178 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_2800 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_6913  integrase catalytic region  99.86 
 
 		 1401 bp  2761    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5592  integrase catalytic region  100 
 
 		 1401 bp  2777    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6731    100 
 
 		 2015 bp  2886    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.144839 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6732  integrase catalytic region  100 
 
 		 1401 bp  2777    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.120235 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4011  integrase catalytic region  100 
 
 		 1401 bp  2777    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4006  integrase catalytic region  100 
 
 		 1401 bp  2777    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0582  integrase catalytic region  100 
 
 		 1401 bp  2777    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00633094 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1446  integrase catalytic region  100 
 
 		 1401 bp  2777    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1496  integrase catalytic region  100 
 
 		 1401 bp  2777    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1722    100 
 
 		 3771 bp  2888    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1723  integrase catalytic region  100 
 
 		 1401 bp  2777    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3807  integrase catalytic region  100 
 
 		 1401 bp  2777    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.123497  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1915    99.93 
 
 		 1400 bp  2761    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.590164  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2519  integrase catalytic region  100 
 
 		 1446 bp  2714    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.352374  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2800    100 
 
 		 3468 bp  6875    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2801  integrase catalytic region  100 
 
 		 1401 bp  2777    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2900  integrase catalytic region  99.93 
 
 		 1401 bp  2769    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2930    99.93 
 
 		 1400 bp  2761    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.185436 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3368  integrase catalytic region  100 
 
 		 1401 bp  2777    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0186  GAF sensor signal transduction histidine kinase  91.44 
 
 		 2574 bp  517  1e-144  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5295  multi-sensor signal transduction histidine kinase  81.41 
 
 		 2622 bp  202  5.000000000000001e-49  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  decreased coverage  0.00758089  normal  0.057217 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5659  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  82.58 
 
 		 2043 bp  147  3e-32  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0476  IS30 family transposase  90.79 
 
 		 903 bp  95.6  8e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.15798 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3475  hypothetical protein  90.79 
 
 		 1209 bp  95.6  8e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.214234 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17800    93.22 
 
 		 2354 bp  85.7  0.00000000000008  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.750484  normal  0.695499 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4055  Integrase catalytic region  85.44 
 
 		 1374 bp  85.7  0.00000000000008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2953    85.44 
 
 		 2534 bp  85.7  0.00000000000008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.100648  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1841    85.44 
 
 		 2619 bp  85.7  0.00000000000008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.348274  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2955  Integrase catalytic region  85.44 
 
 		 1374 bp  85.7  0.00000000000008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0298669  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3879  Integrase catalytic region  85.44 
 
 		 1374 bp  85.7  0.00000000000008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1134  Integrase catalytic region  85.44 
 
 		 1374 bp  85.7  0.00000000000008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.34752  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2697  Integrase catalytic region  85.44 
 
 		 1374 bp  85.7  0.00000000000008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3877    85.44 
 
 		 2364 bp  85.7  0.00000000000008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3459  Integrase catalytic region  85.44 
 
 		 1374 bp  85.7  0.00000000000008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  decreased coverage  0.00200761  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17810  transposase, IS30 family  93.22 
 
 		 1398 bp  85.7  0.00000000000008  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.749123 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4088  Integrase catalytic region  85.44 
 
 		 1374 bp  85.7  0.00000000000008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1842  Integrase catalytic region  85.44 
 
 		 1374 bp  85.7  0.00000000000008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.112569  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1540  Integrase catalytic region  85.44 
 
 		 1374 bp  85.7  0.00000000000008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.790818  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1947  Integrase catalytic region  85.44 
 
 		 1374 bp  85.7  0.00000000000008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.666461  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0515    84.62 
 
 		 1415 bp  69.9  0.000000005  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0167322  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21080  transposase, IS30 family  89.83 
 
 		 1362 bp  69.9  0.000000005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.656818  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6445  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  91.84 
 
 		 2493 bp  65.9  0.00000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0224728  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1588  sensor histidine kinase  90.57 
 
 		 1509 bp  65.9  0.00000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.153224  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2258  cyclic nucleotide-binding protein  95.12 
 
 		 1464 bp  65.9  0.00000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0925623 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0260  sensor histidine kinase  88.33 
 
 		 1884 bp  63.9  0.0000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0967  sensor histidine kinase  87.5 
 
 		 1206 bp  63.9  0.0000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0922  EAL/GGDEF domain-containing protein  88.33 
 
 		 1884 bp  63.9  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5498  histidine kinase  88.33 
 
 		 2031 bp  63.9  0.0000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2225  integrase catalytic subunit  90.38 
 
 		 1113 bp  63.9  0.0000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2691  sensor histidine kinase  88.33 
 
 		 1884 bp  63.9  0.0000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2386  sensor histidine kinase  88.33 
 
 		 1884 bp  63.9  0.0000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0743  sensor histidine kinase  88.33 
 
 		 1884 bp  63.9  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.573337  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2312  Signal transduction histidine kinase  88.33 
 
 		 1170 bp  63.9  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0755  sensor histidine kinase  88.33 
 
 		 1884 bp  63.9  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.997175  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2467  sensor histidine kinase  88.33 
 
 		 1884 bp  63.9  0.0000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.333423  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3017  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  91.67 
 
 		 2595 bp  63.9  0.0000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0407  histidine kinase  91.67 
 
 		 1458 bp  63.9  0.0000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0733  sensory box sensor histidine kinase  89.09 
 
 		 1077 bp  61.9  0.000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.724389  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2646  sensor histidine kinase  89.09 
 
 		 1338 bp  61.9  0.000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.215713  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0694  Integrase catalytic region  88.14 
 
 		 1266 bp  61.9  0.000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0971  PAS  88.89 
 
 		 3564 bp  60  0.000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.875405  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0508  IS30 family transposase  83.72 
 
 		 1272 bp  60  0.000005  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0710    87.1 
 
 		 5675 bp  60  0.000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1270  IS30 family transposase  83.72 
 
 		 1272 bp  60  0.000005  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0712    87.1 
 
 		 2569 bp  60  0.000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0560  IS30 family transposase  83.72 
 
 		 1272 bp  60  0.000005  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.404036  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0058  IS30 family transposase  83.72 
 
 		 1272 bp  60  0.000005  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2391  Diverse 7TM receptor transmembrane region  90 
 
 		 2181 bp  60  0.000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1489  multi-sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 		 2262 bp  60  0.000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.726921  normal  0.706753 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0249  multi-sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 		 2307 bp  60  0.000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.513538  normal  0.0270747 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3530  histidine kinase  86.36 
 
 		 1647 bp  60  0.000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3128  multi-sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 		 2340 bp  60  0.000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.865325  normal  0.321459 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0255  IS30 family transposase  83.72 
 
 		 1272 bp  60  0.000005  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.455504  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1660  sensory box sensor histidine kinase  88.68 
 
 		 1077 bp  58  0.00002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0709  sensory box sensor histidine kinase  88.68 
 
 		 1077 bp  58  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5981  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  94.59 
 
 		 1809 bp  58  0.00002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0065  integrase catalytic subunit  86.15 
 
 		 1440 bp  58  0.00002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0572    86.15 
 
 		 2253 bp  58  0.00002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0573  integrase catalytic subunit  86.15 
 
 		 1440 bp  58  0.00002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2030  integrase catalytic subunit  86.15 
 
 		 1440 bp  58  0.00002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1718  sensor histidine kinase  88.68 
 
 		 1170 bp  58  0.00002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2551  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  85.51 
 
 		 1191 bp  58  0.00002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.14529e-19 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1925  sensor histidine kinase  88.68 
 
 		 1170 bp  58  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.574394  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3720  histidine kinase  88.68 
 
 		 2082 bp  58  0.00002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2229  sensor histidine kinase  88.68 
 
 		 1170 bp  58  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0601  sensor histidine kinase  88.68 
 
 		 1170 bp  58  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3194  histidine kinase  88.68 
 
 		 1992 bp  58  0.00002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0770  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  89.8 
 
 		 2445 bp  58  0.00002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.486726  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00500  transposase, IS30 family  88.68 
 
 		 1443 bp  58  0.00002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20930  transpose, IS30 family  88.68 
 
 		 1443 bp  58  0.00002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4432  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  89.8 
 
 		 2577 bp  58  0.00002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6440  histidine kinase  94.59 
 
 		 1836 bp  58  0.00002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.920923  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4405  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  92.5 
 
 		 1092 bp  56  0.00007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.198423  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0383  histidine kinase  96.88 
 
 		 1449 bp  56  0.00007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.614278  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2881  multi-sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 		 2289 bp  56  0.00007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0943385  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1180  ATP-binding region, ATPase-like  90.91 
 
 		 1356 bp  56  0.00007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.513704  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0282  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  96.88 
 
 		 1485 bp  56  0.00007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4382  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  92.5 
 
 		 1092 bp  56  0.00007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5004  cyclic nucleotide-binding protein  90.91 
 
 		 1461 bp  56  0.00007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4776  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  90.91 
 
 		 3261 bp  56  0.00007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.108623  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>