e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0572    86.05 
 
 		 2253 bp  113  2e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0573  integrase catalytic subunit  86.05 
 
 		 1440 bp  113  2e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2030  integrase catalytic subunit  86.05 
 
 		 1440 bp  113  2e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0515    93.33 
 
 		 1415 bp  109  4e-21  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0167322  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4210  integrase  90.7 
 
 		 981 bp  107  1e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3178  integrase catalytic subunit  85.6 
 
 		 822 bp  105  6e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3240  integrase catalytic subunit  85.6 
 
 		 822 bp  105  6e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3190  integrase catalytic subunit  85.6 
 
 		 822 bp  105  6e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21080  transposase, IS30 family  84.73 
 
 		 1362 bp  101  9e-19  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.656818  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3645  Integrase catalytic region  84.92 
 
 		 861 bp  99.6  4e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00500  transposase, IS30 family  87.76 
 
 		 1443 bp  99.6  4e-18  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20930  transpose, IS30 family  87.76 
 
 		 1443 bp  99.6  4e-18  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2754    91.89 
 
 		 1400 bp  99.6  4e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.641383 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0712    92.65 
 
 		 2569 bp  95.6  6e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0710    92.65 
 
 		 5675 bp  95.6  6e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4442  transposase, ISlxx5  90.67 
 
 		 285 bp  93.7  2e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0603  integrase, catalytic region  84.13 
 
 		 396 bp  91.7  9e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0368  integrase catalytic subunit  89.74 
 
 		 579 bp  91.7  9e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.810172  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5968    84 
 
 		 821 bp  89.7  0.000000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4506  Integrase catalytic region  83.21 
 
 		 867 bp  85.7  0.00000000000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.126933 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0582  integrase catalytic region  93.22 
 
 		 1401 bp  85.7  0.00000000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00633094 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1446  integrase catalytic region  93.22 
 
 		 1401 bp  85.7  0.00000000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1496  integrase catalytic region  93.22 
 
 		 1401 bp  85.7  0.00000000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1722    93.22 
 
 		 3771 bp  85.7  0.00000000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1723  integrase catalytic region  93.22 
 
 		 1401 bp  85.7  0.00000000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1915    93.22 
 
 		 1400 bp  85.7  0.00000000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.590164  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2519  integrase catalytic region  93.22 
 
 		 1446 bp  85.7  0.00000000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.352374  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2800    93.22 
 
 		 3468 bp  85.7  0.00000000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2801  integrase catalytic region  93.22 
 
 		 1401 bp  85.7  0.00000000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2900  integrase catalytic region  93.22 
 
 		 1401 bp  85.7  0.00000000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2930    93.22 
 
 		 1400 bp  85.7  0.00000000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.185436 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3368  integrase catalytic region  93.22 
 
 		 1401 bp  85.7  0.00000000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3807  integrase catalytic region  93.22 
 
 		 1401 bp  85.7  0.00000000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.123497  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4006  integrase catalytic region  93.22 
 
 		 1401 bp  85.7  0.00000000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4011  integrase catalytic region  93.22 
 
 		 1401 bp  85.7  0.00000000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5592  integrase catalytic region  93.22 
 
 		 1401 bp  85.7  0.00000000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6731    93.22 
 
 		 2015 bp  85.7  0.00000000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.144839 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6732  integrase catalytic region  93.22 
 
 		 1401 bp  85.7  0.00000000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.120235 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6913  integrase catalytic region  93.22 
 
 		 1401 bp  85.7  0.00000000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10270  transposase  83.33 
 
 		 666 bp  83.8  0.0000000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0690  Integrase catalytic region  82.07 
 
 		 1230 bp  81.8  0.0000000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3195  integrase catalytic subunit  83.2 
 
 		 858 bp  81.8  0.0000000000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0240069  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3476  hypothetical protein  92.98 
 
 		 657 bp  81.8  0.0000000000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.184573 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3263  integrase  86.9 
 
 		 570 bp  79.8  0.000000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.506953 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0508  IS30 family transposase  89.71 
 
 		 1272 bp  79.8  0.000000000003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4037  integrase catalytic subunit  88.89 
 
 		 1560 bp  79.8  0.000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.389495  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4295  integrase catalytic subunit  88.89 
 
 		 1491 bp  79.8  0.000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0160339  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0230    82.14 
 
 		 900 bp  79.8  0.000000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3958  Integrase catalytic region  82.14 
 
 		 900 bp  79.8  0.000000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0300  Integrase catalytic region  82.14 
 
 		 900 bp  79.8  0.000000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.522174  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0254  Integrase catalytic region  82.14 
 
 		 900 bp  79.8  0.000000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.59969  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3485    82.14 
 
 		 900 bp  79.8  0.000000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1485  Integrase catalytic region  82.14 
 
 		 900 bp  79.8  0.000000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.110479  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0384  Integrase catalytic region  82.14 
 
 		 900 bp  79.8  0.000000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4112  integrase catalytic subunit  88.89 
 
 		 1560 bp  79.8  0.000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.062727  normal  0.815886 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4381  integrase catalytic subunit  88.89 
 
 		 1578 bp  79.8  0.000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.272943  normal  0.570588 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1270  IS30 family transposase  89.71 
 
 		 1272 bp  79.8  0.000000000003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0560  IS30 family transposase  89.71 
 
 		 1272 bp  79.8  0.000000000003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.404036  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0614  integrase catalytic subunit  88.89 
 
 		 1560 bp  79.8  0.000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.579787 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4673  integrase catalytic subunit  88.89 
 
 		 1560 bp  79.8  0.000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.546671 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4676  integrase catalytic subunit  88.89 
 
 		 1560 bp  79.8  0.000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.118167 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0378  Integrase catalytic region  82.14 
 
 		 900 bp  79.8  0.000000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0255  IS30 family transposase  89.71 
 
 		 1272 bp  79.8  0.000000000003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.455504  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2706  Integrase catalytic region  82.14 
 
 		 900 bp  79.8  0.000000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.308367  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3955  Integrase catalytic region  82.14 
 
 		 900 bp  79.8  0.000000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0277  Integrase catalytic region  82.14 
 
 		 900 bp  79.8  0.000000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21090    97.73 
 
 		 693 bp  79.8  0.000000000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3484    82.14 
 
 		 2322 bp  79.8  0.000000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1004  Integrase catalytic region  82.14 
 
 		 900 bp  79.8  0.000000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.217613  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1429  Integrase catalytic region  82.14 
 
 		 900 bp  79.8  0.000000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1438  Integrase catalytic region  82.14 
 
 		 900 bp  79.8  0.000000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.19479  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0058  IS30 family transposase  89.71 
 
 		 1272 bp  79.8  0.000000000003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4666  integrase catalytic subunit  86.75 
 
 		 1425 bp  77.8  0.00000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5430  integrase catalytic subunit  86.75 
 
 		 1245 bp  77.8  0.00000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  normal  0.270049 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5505  integrase catalytic subunit  86.75 
 
 		 1425 bp  77.8  0.00000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.334264  normal  1 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5603  integrase catalytic subunit  86.75 
 
 		 1314 bp  77.8  0.00000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.155715  normal  1 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5827  integrase catalytic subunit  86.75 
 
 		 1314 bp  77.8  0.00000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.382461 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5906  integrase catalytic subunit  86.75 
 
 		 1425 bp  77.8  0.00000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.872405  normal  0.876149 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5986  integrase catalytic subunit  86.75 
 
 		 1314 bp  77.8  0.00000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00996112 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_6004  integrase catalytic subunit  86.75 
 
 		 1314 bp  77.8  0.00000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000000366902 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15130  transposase  86.21 
 
 		 915 bp  77.8  0.00000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0124781  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4088  Integrase catalytic region  87.5 
 
 		 1374 bp  71.9  0.0000000008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1842  Integrase catalytic region  87.5 
 
 		 1374 bp  71.9  0.0000000008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.112569  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2953    87.5 
 
 		 2534 bp  71.9  0.0000000008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.100648  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2955  Integrase catalytic region  87.5 
 
 		 1374 bp  71.9  0.0000000008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0298669  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3459  Integrase catalytic region  87.5 
 
 		 1374 bp  71.9  0.0000000008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  decreased coverage  0.00200761  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1841    87.5 
 
 		 2619 bp  71.9  0.0000000008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.348274  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>