144 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_2754 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_2754    100 
 
 		 1400 bp  2775    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.641383 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4467  integrase catalytic region  95.72 
 
 		 1401 bp  2294    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4468  hypothetical protein  95.28 
 
 		 804 bp  204  5e-50  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.504952  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3625  integrase, catalytic region  91.51 
 
 		 249 bp  139  1.9999999999999998e-30  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0290027  normal  0.12357 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4037  integrase catalytic subunit  94.44 
 
 		 1560 bp  111  6e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.389495  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4295  integrase catalytic subunit  94.44 
 
 		 1491 bp  111  6e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0160339  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4112  integrase catalytic subunit  94.44 
 
 		 1560 bp  111  6e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.062727  normal  0.815886 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4381  integrase catalytic subunit  94.44 
 
 		 1578 bp  111  6e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.272943  normal  0.570588 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0614  integrase catalytic subunit  94.44 
 
 		 1560 bp  111  6e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.579787 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4673  integrase catalytic subunit  94.44 
 
 		 1560 bp  111  6e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.546671 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4676  integrase catalytic subunit  94.44 
 
 		 1560 bp  111  6e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.118167 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0368  integrase catalytic subunit  94.44 
 
 		 579 bp  111  6e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.810172  normal  1 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6282  integrase catalytic subunit  90.8 
 
 		 1020 bp  109  2e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2842  integrase catalytic subunit  90.8 
 
 		 1020 bp  109  2e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4004  transposase for insertion sequence element IS1086  90.8 
 
 		 1020 bp  109  2e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1270  IS30 family transposase  89.47 
 
 		 1272 bp  109  2e-21  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0560  IS30 family transposase  89.47 
 
 		 1272 bp  109  2e-21  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.404036  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0508  IS30 family transposase  89.47 
 
 		 1272 bp  109  2e-21  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0255  IS30 family transposase  89.47 
 
 		 1272 bp  109  2e-21  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.455504  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0058  IS30 family transposase  89.47 
 
 		 1272 bp  109  2e-21  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0515    87.62 
 
 		 1415 bp  105  3e-20  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0167322  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4210  integrase  92.96 
 
 		 981 bp  101  5e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0883  integrase catalytic region  90.36 
 
 		 981 bp  101  5e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1557  integrase catalytic region  90.36 
 
 		 981 bp  101  5e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3004  integrase catalytic region  90.36 
 
 		 981 bp  101  5e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3005  integrase catalytic region  90.36 
 
 		 981 bp  101  5e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17810  transposase, IS30 family  91.89 
 
 		 1398 bp  99.6  2e-18  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.749123 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17800    91.89 
 
 		 2354 bp  99.6  2e-18  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.750484  normal  0.695499 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0519    89.29 
 
 		 381 bp  95.6  3e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0065  integrase catalytic subunit  93.65 
 
 		 1440 bp  93.7  1e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0572    93.65 
 
 		 2253 bp  93.7  1e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0573  integrase catalytic subunit  93.65 
 
 		 1440 bp  93.7  1e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2030  integrase catalytic subunit  93.65 
 
 		 1440 bp  93.7  1e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1990  integrase catalytic region  87.91 
 
 		 1020 bp  93.7  1e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.653928 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4442  transposase, ISlxx5  90.54 
 
 		 285 bp  91.7  5e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0712    87.78 
 
 		 2569 bp  91.7  5e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0710    87.78 
 
 		 5675 bp  91.7  5e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21080  transposase, IS30 family  86 
 
 		 1362 bp  87.7  0.000000000000008  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.656818  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1864    91.18 
 
 		 1154 bp  87.7  0.000000000000008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0429575 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3263  integrase  90 
 
 		 570 bp  83.8  0.0000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.506953 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1276  integrase catalytic subunit  87.21 
 
 		 1032 bp  83.8  0.0000000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0859  Integrase catalytic region  94.44 
 
 		 1005 bp  83.8  0.0000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.54684 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4773  Integrase catalytic region  94.44 
 
 		 1005 bp  83.8  0.0000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1285    89.71 
 
 		 282 bp  79.8  0.000000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.305935  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22920  transposase, IS30 family  86.21 
 
 		 1158 bp  77.8  0.000000000008  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.200558 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15120  transposase, IS30 family  86.21 
 
 		 1158 bp  77.8  0.000000000008  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0851499  normal  0.892726 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5361  Integrase catalytic region  92.59 
 
 		 1005 bp  75.8  0.00000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4339  integrase catalytic subunit  84.54 
 
 		 1029 bp  73.8  0.0000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2157  integrase catalytic subunit  84.54 
 
 		 1029 bp  73.8  0.0000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.100699  normal  0.0600961 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3422  Integrase catalytic region  91.23 
 
 		 1017 bp  73.8  0.0000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1842  Integrase catalytic region  87.5 
 
 		 1374 bp  71.9  0.0000000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.112569  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3879  Integrase catalytic region  87.5 
 
 		 1374 bp  71.9  0.0000000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2953    87.5 
 
 		 2534 bp  71.9  0.0000000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.100648  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3459  Integrase catalytic region  87.5 
 
 		 1374 bp  71.9  0.0000000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  decreased coverage  0.00200761  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2955  Integrase catalytic region  87.5 
 
 		 1374 bp  71.9  0.0000000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0298669  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3877    87.5 
 
 		 2364 bp  71.9  0.0000000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1841    87.5 
 
 		 2619 bp  71.9  0.0000000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.348274  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1540  Integrase catalytic region  87.5 
 
 		 1374 bp  71.9  0.0000000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.790818  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1947  Integrase catalytic region  87.5 
 
 		 1374 bp  71.9  0.0000000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.666461  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2697  Integrase catalytic region  87.5 
 
 		 1374 bp  71.9  0.0000000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4055  Integrase catalytic region  87.5 
 
 		 1374 bp  71.9  0.0000000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4088  Integrase catalytic region  87.5 
 
 		 1374 bp  71.9  0.0000000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1134  Integrase catalytic region  87.5 
 
 		 1374 bp  71.9  0.0000000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.34752  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00500  transposase, IS30 family  89.83 
 
 		 1443 bp  69.9  0.000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3082  integrase catalytic subunit  86.67 
 
 		 762 bp  69.9  0.000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20930  transpose, IS30 family  89.83 
 
 		 1443 bp  69.9  0.000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3165  Integrase catalytic region  86.49 
 
 		 1071 bp  67.9  0.000000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1467  transposase, ISlxx5  86.49 
 
 		 285 bp  67.9  0.000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.499982 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3055  Integrase catalytic region  86.49 
 
 		 1071 bp  67.9  0.000000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2436  Integrase catalytic region  89.47 
 
 		 1017 bp  65.9  0.00000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000220198 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0756  Integrase catalytic region  89.47 
 
 		 1017 bp  65.9  0.00000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0439  Integrase catalytic region  89.47 
 
 		 1017 bp  65.9  0.00000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00937  transposase and inactivated derivatives, IS30 family  89.29 
 
 		 435 bp  63.9  0.0000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00950  transposase and inactivated derivatives, IS30 family  89.29 
 
 		 435 bp  63.9  0.0000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0673327  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01165  transposase and inactivated derivatives, IS30 family  89.29 
 
 		 384 bp  63.9  0.0000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.632104  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01834  transposase and inactivated derivatives, IS30 family  89.29 
 
 		 435 bp  63.9  0.0000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.878416  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01854  transposase and inactivated derivatives, IS30 family  89.29 
 
 		 435 bp  63.9  0.0000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03016  transposase and inactivated derivatives, IS30 family  89.29 
 
 		 435 bp  63.9  0.0000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03339  transposase and inactivated derivatives, IS30 family  89.29 
 
 		 435 bp  63.9  0.0000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03801  transposase and inactivated derivatives, IS30 family  89.29 
 
 		 435 bp  63.9  0.0000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04105  transposase and inactivated derivatives, IS30 family  89.29 
 
 		 435 bp  63.9  0.0000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04612  transposase and inactivated derivatives, IS30 family  89.29 
 
 		 435 bp  63.9  0.0000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.809805  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05425  integrase core domain, putative  89.29 
 
 		 435 bp  63.9  0.0000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06099  transposase and inactivated derivatives, IS30 family  89.29 
 
 		 435 bp  63.9  0.0000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.747253  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06216  transposase and inactivated derivatives, IS30 family  89.29 
 
 		 435 bp  63.9  0.0000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.805285  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0690  Integrase catalytic region  88.89 
 
 		 1230 bp  60  0.000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3640  integrase  91.11 
 
 		 1032 bp  58  0.000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3232  integrase catalytic subunit  88.68 
 
 		 1398 bp  58  0.000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.495092 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0481  integrase catalytic subunit  96.97 
 
 		 1206 bp  58  0.000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.103123 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0893  integrase catalytic region  88.68 
 
 		 1398 bp  58  0.000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.157444  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3405    88.68 
 
 		 2281 bp  58  0.000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3406  integrase catalytic region  88.68 
 
 		 1398 bp  58  0.000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4206  integrase catalytic region  88.68 
 
 		 1398 bp  58  0.000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4255  integrase catalytic region  88.68 
 
 		 1398 bp  58  0.000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000703282 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4426  integrase catalytic region  88.68 
 
 		 1398 bp  58  0.000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.179177  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4468  integrase catalytic region  88.68 
 
 		 1398 bp  58  0.000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03433  ISXoo15 transposase  92.68 
 
 		 948 bp  58  0.000007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0694  Integrase catalytic region  89.58 
 
 		 1266 bp  56  0.00003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0605    96.88 
 
 		 502 bp  56  0.00003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01211  transposase and inactivated derivatives, IS30 family  87.5 
 
 		 435 bp  56  0.00003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>