More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mkms_5828 on replicon NC_008704
Organism: Mycobacterium sp. KMS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008147  Mmcs_5431  putative transposase for insertion element IS6110 (second part)  100 
 
 		 276 aa  560  1e-158  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  normal  0.15452 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5602  putative transposase for insertion element IS6110 (second part)  100 
 
 		 276 aa  560  1e-158  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.384176  normal  0.976486 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5828  putative transposase for insertion element IS6110 (second part)  100 
 
 		 276 aa  560  1e-158  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.313966 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_6003  putative transposase for insertion element IS6110 (second part)  100 
 
 		 276 aa  560  1e-158  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000000813488 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2788  integrase catalytic subunit  85.17 
 
 		 317 aa  402  1e-111  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.319514 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5444  integrase catalytic subunit  85.17 
 
 		 317 aa  402  1e-111  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.724901  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3221  integrase catalytic subunit  84.75 
 
 		 375 aa  399  9.999999999999999e-111  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0559107  normal  0.357261 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4646  hypothetical protein  84.32 
 
 		 303 aa  395  1e-109  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4622  Integrase catalytic region  69.44 
 
 		 317 aa  304  9.000000000000001e-82  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0989982  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4235  Integrase catalytic region  69.44 
 
 		 317 aa  304  9.000000000000001e-82  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1404  Integrase catalytic region  69.44 
 
 		 317 aa  304  9.000000000000001e-82  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0981822  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0741  Integrase catalytic region  69.44 
 
 		 317 aa  304  9.000000000000001e-82  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0380  Integrase catalytic region  69.44 
 
 		 317 aa  304  9.000000000000001e-82  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4080  Integrase catalytic region  69.44 
 
 		 317 aa  304  9.000000000000001e-82  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1895  Integrase catalytic region  69.44 
 
 		 317 aa  304  9.000000000000001e-82  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.571703  n/a   
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5987  hypothetical protein  54.69 
 
 		 254 aa  251  8.000000000000001e-66  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00129837 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0665  integrase catalytic subunit  52.86 
 
 		 308 aa  206  3e-52  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12828  transposase  49.55 
 
 		 294 aa  203  2e-51  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  1.44608e-31  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12381  transposase  49.55 
 
 		 294 aa  203  2e-51  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  1.55066e-37  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12416  transposase  49.55 
 
 		 294 aa  203  2e-51  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  1.46754e-28  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13206  transposase  49.55 
 
 		 294 aa  203  2e-51  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  2.3114300000000003e-18  normal  0.570802 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13132  transposase  49.55 
 
 		 294 aa  203  2e-51  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000174572  normal  0.138383 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12378  transposase  49.55 
 
 		 294 aa  203  2e-51  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  2.6977900000000003e-18  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13357  transposase  49.55 
 
 		 294 aa  203  2e-51  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  3.77516e-37  normal  0.294919 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10852  transposase  49.55 
 
 		 294 aa  203  2e-51  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  5.901690000000001e-44  decreased coverage  0.0000000161998 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11739  transposase  49.55 
 
 		 294 aa  203  2e-51  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  3.46568e-46  normal  0.519629 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11773  transposase  49.55 
 
 		 294 aa  203  2e-51  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  1.63075e-23  hitchhiker  0.0000000024473 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11780  transposase  49.55 
 
 		 294 aa  203  2e-51  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  8.89938e-72  hitchhiker  0.00000000193173 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11785  transposase  49.55 
 
 		 294 aa  203  2e-51  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  6.8775e-79  hitchhiker  0.0000000184324 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11792  transposase  49.55 
 
 		 294 aa  203  2e-51  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  3.87208e-50  hitchhiker  0.00000308071 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11806  transposase  49.55 
 
 		 294 aa  203  2e-51  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  2.55346e-33  hitchhiker  0.00499729 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12048  transposase  49.55 
 
 		 294 aa  203  2e-51  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  1.2114e-18  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12114  hypothetical protein  49.55 
 
 		 294 aa  203  2e-51  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  6.76426e-46  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3483  Integrase catalytic region  51.49 
 
 		 301 aa  185  6e-46  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00971742  hitchhiker  0.00375901 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2528  Integrase catalytic region  51.49 
 
 		 301 aa  185  6e-46  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000000564647  hitchhiker  0.00383779 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3608  Integrase catalytic region  51.49 
 
 		 301 aa  185  6e-46  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0251528  normal  0.0493713 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11348  transposase  48.53 
 
 		 278 aa  179  4.999999999999999e-44  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  4.0645000000000005e-27  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2222  integrase catalytic subunit  50 
 
 		 278 aa  172  5e-42  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.21419  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1204  Integrase catalytic region  46.82 
 
 		 288 aa  169  4e-41  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3288  Integrase catalytic region  44.7 
 
 		 320 aa  168  7e-41  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1236  Integrase catalytic region  50.52 
 
 		 291 aa  168  8e-41  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.305005 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3301  Integrase catalytic region  45.1 
 
 		 312 aa  157  2e-37  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.408224  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2895  Integrase catalytic region  45.1 
 
 		 312 aa  157  2e-37  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1216  Integrase catalytic region  41.7 
 
 		 311 aa  156  3e-37  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010518  Mrad2831_6463  integrase catalytic region  43.95 
 
 		 301 aa  151  1e-35  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  0.666389 
 
 
-
 
NC_010517  Mrad2831_6426  integrase catalytic region  43.95 
 
 		 301 aa  151  1e-35  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2820  Integrase catalytic region  42.67 
 
 		 304 aa  149  4e-35  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3476  hypothetical protein  42.79 
 
 		 218 aa  148  8e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.184573 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5725  integrase catalytic region  42.48 
 
 		 303 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0907  integrase catalytic subunit  41.78 
 
 		 304 aa  147  1.0000000000000001e-34  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1426  Integrase catalytic region  43.5 
 
 		 304 aa  147  2.0000000000000003e-34  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0450418  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02252  ISPsy21, transposase OrfB  43.56 
 
 		 228 aa  146  4.0000000000000006e-34  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4212  integrase catalytic subunit  40.91 
 
 		 301 aa  146  4.0000000000000006e-34  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.955324  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02392  ISPsy21, transposase OrfB  43.56 
 
 		 257 aa  146  4.0000000000000006e-34  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.406166  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0008  Integrase catalytic region  45.86 
 
 		 285 aa  145  7.0000000000000006e-34  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.230626  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1826  Integrase catalytic region  45.86 
 
 		 285 aa  145  7.0000000000000006e-34  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.456922  normal  0.0211966 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6067  transposase catalytic site ISRme15  45.86 
 
 		 285 aa  145  7.0000000000000006e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.415785 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5541  transposase catalytic site ISRme15  45.86 
 
 		 285 aa  145  7.0000000000000006e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0740  Integrase catalytic region  45.86 
 
 		 285 aa  145  7.0000000000000006e-34  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0332591  normal  0.114218 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5122  integrase catalytic subunit  44.23 
 
 		 282 aa  145  1e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.184507 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5204  integrase catalytic subunit  44.23 
 
 		 282 aa  145  1e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.184454  normal  0.989225 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4953  integrase catalytic region  44.5 
 
 		 283 aa  144  2e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2977  Tn4652, transposase subunit B  40.99 
 
 		 301 aa  143  3e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0471013 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3846  integrase catalytic subunit  42.2 
 
 		 301 aa  142  5e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.386301 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3705  integrase catalytic region  42.08 
 
 		 301 aa  142  6e-33  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3736  integrase catalytic region  42.08 
 
 		 301 aa  142  6e-33  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1177  Integrase catalytic region  43.22 
 
 		 322 aa  141  9.999999999999999e-33  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1173  Integrase catalytic region  43.22 
 
 		 322 aa  141  9.999999999999999e-33  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4660  Integrase catalytic region  43.22 
 
 		 322 aa  141  9.999999999999999e-33  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2801  Integrase catalytic region  43.22 
 
 		 322 aa  141  9.999999999999999e-33  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0160717  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2588  Integrase catalytic region  43.22 
 
 		 322 aa  141  9.999999999999999e-33  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2658  Integrase catalytic region  43.22 
 
 		 322 aa  141  9.999999999999999e-33  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0819  Integrase catalytic region  43.22 
 
 		 322 aa  141  9.999999999999999e-33  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0737  Integrase catalytic region  43.22 
 
 		 322 aa  141  9.999999999999999e-33  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1739  Integrase catalytic region  43.22 
 
 		 322 aa  141  9.999999999999999e-33  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0682469  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0367  Integrase catalytic region  43.22 
 
 		 322 aa  141  9.999999999999999e-33  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3430  Integrase catalytic region  42.57 
 
 		 309 aa  141  9.999999999999999e-33  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2258  IS629 transposase orfB  40.36 
 
 		 296 aa  141  9.999999999999999e-33  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0364  Integrase catalytic region  43.22 
 
 		 322 aa  141  9.999999999999999e-33  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1597  Integrase catalytic region  40 
 
 		 301 aa  140  1.9999999999999998e-32  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.369801  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4663  Integrase catalytic region  42.57 
 
 		 309 aa  140  1.9999999999999998e-32  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2615  Integrase catalytic region  42.57 
 
 		 309 aa  140  1.9999999999999998e-32  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4701  Integrase catalytic region  42.57 
 
 		 309 aa  140  1.9999999999999998e-32  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1753  Integrase catalytic region  40 
 
 		 301 aa  140  1.9999999999999998e-32  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.289897  normal  0.869594 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2811  Integrase catalytic region  42.57 
 
 		 309 aa  140  1.9999999999999998e-32  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.675485  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2169  Integrase catalytic region  42.57 
 
 		 309 aa  140  1.9999999999999998e-32  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.401099  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4732  Integrase catalytic region  42.57 
 
 		 309 aa  140  1.9999999999999998e-32  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1663  Integrase catalytic region  40 
 
 		 301 aa  140  1.9999999999999998e-32  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3614  Integrase catalytic region  42.57 
 
 		 309 aa  140  1.9999999999999998e-32  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2513  Integrase catalytic region  40 
 
 		 301 aa  140  1.9999999999999998e-32  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.298059 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5555  integrase catalytic region  43.87 
 
 		 284 aa  140  3e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.884215 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5344  integrase catalytic region  43.87 
 
 		 284 aa  140  3e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.438366  normal  0.0855179 
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0221  IS629 transposase orfB  40.36 
 
 		 296 aa  140  3e-32  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0208  IS629 transposase orfB  40.36 
 
 		 296 aa  140  3e-32  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5064  integrase catalytic region  43.87 
 
 		 284 aa  140  3e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4441  integrase catalytic region  43.87 
 
 		 284 aa  140  3e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1240  IS1203 transposase orfB  40.36 
 
 		 296 aa  140  3e-32  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.605  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1664  IS1203 transposase orfB  40.36 
 
 		 296 aa  140  3e-32  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0297  IS629 transposase orfB  40.36 
 
 		 296 aa  140  3e-32  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000478745  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0247  IS629 transposase orfB  40.09 
 
 		 296 aa  139  6e-32  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.45525  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>