20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_1091 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_0572    100 
 
 		 2253 bp  880    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1091    100 
 
 		 966 bp  1915    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1592  integrase catalytic subunit  100 
 
 		 753 bp  1493    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2031    100 
 
 		 480 bp  880    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2753  integrase catalytic subunit  100 
 
 		 762 bp  1511    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3565  integrase catalytic subunit  100 
 
 		 753 bp  1493    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2029  hypothetical protein  100 
 
 		 339 bp  618  1e-175  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0066    82.2 
 
 		 631 bp  67.9  0.000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7300    94.59 
 
 		 562 bp  58  0.000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0130484  hitchhiker  0.00884242 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25120    94.59 
 
 		 964 bp  58  0.000005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3198  carbamoyl phosphate synthase large subunit  100 
 
 		 3393 bp  52  0.0003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.00397433  normal  1 
 
 
-
 
NC_010517  Mrad2831_6426  integrase catalytic region  85.96 
 
 		 906 bp  50.1  0.001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010518  Mrad2831_6463  integrase catalytic region  85.96 
 
 		 906 bp  50.1  0.001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  0.666389 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2528  Integrase catalytic region  85.71 
 
 		 906 bp  48.1  0.005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000000564647  hitchhiker  0.00383779 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3608  Integrase catalytic region  85.71 
 
 		 906 bp  48.1  0.005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0251528  normal  0.0493713 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3483  Integrase catalytic region  85.71 
 
 		 906 bp  48.1  0.005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00971742  hitchhiker  0.00375901 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1572  integrase, catalytic region  88.64 
 
 		 906 bp  48.1  0.005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2043    85.71 
 
 		 2389 bp  48.1  0.005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.153153  hitchhiker  0.00767267 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1236  Integrase catalytic region  85.71 
 
 		 876 bp  48.1  0.005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.305005 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2120  integrase, catalytic region  88.64 
 
 		 906 bp  48.1  0.005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.824405  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>