30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_2756 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_4468  hypothetical protein  99.85 
 
 		 804 bp  1294    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.504952  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3068  integrase catalytic region  99.68 
 
 		 915 bp  1233    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.559211  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2756    100 
 
 		 657 bp  1302    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.811497 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2753  integrase, catalytic region  99.09 
 
 		 741 bp  1255    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.584748 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1384  integrase catalytic region  99.84 
 
 		 915 bp  1241    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5602  putative transposase for insertion element IS6110 (second part)  100 
 
 		 831 bp  54  0.00005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.384176  normal  0.976486 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0711    100 
 
 		 3753 bp  54  0.00005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17800    100 
 
 		 2354 bp  54  0.00005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.750484  normal  0.695499 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5431  putative transposase for insertion element IS6110 (second part)  100 
 
 		 831 bp  54  0.00005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  normal  0.15452 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5828  putative transposase for insertion element IS6110 (second part)  100 
 
 		 831 bp  54  0.00005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.313966 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5987  hypothetical protein  100 
 
 		 765 bp  54  0.00005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00129837 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_6003  putative transposase for insertion element IS6110 (second part)  100 
 
 		 831 bp  54  0.00005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000000813488 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3089  integrase catalytic region  84.62 
 
 		 891 bp  50.1  0.0008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.175977  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4642  integrase catalytic subunit  83.82 
 
 		 906 bp  48.1  0.003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21090    100 
 
 		 693 bp  48.1  0.003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1066    83.82 
 
 		 2897 bp  48.1  0.003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.233561 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1068  integrase catalytic subunit  83.82 
 
 		 906 bp  48.1  0.003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.322448 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1614  integrase catalytic subunit  83.82 
 
 		 906 bp  48.1  0.003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.341708  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5497  integrase catalytic subunit  83.82 
 
 		 906 bp  48.1  0.003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.295724  normal  0.115233 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2243  integrase catalytic subunit  83.82 
 
 		 906 bp  48.1  0.003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0365379  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4633  integrase catalytic subunit  83.82 
 
 		 906 bp  48.1  0.003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.915347 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4620  integrase catalytic subunit  83.82 
 
 		 906 bp  48.1  0.003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3700  integrase catalytic subunit  83.82 
 
 		 906 bp  48.1  0.003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.484261  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3688  integrase catalytic subunit  83.82 
 
 		 906 bp  48.1  0.003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.70228  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0620  integrase catalytic subunit  83.82 
 
 		 906 bp  48.1  0.003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0574  integrase catalytic subunit  83.82 
 
 		 906 bp  48.1  0.003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.344122  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2863  integrase catalytic subunit  83.82 
 
 		 906 bp  48.1  0.003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.147732  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2862    83.82 
 
 		 5864 bp  48.1  0.003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.427752  normal  0.514681 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2371  integrase catalytic subunit  83.82 
 
 		 906 bp  48.1  0.003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.576276 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2369    83.82 
 
 		 3548 bp  48.1  0.003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.182688  normal  0.675739 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>