113 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_2060 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013235  Namu_0034  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  99.14 
 
 
348 aa  674    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0221  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  100 
 
 
348 aa  682    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0759  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  98.56 
 
 
348 aa  670    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1198  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  98.85 
 
 
348 aa  672    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1275  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  98.85 
 
 
348 aa  672    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.455752  normal  0.806138 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1872  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  98.85 
 
 
348 aa  672    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.137932  hitchhiker  0.00933127 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2006  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  100 
 
 
348 aa  682    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00873285  hitchhiker  0.00397123 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2060  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  100 
 
 
348 aa  682    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000000298499  normal  0.0142271 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3289  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  98.85 
 
 
348 aa  672    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000246247  hitchhiker  0.00945293 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5453  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  53.57 
 
 
359 aa  323  4e-87  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5540  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  53.57 
 
 
359 aa  323  4e-87  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.657394  normal  0.0244683 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20200  transposase  51.29 
 
 
378 aa  316  5e-85  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.12815 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1766  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  48.66 
 
 
354 aa  303  2.0000000000000002e-81  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0961431  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4649  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  49.11 
 
 
370 aa  278  9e-74  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2982  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  50.65 
 
 
327 aa  273  4.0000000000000004e-72  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000410087 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0426  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  48.94 
 
 
363 aa  256  4e-67  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00780  transposase  43.24 
 
 
402 aa  208  9e-53  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04230  transposase  42.9 
 
 
402 aa  202  7e-51  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.389305  normal  0.67881 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11860  Transposase IS116/IS110/IS902 family  40.92 
 
 
356 aa  184  2.0000000000000003e-45  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.378222  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2085  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  40.87 
 
 
364 aa  181  1e-44  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000256  normal  0.0160957 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2255  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  40.87 
 
 
364 aa  181  1e-44  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000526829  normal  0.161762 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0267  transposase IS3/IS911 family protein  42.45 
 
 
387 aa  177  3e-43  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.118178  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4443  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  55.56 
 
 
147 aa  152  1e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3141  hypothetical protein  53.54 
 
 
141 aa  144  2e-33  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2861  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  38.53 
 
 
422 aa  140  1.9999999999999998e-32  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0437077  normal  0.0549681 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3415  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  45.03 
 
 
175 aa  123  4e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0450  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  34.97 
 
 
354 aa  122  9.999999999999999e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0001  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  34.7 
 
 
352 aa  113  4.0000000000000004e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.546417 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0689  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  32.27 
 
 
350 aa  94.7  2e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1662  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  52.63 
 
 
297 aa  92  1e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.518265  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13359  transposase  34.89 
 
 
509 aa  79.7  0.00000000000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  1.04338e-22  normal  0.800314 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10812  IS1547 transposase  34.53 
 
 
303 aa  79  0.0000000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.156779  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1284  hypothetical protein  23.05 
 
 
333 aa  72.4  0.00000000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.159965 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1942  transposase, IS110 family, OrfB  20.35 
 
 
411 aa  68.6  0.0000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.245444  normal  0.115147 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2034  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  20.25 
 
 
411 aa  67.4  0.0000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0547551  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2305  hypothetical protein  34.64 
 
 
172 aa  65.1  0.000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.876507  normal  0.528766 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2850  transposase IS116/IS110/IS902  21.12 
 
 
418 aa  63.9  0.000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.516093  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1971  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  20.77 
 
 
411 aa  63.9  0.000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0214009  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2868  transposase IS116/IS110/IS902  21.52 
 
 
418 aa  62.8  0.000000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.666774  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3066  transposase  20 
 
 
411 aa  62.4  0.00000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000892616  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3417  hypothetical protein  47.3 
 
 
72 aa  61.2  0.00000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1983  transposase IS116/IS110/IS902  22.11 
 
 
394 aa  60.8  0.00000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0159  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  22.54 
 
 
343 aa  60.5  0.00000004  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1021  hypothetical protein  22.54 
 
 
343 aa  60.5  0.00000004  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2223  transposase, IS110 family, OrfA  20.1 
 
 
412 aa  60.1  0.00000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.92844e-48 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2182  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  26.33 
 
 
426 aa  58.2  0.0000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3002  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  26.33 
 
 
426 aa  58.2  0.0000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2076  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  26.33 
 
 
426 aa  58.2  0.0000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1121  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  26.33 
 
 
426 aa  58.5  0.0000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0073  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  26.33 
 
 
426 aa  58.2  0.0000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0220  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  26.33 
 
 
426 aa  58.2  0.0000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2989  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  26.33 
 
 
426 aa  57.4  0.0000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2349  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  26.33 
 
 
426 aa  57.4  0.0000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2099  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  26.33 
 
 
426 aa  57.4  0.0000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1864  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  25.57 
 
 
426 aa  57.4  0.0000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000939746  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0156  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  26.33 
 
 
426 aa  57.4  0.0000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2054  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  26.33 
 
 
426 aa  57.4  0.0000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2089  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  25.82 
 
 
426 aa  56.6  0.0000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000334168  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1035  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  26.08 
 
 
426 aa  56.6  0.0000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1995  IS110 family transposase  28.99 
 
 
337 aa  55.8  0.000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00496148  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1111  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  25.38 
 
 
426 aa  54.7  0.000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2024  transposase IS116/IS110/IS902  19.34 
 
 
396 aa  55.1  0.000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000259984  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0352  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  25.57 
 
 
426 aa  55.1  0.000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000000129716  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0865  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  25.57 
 
 
426 aa  55.1  0.000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000000503575  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1326  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  25.57 
 
 
426 aa  55.1  0.000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000722082  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1369  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  25.57 
 
 
426 aa  55.1  0.000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000000016519  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1542  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  25.32 
 
 
426 aa  54.7  0.000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000639136  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1551  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  25.32 
 
 
426 aa  54.7  0.000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000000273211  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1699  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  25.57 
 
 
426 aa  55.1  0.000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000000352786  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2047  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  25.57 
 
 
426 aa  55.1  0.000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000000186467  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2083  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  25.32 
 
 
426 aa  54.7  0.000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000000470228  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2389  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  25.57 
 
 
426 aa  55.1  0.000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000000133705  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2046  IS110 family transposase OrfA  28.26 
 
 
257 aa  54.3  0.000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.599145  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2202  IS110 family transposase orfa  28.26 
 
 
257 aa  54.3  0.000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0728  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  25.32 
 
 
426 aa  53.9  0.000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000000210486  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0911  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  25.32 
 
 
426 aa  53.9  0.000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000000518715  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1023  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  25.32 
 
 
426 aa  53.9  0.000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000543141  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0480  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  31.71 
 
 
406 aa  53.5  0.000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11250  hypothetical protein  49.28 
 
 
91 aa  52  0.00001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1379  hypothetical protein  21.57 
 
 
342 aa  50.1  0.00005  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0963  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  22.91 
 
 
427 aa  49.7  0.00008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4661  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  22.91 
 
 
427 aa  49.7  0.00008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1271  hypothetical protein  24.04 
 
 
296 aa  48.5  0.0001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.238657 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1046  transposase, IS111A/IS1328/IS1533  25.15 
 
 
316 aa  47.8  0.0003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.113216  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1261  transposase, IS111A/IS1328/IS1533  25.15 
 
 
316 aa  47.8  0.0003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.812718 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1426  transposase, IS111A/IS1328/IS1533  25.15 
 
 
316 aa  47.8  0.0003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0372411  normal  0.895779 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2597  transposase, IS111A/IS1328/IS1533  25.15 
 
 
316 aa  47.8  0.0003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3883  transposase, IS111A/IS1328/IS1533  25.15 
 
 
316 aa  47.8  0.0003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.53968  normal  0.241341 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4991  transposase, IS111A/IS1328/IS1533  25.15 
 
 
316 aa  47.8  0.0003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1462  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  24.2 
 
 
321 aa  47.4  0.0004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1633  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  24.2 
 
 
321 aa  47.4  0.0004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0380198  normal  0.28668 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1820  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  24.2 
 
 
321 aa  47.4  0.0004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.161882  normal  0.193325 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2268  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  24.2 
 
 
321 aa  47.4  0.0004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2554  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  24.2 
 
 
321 aa  47.4  0.0004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.964231  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2882  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  24.2 
 
 
321 aa  47.4  0.0004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3243  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  24.2 
 
 
321 aa  47.4  0.0004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2112  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  28.96 
 
 
325 aa  47  0.0005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.838809 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3615  transposase IS111A/IS1328/IS1533  27.76 
 
 
326 aa  46.6  0.0006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.457809  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4772  transposase IS111A/IS1328/IS1533  27.76 
 
 
326 aa  46.6  0.0006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.286106  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5245  transposase IS111A/IS1328/IS1533  27.76 
 
 
326 aa  46.6  0.0006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.39153  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>