135 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_0572 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_0065  integrase catalytic subunit  100 
 
 		 1440 bp  2855    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0572    100 
 
 		 2253 bp  4466    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0573  integrase catalytic subunit  100 
 
 		 1440 bp  2855    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1091    100 
 
 		 966 bp  880    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1592  integrase catalytic subunit  100 
 
 		 753 bp  880    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2029  hypothetical protein  100 
 
 		 339 bp  672    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2030  integrase catalytic subunit  100 
 
 		 1440 bp  2855    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2031    100 
 
 		 480 bp  952    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2753  integrase catalytic subunit  100 
 
 		 762 bp  880    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3565  integrase catalytic subunit  100 
 
 		 753 bp  880    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21080  transposase, IS30 family  85.78 
 
 		 1362 bp  1049    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.656818  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00500  transposase, IS30 family  78.5 
 
 		 1443 bp  218  4.9999999999999996e-54  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20930  transpose, IS30 family  78.5 
 
 		 1443 bp  218  4.9999999999999996e-54  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4666  integrase catalytic subunit  78.04 
 
 		 1425 bp  159  4e-36  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5430  integrase catalytic subunit  78.04 
 
 		 1245 bp  159  4e-36  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  normal  0.270049 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5505  integrase catalytic subunit  78.04 
 
 		 1425 bp  159  4e-36  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.334264  normal  1 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5603  integrase catalytic subunit  78.04 
 
 		 1314 bp  159  4e-36  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.155715  normal  1 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5827  integrase catalytic subunit  78.04 
 
 		 1314 bp  159  4e-36  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.382461 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5906  integrase catalytic subunit  78.04 
 
 		 1425 bp  159  4e-36  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.872405  normal  0.876149 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5986  integrase catalytic subunit  78.04 
 
 		 1314 bp  159  4e-36  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00996112 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_6004  integrase catalytic subunit  78.04 
 
 		 1314 bp  159  4e-36  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000000366902 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17810  transposase, IS30 family  86.05 
 
 		 1398 bp  113  2e-22  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.749123 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17800    86.05 
 
 		 2354 bp  113  2e-22  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.750484  normal  0.695499 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21090    88.42 
 
 		 693 bp  101  9e-19  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25120    88.89 
 
 		 964 bp  99.6  3e-18  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2754    93.65 
 
 		 1400 bp  93.7  2e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.641383 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4037  integrase catalytic subunit  94.74 
 
 		 1560 bp  89.7  0.000000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.389495  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4295  integrase catalytic subunit  94.74 
 
 		 1491 bp  89.7  0.000000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0160339  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4112  integrase catalytic subunit  94.74 
 
 		 1560 bp  89.7  0.000000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.062727  normal  0.815886 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4381  integrase catalytic subunit  94.74 
 
 		 1578 bp  89.7  0.000000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.272943  normal  0.570588 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0614  integrase catalytic subunit  94.74 
 
 		 1560 bp  89.7  0.000000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.579787 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4673  integrase catalytic subunit  94.74 
 
 		 1560 bp  89.7  0.000000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.546671 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4676  integrase catalytic subunit  94.74 
 
 		 1560 bp  89.7  0.000000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.118167 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15120  transposase, IS30 family  89.61 
 
 		 1158 bp  89.7  0.000000000000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0851499  normal  0.892726 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22920  transposase, IS30 family  89.61 
 
 		 1158 bp  89.7  0.000000000000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.200558 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4467  integrase catalytic region  92.06 
 
 		 1401 bp  85.7  0.00000000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1270  IS30 family transposase  86.9 
 
 		 1272 bp  79.8  0.000000000003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0515    85 
 
 		 1415 bp  79.8  0.000000000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0167322  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0560  IS30 family transposase  86.9 
 
 		 1272 bp  79.8  0.000000000003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.404036  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0508  IS30 family transposase  86.9 
 
 		 1272 bp  79.8  0.000000000003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0255  IS30 family transposase  86.9 
 
 		 1272 bp  79.8  0.000000000003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.455504  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0058  IS30 family transposase  86.9 
 
 		 1272 bp  79.8  0.000000000003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1276  integrase catalytic subunit  86.05 
 
 		 1032 bp  75.8  0.00000000005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3625  integrase, catalytic region  90.32 
 
 		 249 bp  75.8  0.00000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0290027  normal  0.12357 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4210  integrase  91.23 
 
 		 981 bp  73.8  0.0000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00937  transposase and inactivated derivatives, IS30 family  91.07 
 
 		 435 bp  71.9  0.0000000008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00950  transposase and inactivated derivatives, IS30 family  91.07 
 
 		 435 bp  71.9  0.0000000008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0673327  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01165  transposase and inactivated derivatives, IS30 family  91.07 
 
 		 384 bp  71.9  0.0000000008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.632104  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01834  transposase and inactivated derivatives, IS30 family  91.07 
 
 		 435 bp  71.9  0.0000000008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.878416  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01854  transposase and inactivated derivatives, IS30 family  91.07 
 
 		 435 bp  71.9  0.0000000008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03016  transposase and inactivated derivatives, IS30 family  91.07 
 
 		 435 bp  71.9  0.0000000008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03339  transposase and inactivated derivatives, IS30 family  91.07 
 
 		 435 bp  71.9  0.0000000008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03801  transposase and inactivated derivatives, IS30 family  91.07 
 
 		 435 bp  71.9  0.0000000008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04105  transposase and inactivated derivatives, IS30 family  91.07 
 
 		 435 bp  71.9  0.0000000008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04612  transposase and inactivated derivatives, IS30 family  91.07 
 
 		 435 bp  71.9  0.0000000008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.809805  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05425  integrase core domain, putative  91.07 
 
 		 435 bp  71.9  0.0000000008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06099  transposase and inactivated derivatives, IS30 family  91.07 
 
 		 435 bp  71.9  0.0000000008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.747253  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06216  transposase and inactivated derivatives, IS30 family  91.07 
 
 		 435 bp  71.9  0.0000000008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.805285  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3263  integrase  85.37 
 
 		 570 bp  67.9  0.00000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.506953 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5431  putative transposase for insertion element IS6110 (second part)  87.88 
 
 		 831 bp  67.9  0.00000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  normal  0.15452 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5602  putative transposase for insertion element IS6110 (second part)  87.88 
 
 		 831 bp  67.9  0.00000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.384176  normal  0.976486 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5828  putative transposase for insertion element IS6110 (second part)  87.88 
 
 		 831 bp  67.9  0.00000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.313966 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5987  hypothetical protein  87.88 
 
 		 765 bp  67.9  0.00000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00129837 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_6003  putative transposase for insertion element IS6110 (second part)  87.88 
 
 		 831 bp  67.9  0.00000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000000813488 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1285    84.88 
 
 		 282 bp  67.9  0.00000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.305935  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0368  integrase catalytic subunit  90.74 
 
 		 579 bp  67.9  0.00000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.810172  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13211  transposase  87.88 
 
 		 1185 bp  67.9  0.00000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.562916 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6282  integrase catalytic subunit  90.57 
 
 		 1020 bp  65.9  0.00000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2842  integrase catalytic subunit  90.57 
 
 		 1020 bp  65.9  0.00000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4004  transposase for insertion sequence element IS1086  90.57 
 
 		 1020 bp  65.9  0.00000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0066    83.51 
 
 		 631 bp  65.9  0.00000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3555  Integrase catalytic region  87.69 
 
 		 954 bp  65.9  0.00000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0003326  hitchhiker  0.00163359 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1529  integrase catalytic subunit  91.67 
 
 		 1029 bp  63.9  0.0000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.016356  hitchhiker  0.00474191 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1592  integrase catalytic subunit  91.67 
 
 		 1029 bp  63.9  0.0000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00550293  normal  0.214322 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2382  integrase catalytic subunit  91.67 
 
 		 1029 bp  63.9  0.0000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000024142  hitchhiker  0.0000200818 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4122  transposase IS1088  91.67 
 
 		 1029 bp  63.9  0.0000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.618296  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4207  transposase IS1088  91.67 
 
 		 1029 bp  63.9  0.0000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.302839  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4418  transposase IS1088  91.67 
 
 		 1029 bp  63.9  0.0000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0182446  normal  0.486351 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4463  transposase IS1088  91.67 
 
 		 1029 bp  63.9  0.0000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.985118  normal  0.0492126 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5718  transposase IS1088  91.67 
 
 		 1029 bp  63.9  0.0000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5755  transposase IS1088  91.67 
 
 		 1029 bp  63.9  0.0000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.335377  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4442  transposase, ISlxx5  89.29 
 
 		 285 bp  63.9  0.0000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9209    93.18 
 
 		 544 bp  63.9  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.919137 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0690  Integrase catalytic region  82.73 
 
 		 1230 bp  63.9  0.0000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01211  transposase and inactivated derivatives, IS30 family  89.29 
 
 		 435 bp  63.9  0.0000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1864    90.2 
 
 		 1154 bp  61.9  0.0000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0429575 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0883  integrase catalytic region  89.09 
 
 		 981 bp  61.9  0.0000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1557  integrase catalytic region  89.09 
 
 		 981 bp  61.9  0.0000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3004  integrase catalytic region  89.09 
 
 		 981 bp  61.9  0.0000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3005  integrase catalytic region  89.09 
 
 		 981 bp  61.9  0.0000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0064    100 
 
 		 594 bp  60  0.000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0481  integrase catalytic subunit  86.15 
 
 		 1206 bp  58  0.00001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.103123 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1990  integrase catalytic region  88.68 
 
 		 1020 bp  58  0.00001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.653928 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0582  integrase catalytic region  86.15 
 
 		 1401 bp  58  0.00001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00633094 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1446  integrase catalytic region  86.15 
 
 		 1401 bp  58  0.00001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1496  integrase catalytic region  86.15 
 
 		 1401 bp  58  0.00001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1722    86.15 
 
 		 3771 bp  58  0.00001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4088  Integrase catalytic region  87.72 
 
 		 1374 bp  58  0.00001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4011  integrase catalytic region  86.15 
 
 		 1401 bp  58  0.00001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5592  integrase catalytic region  86.15 
 
 		 1401 bp  58  0.00001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>