204 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_4443 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009921  Franean1_4443  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  100 
 
 
147 aa  291  2e-78  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3415  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  94.51 
 
 
175 aa  169  1e-41  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5453  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  57.97 
 
 
359 aa  158  2e-38  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5540  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  57.97 
 
 
359 aa  158  2e-38  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.657394  normal  0.0244683 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4649  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  55.71 
 
 
370 aa  155  2e-37  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0221  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  55.56 
 
 
348 aa  152  2e-36  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1198  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  55.56 
 
 
348 aa  152  2e-36  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1872  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  55.56 
 
 
348 aa  152  2e-36  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.137932  hitchhiker  0.00933127 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1275  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  55.56 
 
 
348 aa  152  2e-36  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.455752  normal  0.806138 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2060  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  55.56 
 
 
348 aa  152  2e-36  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000000298499  normal  0.0142271 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2006  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  55.56 
 
 
348 aa  152  2e-36  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00873285  hitchhiker  0.00397123 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3289  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  55.56 
 
 
348 aa  152  2e-36  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000246247  hitchhiker  0.00945293 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0759  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  55.56 
 
 
348 aa  152  2e-36  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0034  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  55.56 
 
 
348 aa  152  2e-36  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3141  hypothetical protein  54.14 
 
 
141 aa  146  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1766  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  52.27 
 
 
354 aa  141  4e-33  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0961431  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20200  transposase  51.03 
 
 
378 aa  137  7e-32  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.12815 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2982  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  56.55 
 
 
327 aa  134  3.0000000000000003e-31  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000410087 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04230  transposase  50 
 
 
402 aa  132  1.9999999999999998e-30  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.389305  normal  0.67881 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00780  transposase  50.38 
 
 
402 aa  132  1.9999999999999998e-30  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0426  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  52.94 
 
 
363 aa  120  6e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11860  Transposase IS116/IS110/IS902 family  52.63 
 
 
356 aa  117  7e-26  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.378222  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3417  hypothetical protein  93.1 
 
 
72 aa  112  1.0000000000000001e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2085  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  46.26 
 
 
364 aa  99.8  1e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000256  normal  0.0160957 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2255  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  46.26 
 
 
364 aa  99.8  1e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000526829  normal  0.161762 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1662  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  50 
 
 
297 aa  89  2e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.518265  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2861  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  46.58 
 
 
422 aa  87  8e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0437077  normal  0.0549681 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10812  IS1547 transposase  41.5 
 
 
303 aa  84.7  4e-16  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.156779  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13359  transposase  41.5 
 
 
509 aa  84.7  4e-16  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  1.04338e-22  normal  0.800314 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0001  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  42.22 
 
 
352 aa  82.4  0.000000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.546417 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0450  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  42.22 
 
 
354 aa  82  0.000000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0689  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  42.2 
 
 
350 aa  82.4  0.000000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2305  hypothetical protein  65.12 
 
 
172 aa  62  0.000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.876507  normal  0.528766 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5809  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  28.77 
 
 
321 aa  56.2  0.0000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.911931  hitchhiker  0.000316639 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2824  transposase IS111A/IS1328/IS1533  32.62 
 
 
403 aa  56.6  0.0000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3501  transposase IS111A/IS1328/IS1533  32.62 
 
 
403 aa  56.6  0.0000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.487928  n/a   
 
 
-
 
NC_014159  Tpau_4269  transposase IS111A/IS1328/IS1533  32.62 
 
 
403 aa  56.6  0.0000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0375  transposase IS116/IS110/IS902  35.2 
 
 
401 aa  55.8  0.0000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3502  transposase IS116/IS110/IS902  35.2 
 
 
401 aa  55.8  0.0000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.573808  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4926  transposase IS116/IS110/IS902  35.2 
 
 
401 aa  55.8  0.0000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5506  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  35.2 
 
 
401 aa  55.8  0.0000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000281542 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5513  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  35.2 
 
 
401 aa  55.8  0.0000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  unclonable  0.000000000996402  decreased coverage  0.00000000098172 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5520  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  35.2 
 
 
401 aa  55.8  0.0000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.240252  hitchhiker  0.0000000689904 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5526  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  35.2 
 
 
401 aa  55.8  0.0000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.112316  hitchhiker  0.000000304553 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5538  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  35.2 
 
 
401 aa  55.8  0.0000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.25664  hitchhiker  0.000556456 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4091  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  35.2 
 
 
401 aa  55.8  0.0000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0416  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  35.2 
 
 
401 aa  55.8  0.0000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.255193 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1737  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  35.2 
 
 
401 aa  55.8  0.0000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.670519 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4200  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  35.2 
 
 
401 aa  55.8  0.0000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0654  transposase IS116/IS110/IS902  29.66 
 
 
328 aa  54.7  0.0000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3340  transposase IS116/IS110/IS902  29.66 
 
 
328 aa  54.7  0.0000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.451558  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1202  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  29.45 
 
 
321 aa  54.7  0.0000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0645698  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1817  transposase IS116/IS110/IS902  29.45 
 
 
321 aa  54.3  0.0000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2208  transposase IS116/IS110/IS902  29.45 
 
 
321 aa  54.3  0.0000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.146372  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3472  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  29.45 
 
 
321 aa  54.3  0.0000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4857  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  29.45 
 
 
321 aa  54.7  0.0000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.131589  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4049  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  29.45 
 
 
321 aa  54.3  0.0000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2433  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  29.45 
 
 
321 aa  54.7  0.0000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.382081  normal  0.945374 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0043  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  29.45 
 
 
321 aa  54.7  0.0000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.706965  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3523  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  28.08 
 
 
321 aa  53.9  0.0000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3440  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  28.08 
 
 
321 aa  53.9  0.0000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.830328 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4107  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  28.08 
 
 
321 aa  53.9  0.0000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.190664  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2238  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  28.08 
 
 
321 aa  53.9  0.0000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0045  IS111A/IS1328/IS1533/IS116/IS110/IS902 transposase  29.66 
 
 
318 aa  53.9  0.0000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0046  IS111A/IS1328/IS1533/IS116/IS110/IS902 transposase  29.66 
 
 
318 aa  53.9  0.0000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0094  IS111A/IS1328/IS1533/IS116/IS110/IS902 transposase  29.66 
 
 
318 aa  53.9  0.0000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.05206  hitchhiker  0.00363531 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0132  IS111A/IS1328/IS1533/IS116/IS110/IS902 transposase  29.66 
 
 
318 aa  53.9  0.0000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0760311  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0488  IS111A/IS1328/IS1533/IS116/IS110/IS902 transposase  29.66 
 
 
318 aa  53.9  0.0000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0670  IS111A/IS1328/IS1533/IS116/IS110/IS902 transposase  29.66 
 
 
318 aa  53.9  0.0000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.375238 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0723  IS111A/IS1328/IS1533/IS116/IS110/IS902 transposase  29.66 
 
 
318 aa  53.9  0.0000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0120706  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0958  IS111A/IS1328/IS1533/IS116/IS110/IS902 transposase  29.66 
 
 
318 aa  53.9  0.0000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1143  IS111A/IS1328/IS1533/IS116/IS110/IS902 transposase  29.66 
 
 
318 aa  53.9  0.0000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1718  IS111A/IS1328/IS1533/IS116/IS110/IS902 transposase  29.66 
 
 
318 aa  53.9  0.0000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00396754  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2073  IS111A/IS1328/IS1533/IS116/IS110/IS902 transposase  29.66 
 
 
318 aa  53.9  0.0000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000159022  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2810  IS111A/IS1328/IS1533/IS116/IS110/IS902 transposase  29.66 
 
 
318 aa  53.9  0.0000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2975  IS111A/IS1328/IS1533/IS116/IS110/IS902 transposase  29.66 
 
 
318 aa  53.9  0.0000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3429  IS111A/IS1328/IS1533/IS116/IS110/IS902 transposase  29.66 
 
 
318 aa  53.9  0.0000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1149  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  28.77 
 
 
320 aa  53.5  0.000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.852696  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1423  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  28.77 
 
 
320 aa  53.5  0.000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0743274  normal  0.675803 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1739  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  28.77 
 
 
320 aa  53.5  0.000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.106448  normal  0.0290423 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2894  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  28.77 
 
 
320 aa  53.5  0.000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.940801  normal  0.95279 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2923  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  28.77 
 
 
320 aa  53.5  0.000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.568531  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2982  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  28.77 
 
 
320 aa  53.5  0.000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.311525  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0519  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  28.77 
 
 
320 aa  53.1  0.000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.629332  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0858  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  28.77 
 
 
320 aa  53.1  0.000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1056  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  28.77 
 
 
320 aa  53.1  0.000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3543  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  28.77 
 
 
320 aa  53.1  0.000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.909049 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3848  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  28.77 
 
 
320 aa  53.1  0.000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.206363  normal  0.916901 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4601  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  28.77 
 
 
320 aa  53.1  0.000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0284  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  35.29 
 
 
316 aa  52.4  0.000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0292  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  35.29 
 
 
316 aa  52.4  0.000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.521347 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0543  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  35.29 
 
 
316 aa  52.4  0.000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.480832  normal  0.787142 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2213  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  35.29 
 
 
316 aa  52.4  0.000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0348953  normal  0.766307 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3185  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  35.29 
 
 
316 aa  52.4  0.000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3800  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  35.29 
 
 
316 aa  52.4  0.000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.834348  normal  0.687258 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4407  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  35.29 
 
 
316 aa  52.4  0.000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.497846 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4477  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  35.29 
 
 
316 aa  52.4  0.000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0159  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  25.47 
 
 
343 aa  51.6  0.000003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1021  hypothetical protein  25.47 
 
 
343 aa  51.6  0.000003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3066  transposase  25.71 
 
 
411 aa  50.4  0.000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000892616  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>