More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmcs_2594 on replicon NC_008146
Organism: Mycobacterium sp. MCS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008146  Mmcs_0930  integrase catalytic subunit  100 
 
 
279 aa  577  1e-164  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2594  integrase catalytic subunit  100 
 
 
279 aa  577  1e-164  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0806255  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0947  integrase catalytic subunit  100 
 
 
279 aa  577  1e-164  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1484  integrase catalytic subunit  100 
 
 
279 aa  577  1e-164  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0324114  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2638  integrase catalytic subunit  100 
 
 
279 aa  577  1e-164  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.220037  normal  0.89202 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5973  integrase catalytic subunit  83.09 
 
 
219 aa  355  5.999999999999999e-97  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.429012  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0599  integrase, catalytic region  100 
 
 
163 aa  307  1.0000000000000001e-82  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14010  transposase  77.72 
 
 
219 aa  298  5e-80  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12378  transposase  55.93 
 
 
294 aa  291  8e-78  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  2.6977900000000003e-18  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12381  transposase  55.93 
 
 
294 aa  291  8e-78  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  1.55066e-37  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12828  transposase  55.93 
 
 
294 aa  291  8e-78  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  1.44608e-31  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11785  transposase  55.93 
 
 
294 aa  291  8e-78  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  6.8775e-79  hitchhiker  0.0000000184324 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11780  transposase  55.93 
 
 
294 aa  291  8e-78  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  8.89938e-72  hitchhiker  0.00000000193173 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11773  transposase  55.93 
 
 
294 aa  291  8e-78  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  1.63075e-23  hitchhiker  0.0000000024473 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11806  transposase  55.93 
 
 
294 aa  291  8e-78  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  2.55346e-33  hitchhiker  0.00499729 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11792  transposase  55.93 
 
 
294 aa  291  8e-78  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  3.87208e-50  hitchhiker  0.00000308071 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12114  hypothetical protein  55.93 
 
 
294 aa  291  8e-78  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  6.76426e-46  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12048  transposase  55.93 
 
 
294 aa  291  8e-78  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  1.2114e-18  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11739  transposase  55.93 
 
 
294 aa  291  8e-78  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  3.46568e-46  normal  0.519629 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10852  transposase  55.93 
 
 
294 aa  291  8e-78  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  5.901690000000001e-44  decreased coverage  0.0000000161998 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13132  transposase  55.93 
 
 
294 aa  291  8e-78  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000174572  normal  0.138383 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12416  transposase  55.93 
 
 
294 aa  291  8e-78  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  1.46754e-28  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13357  transposase  55.93 
 
 
294 aa  291  8e-78  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  3.77516e-37  normal  0.294919 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13206  transposase  55.93 
 
 
294 aa  291  8e-78  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  2.3114300000000003e-18  normal  0.570802 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11348  transposase  55.93 
 
 
278 aa  291  9e-78  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  4.0645000000000005e-27  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1204  Integrase catalytic region  53.7 
 
 
288 aa  288  8e-77  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3608  Integrase catalytic region  52.69 
 
 
301 aa  287  2e-76  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0251528  normal  0.0493713 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2528  Integrase catalytic region  52.69 
 
 
301 aa  287  2e-76  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000000564647  hitchhiker  0.00383779 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3483  Integrase catalytic region  52.69 
 
 
301 aa  287  2e-76  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00971742  hitchhiker  0.00375901 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1236  Integrase catalytic region  52.33 
 
 
291 aa  285  4e-76  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.305005 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5122  integrase catalytic subunit  55.12 
 
 
282 aa  283  2.0000000000000002e-75  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.184507 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5204  integrase catalytic subunit  55.12 
 
 
282 aa  283  2.0000000000000002e-75  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.184454  normal  0.989225 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2222  integrase catalytic subunit  53.82 
 
 
278 aa  280  3e-74  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.21419  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5725  integrase catalytic region  54.61 
 
 
303 aa  277  1e-73  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2977  Tn4652, transposase subunit B  55.78 
 
 
301 aa  276  2e-73  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0471013 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4441  integrase catalytic region  53.96 
 
 
284 aa  275  5e-73  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5344  integrase catalytic region  53.96 
 
 
284 aa  275  5e-73  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.438366  normal  0.0855179 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5064  integrase catalytic region  53.96 
 
 
284 aa  275  5e-73  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5555  integrase catalytic region  53.96 
 
 
284 aa  275  5e-73  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.884215 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0740  Integrase catalytic region  57.14 
 
 
285 aa  275  8e-73  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0332591  normal  0.114218 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6067  transposase catalytic site ISRme15  57.14 
 
 
285 aa  275  8e-73  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.415785 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5541  transposase catalytic site ISRme15  57.14 
 
 
285 aa  275  8e-73  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1826  Integrase catalytic region  57.14 
 
 
285 aa  275  8e-73  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.456922  normal  0.0211966 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0008  Integrase catalytic region  57.14 
 
 
285 aa  275  8e-73  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.230626  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2820  Integrase catalytic region  53.87 
 
 
304 aa  273  3e-72  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1216  Integrase catalytic region  52.22 
 
 
311 aa  272  4.0000000000000004e-72  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3846  integrase catalytic subunit  53.45 
 
 
301 aa  271  9e-72  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.386301 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0907  integrase catalytic subunit  53.51 
 
 
304 aa  270  2e-71  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3255  Integrase catalytic region  54.41 
 
 
283 aa  269  2.9999999999999997e-71  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1426  Integrase catalytic region  52.94 
 
 
304 aa  267  2e-70  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0450418  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3162  integrase catalytic subunit  51.82 
 
 
301 aa  267  2e-70  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.116464  normal  0.334205 
 
 
-
 
NC_010517  Mrad2831_6426  integrase catalytic region  51.47 
 
 
301 aa  265  8.999999999999999e-70  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010518  Mrad2831_6463  integrase catalytic region  51.47 
 
 
301 aa  265  8.999999999999999e-70  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  0.666389 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4953  integrase catalytic region  53.62 
 
 
283 aa  263  2e-69  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0597  integrase, catalytic region  100 
 
 
126 aa  263  2e-69  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.603645  normal 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3736  integrase catalytic region  50 
 
 
301 aa  262  4e-69  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3705  integrase catalytic region  50 
 
 
301 aa  262  4e-69  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2709  integrase catalytic subunit  50 
 
 
299 aa  261  1e-68  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2937  integrase catalytic subunit  50 
 
 
299 aa  261  1e-68  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.529853  normal  0.799386 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0735  ISMca3, transposase, OrfB  52.21 
 
 
282 aa  258  7e-68  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.990065  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1896  ISMca3, transposase, OrfB  52.21 
 
 
282 aa  258  7e-68  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1572  integrase, catalytic region  51.1 
 
 
301 aa  258  1e-67  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2120  integrase, catalytic region  51.1 
 
 
301 aa  258  1e-67  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.824405  normal 
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9838  transposase  48.53 
 
 
301 aa  256  2e-67  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9898  transposase  48.53 
 
 
301 aa  256  2e-67  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3180  putative transposase  84.35 
 
 
146 aa  256  3e-67  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.36857  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3242  putative transposase  84.35 
 
 
146 aa  256  3e-67  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3192  putative transposase  84.35 
 
 
146 aa  256  3e-67  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4212  integrase catalytic subunit  49.26 
 
 
301 aa  256  4e-67  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.955324  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3288  Integrase catalytic region  49.25 
 
 
320 aa  250  2e-65  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15130  transposase  52.51 
 
 
304 aa  247  1e-64  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0124781  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0665  integrase catalytic subunit  48.73 
 
 
308 aa  245  6.999999999999999e-64  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4791  IS1203 transposase orfB  48.34 
 
 
296 aa  244  9.999999999999999e-64  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.2388 
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0035  IS629, transposase orfB  48.19 
 
 
295 aa  244  9.999999999999999e-64  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2258  IS629 transposase orfB  48.71 
 
 
296 aa  244  9.999999999999999e-64  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1664  IS1203 transposase orfB  48.34 
 
 
296 aa  244  9.999999999999999e-64  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0297  IS629 transposase orfB  48.34 
 
 
296 aa  243  3e-63  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000478745  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0221  IS629 transposase orfB  48.34 
 
 
296 aa  243  3e-63  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1240  IS1203 transposase orfB  48.34 
 
 
296 aa  243  3e-63  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.605  n/a   
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0102  IS629, transposase orfB  47.46 
 
 
295 aa  242  3.9999999999999997e-63  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.147873  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1303  IS629, transposase orfB  47.83 
 
 
295 aa  242  3.9999999999999997e-63  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1379  IS629, transposase orfB  47.83 
 
 
295 aa  242  3.9999999999999997e-63  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.822294  normal  0.0945096 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2680  IS629, transposase orfB  47.83 
 
 
295 aa  242  3.9999999999999997e-63  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00648038  normal  0.0200158 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0102  IS629 transposase orfB  48.71 
 
 
295 aa  242  3.9999999999999997e-63  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0471323  hitchhiker  0.000157883 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3874  IS629, transposase orfB  48.71 
 
 
296 aa  241  7e-63  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.816642 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4591  IS629, transposase orfB  48.71 
 
 
296 aa  241  7e-63  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.987029  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4771  IS1203 transposase orfB  48.71 
 
 
296 aa  241  7e-63  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.220432  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3232  IS629, transposase orfB  48.71 
 
 
296 aa  241  7e-63  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.312429  hitchhiker  0.000944743 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3516  IS629, transposase orfB  48.71 
 
 
296 aa  241  7e-63  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.0367503 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3386  IS629, transposase orfB  48.71 
 
 
296 aa  241  7e-63  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1170  IS629, transposase orfB  48.71 
 
 
296 aa  241  7e-63  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.728097  normal  0.563398 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0291  IS629, transposase orfB  48.71 
 
 
296 aa  241  7e-63  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.638063 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1178  IS629, transposase orfB  48.71 
 
 
296 aa  241  7e-63  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1657  IS629, transposase orfB  48.71 
 
 
296 aa  241  7e-63  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.000000216946  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2286  IS629, transposase orfB  48.71 
 
 
296 aa  241  7e-63  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.292769  hitchhiker  5.1383e-16 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2789  IS629, transposase orfB  48.71 
 
 
296 aa  241  7e-63  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.194228  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2843  IS629, transposase orfB  48.71 
 
 
296 aa  241  7e-63  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.69714 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4763  IS1203 transposase orfB  48.34 
 
 
296 aa  241  7e-63  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4642  IS629 transposase orfB  48.34 
 
 
296 aa  241  7e-63  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.835933  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2932  IS629, transposase orfB  48.71 
 
 
296 aa  241  7e-63  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.529947  hitchhiker  0.00000000000000217145 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>