20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_0605 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_0605    100 
 
 		 502 bp  995    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3555  Integrase catalytic region  84.72 
 
 		 954 bp  56  0.00001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0003326  hitchhiker  0.00163359 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2754    96.88 
 
 		 1400 bp  56  0.00001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.641383 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4467  integrase catalytic region  96.88 
 
 		 1401 bp  56  0.00001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0481  integrase catalytic subunit  94.29 
 
 		 1206 bp  54  0.00004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.103123 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9209    91.89 
 
 		 544 bp  50.1  0.0006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.919137 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0382  integrase catalytic subunit  93.94 
 
 		 1206 bp  50.1  0.0006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0329218 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1557  integrase catalytic region  93.75 
 
 		 981 bp  48.1  0.002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17810  transposase, IS30 family  93.75 
 
 		 1398 bp  48.1  0.002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.749123 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17800    93.75 
 
 		 2354 bp  48.1  0.002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.750484  normal  0.695499 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3005  integrase catalytic region  93.75 
 
 		 981 bp  48.1  0.002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3004  integrase catalytic region  93.75 
 
 		 981 bp  48.1  0.002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0883  integrase catalytic region  93.75 
 
 		 981 bp  48.1  0.002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0065  integrase catalytic subunit  89.74 
 
 		 1440 bp  46.1  0.01  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2030  integrase catalytic subunit  89.74 
 
 		 1440 bp  46.1  0.01  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0859  Integrase catalytic region  91.43 
 
 		 1005 bp  46.1  0.01  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.54684 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0573  integrase catalytic subunit  89.74 
 
 		 1440 bp  46.1  0.01  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4773  Integrase catalytic region  91.43 
 
 		 1005 bp  46.1  0.01  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5361  Integrase catalytic region  91.43 
 
 		 1005 bp  46.1  0.01  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0572    89.74 
 
 		 2253 bp  46.1  0.01  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>