38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ksed_21090 on replicon NC_013169
Organism: Kytococcus sedentarius DSM 20547



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013169  Ksed_23540  transposase  99.49 
 
 		 873 bp  1146    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23470    98.22 
 
 		 844 bp  1027    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21090    100 
 
 		 693 bp  1374    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20160  transposase  98.48 
 
 		 873 bp  1100    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.204187  normal  0.0283567 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18720  transposase  96.44 
 
 		 873 bp  1003    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17780    98.22 
 
 		 226 bp  406  1e-111  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.657265  normal  0.461539 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2437    91.67 
 
 		 249 bp  111  3e-22  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000416756 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0572    88.42 
 
 		 2253 bp  101  3e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3645  Integrase catalytic region  81.25 
 
 		 861 bp  95.6  2e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3351  integrase catalytic subunit  83.11 
 
 		 864 bp  95.6  2e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.335506  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1932  integrase catalytic subunit  83.11 
 
 		 864 bp  95.6  2e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  decreased coverage  0.00436726  normal  0.0854041 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3211  integrase catalytic subunit  88.51 
 
 		 867 bp  93.7  6e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17800    97.73 
 
 		 2354 bp  79.8  0.000000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.750484  normal  0.695499 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4506  Integrase catalytic region  82.68 
 
 		 867 bp  77.8  0.000000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.126933 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2595  Integrase catalytic region  82.09 
 
 		 888 bp  75.8  0.00000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0065  integrase catalytic subunit  92.31 
 
 		 1440 bp  71.9  0.0000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2030  integrase catalytic subunit  92.31 
 
 		 1440 bp  71.9  0.0000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0573  integrase catalytic subunit  92.31 
 
 		 1440 bp  71.9  0.0000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10250  hypothetical protein  89.83 
 
 		 147 bp  69.9  0.0000000009  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03410  transposase  86.76 
 
 		 867 bp  63.9  0.00000006  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3476  hypothetical protein  93.02 
 
 		 657 bp  61.9  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.184573 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0625    87.1 
 
 		 396 bp  60  0.0000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5987  hypothetical protein  96.97 
 
 		 765 bp  58  0.000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00129837 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0711    94.59 
 
 		 3753 bp  58  0.000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3195  integrase catalytic subunit  88.46 
 
 		 858 bp  56  0.00001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0240069  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5959  integrase catalytic subunit  88.46 
 
 		 858 bp  56  0.00001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.637785  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10270  transposase  85.94 
 
 		 666 bp  56  0.00001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1094  integrase catalytic subunit  88.46 
 
 		 858 bp  56  0.00001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5602  putative transposase for insertion element IS6110 (second part)  100 
 
 		 831 bp  54  0.00005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.384176  normal  0.976486 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0801  Integrase catalytic region  100 
 
 		 876 bp  54  0.00005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5828  putative transposase for insertion element IS6110 (second part)  100 
 
 		 831 bp  54  0.00005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.313966 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_6003  putative transposase for insertion element IS6110 (second part)  100 
 
 		 831 bp  54  0.00005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000000813488 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5431  putative transposase for insertion element IS6110 (second part)  100 
 
 		 831 bp  54  0.00005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  normal  0.15452 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0648  hypothetical protein  92.11 
 
 		 921 bp  52  0.0002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05310    81 
 
 		 830 bp  48.1  0.003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2569    82.89 
 
 		 513 bp  48.1  0.003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.266812  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0425    93.75 
 
 		 2179 bp  48.1  0.003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2756    100 
 
 		 657 bp  48.1  0.003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.811497 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>