37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_C0519 on replicon NC_007953
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007953  Bxe_C0519    100 
 
 		 381 bp  755    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4468  integrase catalytic region  84.77 
 
 		 1398 bp  117  2.0000000000000002e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4426  integrase catalytic region  84.77 
 
 		 1398 bp  117  2.0000000000000002e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.179177  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3232  integrase catalytic subunit  84.77 
 
 		 1398 bp  117  2.0000000000000002e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.495092 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4255  integrase catalytic region  84.77 
 
 		 1398 bp  117  2.0000000000000002e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000703282 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4206  integrase catalytic region  84.77 
 
 		 1398 bp  117  2.0000000000000002e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3406  integrase catalytic region  84.77 
 
 		 1398 bp  117  2.0000000000000002e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3405    84.77 
 
 		 2281 bp  117  2.0000000000000002e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0893  integrase catalytic region  84.77 
 
 		 1398 bp  117  2.0000000000000002e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.157444  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2754    89.29 
 
 		 1400 bp  95.6  9e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.641383 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4467  integrase catalytic region  86.14 
 
 		 1401 bp  89.7  5e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3625  integrase, catalytic region  87.21 
 
 		 249 bp  83.8  0.00000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0290027  normal  0.12357 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0712    87.65 
 
 		 2569 bp  81.8  0.0000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0710    87.65 
 
 		 5675 bp  81.8  0.0000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0118  hypothetical protein  85.51 
 
 		 387 bp  58  0.000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.19217  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4666  integrase catalytic subunit  81.48 
 
 		 1425 bp  56  0.000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_6004  integrase catalytic subunit  81.48 
 
 		 1314 bp  56  0.000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000000366902 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5986  integrase catalytic subunit  81.48 
 
 		 1314 bp  56  0.000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00996112 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5906  integrase catalytic subunit  81.48 
 
 		 1425 bp  56  0.000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.872405  normal  0.876149 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5827  integrase catalytic subunit  81.48 
 
 		 1314 bp  56  0.000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.382461 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5603  integrase catalytic subunit  81.48 
 
 		 1314 bp  56  0.000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.155715  normal  1 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5505  integrase catalytic subunit  81.48 
 
 		 1425 bp  56  0.000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.334264  normal  1 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5430  integrase catalytic subunit  81.48 
 
 		 1245 bp  56  0.000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  normal  0.270049 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17810  transposase, IS30 family  82.72 
 
 		 1398 bp  50.1  0.0005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.749123 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17800    82.72 
 
 		 2354 bp  50.1  0.0005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.750484  normal  0.695499 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0255  IS30 family transposase  81.82 
 
 		 1272 bp  48.1  0.002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.455504  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4773  Integrase catalytic region  87.5 
 
 		 1005 bp  48.1  0.002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0859  Integrase catalytic region  87.5 
 
 		 1005 bp  48.1  0.002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.54684 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1270  IS30 family transposase  81.82 
 
 		 1272 bp  48.1  0.002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0560  IS30 family transposase  81.82 
 
 		 1272 bp  48.1  0.002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.404036  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0508  IS30 family transposase  81.82 
 
 		 1272 bp  48.1  0.002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0058  IS30 family transposase  81.82 
 
 		 1272 bp  48.1  0.002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3419  integrase catalytic region  88.64 
 
 		 1161 bp  48.1  0.002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0492382  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1990  integrase catalytic region  83.33 
 
 		 1020 bp  48.1  0.002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.653928 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3055  Integrase catalytic region  83.1 
 
 		 1071 bp  46.1  0.007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3165  Integrase catalytic region  83.1 
 
 		 1071 bp  46.1  0.007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3384  hypothetical protein  96.3 
 
 		 345 bp  46.1  0.007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>