154 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_0712 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_2588  Integrase catalytic region  100 
 
 		 969 bp  1921    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2658  Integrase catalytic region  100 
 
 		 969 bp  1921    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0819  Integrase catalytic region  100 
 
 		 969 bp  1921    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2656    100 
 
 		 2656 bp  2706    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4726    86.91 
 
 		 3918 bp  771    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1182    100 
 
 		 1749 bp  1126    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1180    100 
 
 		 615 bp  1090    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1173  Integrase catalytic region  100 
 
 		 969 bp  1921    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0737  Integrase catalytic region  100 
 
 		 969 bp  1921    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1739  Integrase catalytic region  100 
 
 		 969 bp  1921    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0682469  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1501  Integrase catalytic region  87.72 
 
 		 969 bp  977    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1177  Integrase catalytic region  100 
 
 		 969 bp  1921    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4660  Integrase catalytic region  100 
 
 		 969 bp  1921    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0714    100 
 
 		 969 bp  1921    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2669    97.85 
 
 		 3924 bp  1518    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2801  Integrase catalytic region  100 
 
 		 969 bp  1921    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0160717  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0364  Integrase catalytic region  100 
 
 		 969 bp  1921    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0367  Integrase catalytic region  100 
 
 		 969 bp  1921    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0710    100 
 
 		 5675 bp  5093    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0712    100 
 
 		 2569 bp  5093    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1178  transposase IS3/IS911 family protein  100 
 
 		 318 bp  630  1e-178  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2657  transposase IS3/IS911 family protein  100 
 
 		 318 bp  630  1e-178  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1174  transposase IS3/IS911 family protein  100 
 
 		 318 bp  630  1e-178  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0818  transposase IS3/IS911 family protein  100 
 
 		 318 bp  630  1e-178  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2587  transposase IS3/IS911 family protein  100 
 
 		 318 bp  630  1e-178  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.771833  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4659  transposase IS3/IS911 family protein  100 
 
 		 318 bp  630  1e-178  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1740  transposase IS3/IS911 family protein  100 
 
 		 318 bp  630  1e-178  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.698666  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2800  transposase IS3/IS911 family protein  100 
 
 		 318 bp  630  1e-178  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0137371  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0365  transposase IS3/IS911 family protein  100 
 
 		 318 bp  630  1e-178  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0713  transposase IS3/IS911 family protein  100 
 
 		 318 bp  630  1e-178  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2668  transposase IS3/IS911 family protein  99.69 
 
 		 318 bp  622  1e-175  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0366  transposase IS3/IS911 family protein  99.69 
 
 		 318 bp  622  1e-175  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2583    83.65 
 
 		 3939 bp  571  1e-160  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0739  transposase IS3/IS911 family protein  100 
 
 		 315 bp  569  1.0000000000000001e-159  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4729  transposase IS3/IS911 family protein  89.17 
 
 		 318 bp  353  2e-94  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1500  transposase IS3/IS911 family protein  95.58 
 
 		 318 bp  184  9e-44  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1179  hypothetical protein  100 
 
 		 1227 bp  172  2.9999999999999998e-40  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1741  hypothetical protein  100 
 
 		 1428 bp  172  2.9999999999999998e-40  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1175  phage tail tape measure protein, TP901 family  100 
 
 		 4032 bp  170  1.0000000000000001e-39  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3288  Integrase catalytic region  78.94 
 
 		 963 bp  153  3e-34  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4730    93.1 
 
 		 468 bp  125  7e-26  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2586  transposase IS3/IS911 family protein  92.13 
 
 		 318 bp  121  1.0000000000000001e-24  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4467  integrase catalytic region  88.89 
 
 		 1401 bp  99.6  4e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17800    92.65 
 
 		 2354 bp  95.6  6e-17  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.750484  normal  0.695499 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17810  transposase, IS30 family  92.65 
 
 		 1398 bp  95.6  6e-17  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.749123 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2754    87.78 
 
 		 1400 bp  91.7  9e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.641383 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0519    87.65 
 
 		 381 bp  81.8  0.0000000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1238  integrase catalytic subunit  91.53 
 
 		 1161 bp  77.8  0.00000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2457    88.41 
 
 		 893 bp  73.8  0.0000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2845    88.41 
 
 		 965 bp  73.8  0.0000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.133213 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0690  Integrase catalytic region  90.74 
 
 		 1230 bp  67.9  0.00000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4037  integrase catalytic subunit  86.11 
 
 		 1560 bp  63.9  0.0000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.389495  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4295  integrase catalytic subunit  86.11 
 
 		 1491 bp  63.9  0.0000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0160339  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4112  integrase catalytic subunit  86.11 
 
 		 1560 bp  63.9  0.0000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.062727  normal  0.815886 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4381  integrase catalytic subunit  86.11 
 
 		 1578 bp  63.9  0.0000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.272943  normal  0.570588 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0614  integrase catalytic subunit  86.11 
 
 		 1560 bp  63.9  0.0000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.579787 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4673  integrase catalytic subunit  86.11 
 
 		 1560 bp  63.9  0.0000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.546671 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4676  integrase catalytic subunit  86.11 
 
 		 1560 bp  63.9  0.0000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.118167 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3625  integrase, catalytic region  85 
 
 		 249 bp  63.9  0.0000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0290027  normal  0.12357 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0058  IS30 family transposase  89.29 
 
 		 1272 bp  63.9  0.0000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0255  IS30 family transposase  89.29 
 
 		 1272 bp  63.9  0.0000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.455504  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0508  IS30 family transposase  89.29 
 
 		 1272 bp  63.9  0.0000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0560  IS30 family transposase  89.29 
 
 		 1272 bp  63.9  0.0000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.404036  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1270  IS30 family transposase  89.29 
 
 		 1272 bp  63.9  0.0000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00500  transposase, IS30 family  89.29 
 
 		 1443 bp  63.9  0.0000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20930  transpose, IS30 family  89.29 
 
 		 1443 bp  63.9  0.0000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1309    97.14 
 
 		 158 bp  61.9  0.0000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0859  Integrase catalytic region  90.2 
 
 		 1005 bp  61.9  0.0000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.54684 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4773  Integrase catalytic region  90.2 
 
 		 1005 bp  61.9  0.0000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1529  integrase catalytic subunit  90 
 
 		 1029 bp  60  0.000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.016356  hitchhiker  0.00474191 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1592  integrase catalytic subunit  90 
 
 		 1029 bp  60  0.000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00550293  normal  0.214322 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2382  integrase catalytic subunit  90 
 
 		 1029 bp  60  0.000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000024142  hitchhiker  0.0000200818 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4122  transposase IS1088  90 
 
 		 1029 bp  60  0.000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.618296  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4207  transposase IS1088  90 
 
 		 1029 bp  60  0.000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.302839  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4418  transposase IS1088  90 
 
 		 1029 bp  60  0.000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0182446  normal  0.486351 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4463  transposase IS1088  90 
 
 		 1029 bp  60  0.000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.985118  normal  0.0492126 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3232  integrase catalytic subunit  90 
 
 		 1398 bp  60  0.000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.495092 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0893  integrase catalytic region  90 
 
 		 1398 bp  60  0.000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.157444  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0582  integrase catalytic region  87.1 
 
 		 1401 bp  60  0.000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00633094 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1446  integrase catalytic region  87.1 
 
 		 1401 bp  60  0.000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1496  integrase catalytic region  87.1 
 
 		 1401 bp  60  0.000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1722    87.1 
 
 		 3771 bp  60  0.000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1723  integrase catalytic region  87.1 
 
 		 1401 bp  60  0.000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1915    87.1 
 
 		 1400 bp  60  0.000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.590164  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2519  integrase catalytic region  87.1 
 
 		 1446 bp  60  0.000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.352374  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2800    87.1 
 
 		 3468 bp  60  0.000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2801  integrase catalytic region  87.1 
 
 		 1401 bp  60  0.000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2900  integrase catalytic region  87.1 
 
 		 1401 bp  60  0.000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2930    87.1 
 
 		 1400 bp  60  0.000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.185436 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3368  integrase catalytic region  87.1 
 
 		 1401 bp  60  0.000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3807  integrase catalytic region  87.1 
 
 		 1401 bp  60  0.000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.123497  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4006  integrase catalytic region  87.1 
 
 		 1401 bp  60  0.000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4011  integrase catalytic region  87.1 
 
 		 1401 bp  60  0.000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5592  integrase catalytic region  87.1 
 
 		 1401 bp  60  0.000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6731    87.1 
 
 		 2015 bp  60  0.000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.144839 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6732  integrase catalytic region  87.1 
 
 		 1401 bp  60  0.000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.120235 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4255  integrase catalytic region  90 
 
 		 1398 bp  60  0.000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000703282 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4426  integrase catalytic region  90 
 
 		 1398 bp  60  0.000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.179177  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1557  integrase catalytic region  85.14 
 
 		 981 bp  60  0.000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3004  integrase catalytic region  85.14 
 
 		 981 bp  60  0.000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>