More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_0597 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008146  Mmcs_0930  integrase catalytic subunit  100 
 
 
279 aa  263  5e-70  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2594  integrase catalytic subunit  100 
 
 
279 aa  263  5e-70  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0806255  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0947  integrase catalytic subunit  100 
 
 
279 aa  263  5e-70  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1484  integrase catalytic subunit  100 
 
 
279 aa  263  5e-70  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0324114  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2638  integrase catalytic subunit  100 
 
 
279 aa  263  5e-70  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.220037  normal  0.89202 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0597  integrase, catalytic region  100 
 
 
126 aa  262  1e-69  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.603645  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3192  putative transposase  82.54 
 
 
146 aa  215  2e-55  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3180  putative transposase  82.54 
 
 
146 aa  215  2e-55  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.36857  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3242  putative transposase  82.54 
 
 
146 aa  215  2e-55  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14010  transposase  74.19 
 
 
219 aa  191  2e-48  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2528  Integrase catalytic region  57.14 
 
 
301 aa  141  3e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000000564647  hitchhiker  0.00383779 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3483  Integrase catalytic region  57.14 
 
 
301 aa  141  3e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00971742  hitchhiker  0.00375901 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3608  Integrase catalytic region  57.14 
 
 
301 aa  141  3e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0251528  normal  0.0493713 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1236  Integrase catalytic region  54.17 
 
 
291 aa  139  9.999999999999999e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.305005 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0740  Integrase catalytic region  64.08 
 
 
285 aa  134  5e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0332591  normal  0.114218 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6067  transposase catalytic site ISRme15  64.08 
 
 
285 aa  134  5e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.415785 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5541  transposase catalytic site ISRme15  64.08 
 
 
285 aa  134  5e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0008  Integrase catalytic region  64.08 
 
 
285 aa  134  5e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.230626  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1826  Integrase catalytic region  64.08 
 
 
285 aa  134  5e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.456922  normal  0.0211966 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11780  transposase  60.58 
 
 
294 aa  132  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  8.89938e-72  hitchhiker  0.00000000193173 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10852  transposase  60.58 
 
 
294 aa  132  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  5.901690000000001e-44  decreased coverage  0.0000000161998 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13132  transposase  60.58 
 
 
294 aa  132  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000174572  normal  0.138383 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12048  transposase  60.58 
 
 
294 aa  132  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  1.2114e-18  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11785  transposase  60.58 
 
 
294 aa  132  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  6.8775e-79  hitchhiker  0.0000000184324 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12416  transposase  60.58 
 
 
294 aa  132  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  1.46754e-28  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12381  transposase  60.58 
 
 
294 aa  132  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  1.55066e-37  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11348  transposase  60.58 
 
 
278 aa  132  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  4.0645000000000005e-27  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11773  transposase  60.58 
 
 
294 aa  132  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  1.63075e-23  hitchhiker  0.0000000024473 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12378  transposase  60.58 
 
 
294 aa  132  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  2.6977900000000003e-18  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11806  transposase  60.58 
 
 
294 aa  132  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  2.55346e-33  hitchhiker  0.00499729 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12114  hypothetical protein  60.58 
 
 
294 aa  132  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  6.76426e-46  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13206  transposase  60.58 
 
 
294 aa  132  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  2.3114300000000003e-18  normal  0.570802 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12828  transposase  60.58 
 
 
294 aa  132  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  1.44608e-31  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13357  transposase  60.58 
 
 
294 aa  132  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  3.77516e-37  normal  0.294919 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1204  Integrase catalytic region  59.62 
 
 
288 aa  132  1.9999999999999998e-30  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11792  transposase  60.58 
 
 
294 aa  132  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  3.87208e-50  hitchhiker  0.00000308071 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11739  transposase  60.58 
 
 
294 aa  132  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  3.46568e-46  normal  0.519629 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2222  integrase catalytic subunit  60.55 
 
 
278 aa  131  3e-30  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.21419  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3255  Integrase catalytic region  62.75 
 
 
283 aa  130  5e-30  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4441  integrase catalytic region  61.68 
 
 
284 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5555  integrase catalytic region  61.68 
 
 
284 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.884215 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5064  integrase catalytic region  61.68 
 
 
284 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5344  integrase catalytic region  61.68 
 
 
284 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.438366  normal  0.0855179 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1426  Integrase catalytic region  62.75 
 
 
304 aa  128  3e-29  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0450418  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3846  integrase catalytic subunit  61.17 
 
 
301 aa  128  3e-29  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.386301 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5122  integrase catalytic subunit  60.71 
 
 
282 aa  127  5.0000000000000004e-29  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.184507 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5204  integrase catalytic subunit  60.71 
 
 
282 aa  127  5.0000000000000004e-29  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.184454  normal  0.989225 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1572  integrase, catalytic region  57.41 
 
 
301 aa  127  7.000000000000001e-29  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2120  integrase, catalytic region  57.41 
 
 
301 aa  127  7.000000000000001e-29  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.824405  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2937  integrase catalytic subunit  56.64 
 
 
299 aa  127  8.000000000000001e-29  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.529853  normal  0.799386 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2709  integrase catalytic subunit  56.64 
 
 
299 aa  127  8.000000000000001e-29  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9838  transposase  60.4 
 
 
301 aa  125  1.0000000000000001e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3162  integrase catalytic subunit  60.19 
 
 
301 aa  126  1.0000000000000001e-28  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.116464  normal  0.334205 
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9898  transposase  60.4 
 
 
301 aa  125  1.0000000000000001e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2820  Integrase catalytic region  57.14 
 
 
304 aa  125  2.0000000000000002e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3705  integrase catalytic region  55.56 
 
 
301 aa  125  2.0000000000000002e-28  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3736  integrase catalytic region  55.56 
 
 
301 aa  125  2.0000000000000002e-28  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0760  integrase catalytic subunit  59.41 
 
 
244 aa  125  2.0000000000000002e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0907  integrase catalytic subunit  61.39 
 
 
304 aa  125  3e-28  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010518  Mrad2831_6463  integrase catalytic region  58.42 
 
 
301 aa  125  3e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  0.666389 
 
 
-
 
NC_010517  Mrad2831_6426  integrase catalytic region  58.42 
 
 
301 aa  125  3e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5725  integrase catalytic region  57.14 
 
 
303 aa  124  4.0000000000000003e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4953  integrase catalytic region  62.75 
 
 
283 aa  124  6e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2977  Tn4652, transposase subunit B  54.63 
 
 
301 aa  121  4e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0471013 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4212  integrase catalytic subunit  57.43 
 
 
301 aa  121  4e-27  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.955324  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0735  ISMca3, transposase, OrfB  58.42 
 
 
282 aa  117  6e-26  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.990065  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1896  ISMca3, transposase, OrfB  58.42 
 
 
282 aa  117  6e-26  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0665  integrase catalytic subunit  53.7 
 
 
308 aa  117  7.999999999999999e-26  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1639  integrase catalytic subunit  53.7 
 
 
189 aa  116  9e-26  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1216  Integrase catalytic region  51.33 
 
 
311 aa  115  3e-25  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5582  integrase catalytic subunit  51.28 
 
 
304 aa  114  5e-25  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0423164  normal 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5587  integrase catalytic subunit  51.28 
 
 
304 aa  114  5e-25  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.123613  normal 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5653  integrase catalytic subunit  51.28 
 
 
304 aa  114  5e-25  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.225588  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1471  integrase catalytic subunit  53.33 
 
 
166 aa  113  8.999999999999998e-25  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.394095  normal  0.129997 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2753  integrase catalytic subunit  54.05 
 
 
253 aa  110  5e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1592  integrase catalytic subunit  54.05 
 
 
250 aa  110  6e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3565  integrase catalytic subunit  54.05 
 
 
250 aa  110  6e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2258  IS629 transposase orfB  53 
 
 
296 aa  109  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0041  IS629, transposase orfB  54 
 
 
295 aa  109  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1664  IS1203 transposase orfB  52 
 
 
296 aa  109  2.0000000000000002e-23  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4763  IS1203 transposase orfB  49.11 
 
 
296 aa  108  2.0000000000000002e-23  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4791  IS1203 transposase orfB  52 
 
 
296 aa  109  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.2388 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4591  IS629, transposase orfB  54 
 
 
296 aa  109  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.987029  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2932  IS629, transposase orfB  54 
 
 
296 aa  109  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.529947  hitchhiker  0.00000000000000217145 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2286  IS629, transposase orfB  54 
 
 
296 aa  109  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.292769  hitchhiker  5.1383e-16 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4771  IS1203 transposase orfB  54 
 
 
296 aa  109  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.220432  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3516  IS629, transposase orfB  54 
 
 
296 aa  109  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.0367503 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2492  IS629, transposase orfB  50.48 
 
 
295 aa  108  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2789  IS629, transposase orfB  54 
 
 
296 aa  109  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.194228  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2843  IS629, transposase orfB  54 
 
 
296 aa  109  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.69714 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1657  IS629, transposase orfB  54 
 
 
296 aa  109  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.000000216946  normal 
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0035  IS629, transposase orfB  50.48 
 
 
295 aa  108  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3874  IS629, transposase orfB  54 
 
 
296 aa  109  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.816642 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4642  IS629 transposase orfB  49.11 
 
 
296 aa  108  2.0000000000000002e-23  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.835933  n/a   
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0102  IS629, transposase orfB  50.48 
 
 
295 aa  108  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.147873  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0291  IS629, transposase orfB  54 
 
 
296 aa  109  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.638063 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1170  IS629, transposase orfB  54 
 
 
296 aa  109  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.728097  normal  0.563398 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1178  IS629, transposase orfB  54 
 
 
296 aa  109  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3232  IS629, transposase orfB  54 
 
 
296 aa  109  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.312429  hitchhiker  0.000944743 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3386  IS629, transposase orfB  54 
 
 
296 aa  109  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>