22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_1179 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013441  Gbro_1179  hypothetical protein  100 
 
 
408 aa  822    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4699  transposase IS4 family protein  100 
 
 
458 aa  761    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.984217  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0815  transposase IS4 family protein  100 
 
 
458 aa  761    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_6006  TnpC protein  45.92 
 
 
467 aa  315  9.999999999999999e-85  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000000150471 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5428  TnpC protein  45.66 
 
 
482 aa  312  4.999999999999999e-84  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  normal  0.572731 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3030  transposase, IS4 family protein  45.41 
 
 
482 aa  303  3.0000000000000004e-81  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.813515  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3553  transposase, IS4 family protein  45.41 
 
 
482 aa  303  3.0000000000000004e-81  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.400805  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5550  transposase, IS4 family protein  45.41 
 
 
482 aa  303  3.0000000000000004e-81  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4786  IS4 family transposase  42.35 
 
 
442 aa  272  8.000000000000001e-72  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0321655  normal  0.753556 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0438  transposase IS4 family protein  35.31 
 
 
456 aa  198  2.0000000000000003e-49  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1755  transposase IS4 family protein  35.31 
 
 
457 aa  198  2.0000000000000003e-49  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000443727  normal  0.223234 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4617  TnpC protein  40.42 
 
 
329 aa  194  3e-48  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.379435  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2717  hypothetical protein  44.26 
 
 
307 aa  177  2e-43  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.940493  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4618  TnpC protein  53.4 
 
 
191 aa  103  8e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.297229  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2716  hypothetical protein  47.92 
 
 
96 aa  82.4  0.00000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.909313 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1175  phage tail tape measure protein, TP901 family  55.93 
 
 
1343 aa  70.5  0.00000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1741  hypothetical protein  61.11 
 
 
475 aa  67.4  0.0000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1014  hypothetical protein  54.55 
 
 
110 aa  55.5  0.000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.683411  normal 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0088  transposase InsC3 for insertion sequence ISEc9  21.67 
 
 
420 aa  53.5  0.000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.0568317 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0978  transposase, IS4 family protein  26.22 
 
 
446 aa  51.6  0.00002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.057902  normal  0.226488 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3053  transposase, IS4 family protein  26.22 
 
 
446 aa  51.6  0.00002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00177802  normal  0.0159754 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0570  hypothetical protein  27.84 
 
 
385 aa  44.7  0.003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>