26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_0425 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_0426  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  100 
 
 		 1092 bp  2165    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0425    100 
 
 		 2179 bp  4320    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2595  Integrase catalytic region  89.55 
 
 		 888 bp  77.8  0.00000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1533  integrase catalytic subunit  82.76 
 
 		 816 bp  71.9  0.0000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.522585  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2153  integrase catalytic subunit  82.76 
 
 		 816 bp  71.9  0.0000000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00525672 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1510  integrase catalytic subunit  82.76 
 
 		 816 bp  71.9  0.0000000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4384    90.57 
 
 		 833 bp  65.9  0.00000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0221  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  96.97 
 
 		 1047 bp  58  0.00001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3289  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  96.97 
 
 		 1047 bp  58  0.00001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000246247  hitchhiker  0.00945293 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2060  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  96.97 
 
 		 1047 bp  58  0.00001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000000298499  normal  0.0142271 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2006  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  96.97 
 
 		 1047 bp  58  0.00001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00873285  hitchhiker  0.00397123 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1872  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  96.97 
 
 		 1047 bp  58  0.00001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.137932  hitchhiker  0.00933127 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1275  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  96.97 
 
 		 1047 bp  58  0.00001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.455752  normal  0.806138 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1198  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  96.97 
 
 		 1047 bp  58  0.00001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0759  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  96.97 
 
 		 1047 bp  58  0.00001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0034  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  96.97 
 
 		 1047 bp  58  0.00001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4443  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  92.31 
 
 		 444 bp  54  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3415  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  92.31 
 
 		 528 bp  54  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0470    92.31 
 
 		 767 bp  54  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3117    90.7 
 
 		 249 bp  54  0.0002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0779473  normal  0.23199 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3645  Integrase catalytic region  92.31 
 
 		 861 bp  54  0.0002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4649  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  89.13 
 
 		 1113 bp  52  0.0007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7055  hypothetical protein  91.89 
 
 		 450 bp  50.1  0.003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.50306  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3351  integrase catalytic subunit  90.24 
 
 		 864 bp  50.1  0.003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.335506  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1932  integrase catalytic subunit  90.24 
 
 		 864 bp  50.1  0.003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  decreased coverage  0.00436726  normal  0.0854041 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0801  Integrase catalytic region  93.94 
 
 		 876 bp  50.1  0.003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>