36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ksed_25120 on replicon NC_013169
Organism: Kytococcus sedentarius DSM 20547



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013169  Ksed_25120    100 
 
 		 964 bp  1911    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21080  transposase, IS30 family  87.85 
 
 		 1362 bp  109  1e-21  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.656818  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2030  integrase catalytic subunit  88.89 
 
 		 1440 bp  99.6  1e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0573  integrase catalytic subunit  88.89 
 
 		 1440 bp  99.6  1e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0572    88.89 
 
 		 2253 bp  99.6  1e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0065  integrase catalytic subunit  88.89 
 
 		 1440 bp  99.6  1e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20930  transpose, IS30 family  87.84 
 
 		 1443 bp  75.8  0.00000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00500  transposase, IS30 family  87.84 
 
 		 1443 bp  75.8  0.00000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3889  hypothetical protein  91.3 
 
 		 405 bp  60  0.000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3162  integrase catalytic subunit  91.11 
 
 		 906 bp  58  0.000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.116464  normal  0.334205 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1091    94.59 
 
 		 966 bp  58  0.000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1592  integrase catalytic subunit  94.59 
 
 		 753 bp  58  0.000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2029  hypothetical protein  94.59 
 
 		 339 bp  58  0.000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3565  integrase catalytic subunit  94.59 
 
 		 753 bp  58  0.000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2753  integrase catalytic subunit  94.59 
 
 		 762 bp  58  0.000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5430  integrase catalytic subunit  88.24 
 
 		 1245 bp  54  0.00008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  normal  0.270049 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_6004  integrase catalytic subunit  88.24 
 
 		 1314 bp  54  0.00008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000000366902 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5986  integrase catalytic subunit  88.24 
 
 		 1314 bp  54  0.00008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00996112 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5906  integrase catalytic subunit  88.24 
 
 		 1425 bp  54  0.00008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.872405  normal  0.876149 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5827  integrase catalytic subunit  88.24 
 
 		 1314 bp  54  0.00008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.382461 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5603  integrase catalytic subunit  88.24 
 
 		 1314 bp  54  0.00008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.155715  normal  1 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5505  integrase catalytic subunit  88.24 
 
 		 1425 bp  54  0.00008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.334264  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4666  integrase catalytic subunit  88.24 
 
 		 1425 bp  54  0.00008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4212  integrase catalytic subunit  94.12 
 
 		 906 bp  52  0.0003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.955324  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0930  integrase catalytic subunit  94.12 
 
 		 840 bp  52  0.0003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2594  integrase catalytic subunit  94.12 
 
 		 840 bp  52  0.0003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0806255  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0947  integrase catalytic subunit  94.12 
 
 		 840 bp  52  0.0003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1484  integrase catalytic subunit  94.12 
 
 		 840 bp  52  0.0003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0324114  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2638  integrase catalytic subunit  94.12 
 
 		 840 bp  52  0.0003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.220037  normal  0.89202 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0597  integrase, catalytic region  94.12 
 
 		 381 bp  52  0.0003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.603645  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3476  hypothetical protein  89.13 
 
 		 657 bp  52  0.0003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.184573 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02252  ISPsy21, transposase OrfB  89.13 
 
 		 687 bp  52  0.0003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03920  ISPsy21, transposase OrfB  89.13 
 
 		 513 bp  52  0.0003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.67034  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3846  integrase catalytic subunit  88.89 
 
 		 906 bp  50.1  0.001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.386301 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0735  ISMca3, transposase, OrfB  90 
 
 		 849 bp  48.1  0.005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.990065  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1896  ISMca3, transposase, OrfB  90 
 
 		 849 bp  48.1  0.005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>