111 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_2085 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013235  Namu_2255  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  100 
 
 
364 aa  727    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000526829  normal  0.161762 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2085  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  100 
 
 
364 aa  727    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000256  normal  0.0160957 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11860  Transposase IS116/IS110/IS902 family  41.92 
 
 
356 aa  200  3e-50  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.378222  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4649  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  37.89 
 
 
370 aa  192  1e-47  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1766  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  38.15 
 
 
354 aa  189  9e-47  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0961431  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2060  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  40.87 
 
 
348 aa  185  1.0000000000000001e-45  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000000298499  normal  0.0142271 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2006  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  40.87 
 
 
348 aa  185  1.0000000000000001e-45  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00873285  hitchhiker  0.00397123 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0221  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  40.87 
 
 
348 aa  185  1.0000000000000001e-45  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2861  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  41.67 
 
 
422 aa  182  7e-45  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0437077  normal  0.0549681 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1872  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  40.58 
 
 
348 aa  181  1e-44  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.137932  hitchhiker  0.00933127 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1275  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  40.58 
 
 
348 aa  181  1e-44  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.455752  normal  0.806138 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3289  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  40.58 
 
 
348 aa  181  1e-44  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000246247  hitchhiker  0.00945293 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1198  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  40.58 
 
 
348 aa  181  1e-44  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0034  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  40.29 
 
 
348 aa  182  1e-44  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0759  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  40.29 
 
 
348 aa  181  1e-44  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5453  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  39.37 
 
 
359 aa  176  6e-43  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5540  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  39.37 
 
 
359 aa  175  9.999999999999999e-43  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.657394  normal  0.0244683 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20200  transposase  35.99 
 
 
378 aa  164  2.0000000000000002e-39  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.12815 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2982  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  41.94 
 
 
327 aa  162  6e-39  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000410087 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00780  transposase  37.72 
 
 
402 aa  149  6e-35  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04230  transposase  37.13 
 
 
402 aa  142  7e-33  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.389305  normal  0.67881 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0426  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  38.44 
 
 
363 aa  142  9.999999999999999e-33  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4443  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  46.26 
 
 
147 aa  112  8.000000000000001e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3141  hypothetical protein  44 
 
 
141 aa  105  1e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0267  transposase IS3/IS911 family protein  33.82 
 
 
387 aa  103  4e-21  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.118178  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0450  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  31.78 
 
 
354 aa  99  1e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0001  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  32.05 
 
 
352 aa  95.5  1e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.546417 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1662  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  60 
 
 
297 aa  95.1  1e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.518265  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0689  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  29.93 
 
 
350 aa  90.9  3e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3415  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  38.37 
 
 
175 aa  86.3  7e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13359  transposase  32.12 
 
 
509 aa  78.2  0.0000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  1.04338e-22  normal  0.800314 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10812  IS1547 transposase  32.12 
 
 
303 aa  76.6  0.0000000000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.156779  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2997  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  22.6 
 
 
346 aa  55.1  0.000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.00357301  n/a   
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0067  IS110 family transposase  22.69 
 
 
323 aa  52  0.00001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.0110214 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1149  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  25.29 
 
 
320 aa  50.1  0.00006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.852696  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1423  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  25.29 
 
 
320 aa  50.1  0.00006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0743274  normal  0.675803 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1739  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  25.29 
 
 
320 aa  50.1  0.00006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.106448  normal  0.0290423 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2894  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  25.29 
 
 
320 aa  50.1  0.00006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.940801  normal  0.95279 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2923  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  25.29 
 
 
320 aa  50.1  0.00006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.568531  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2982  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  25.29 
 
 
320 aa  50.1  0.00006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.311525  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1462  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  25.41 
 
 
321 aa  50.1  0.00006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1633  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  25.41 
 
 
321 aa  50.1  0.00006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0380198  normal  0.28668 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1820  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  25.41 
 
 
321 aa  50.1  0.00006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.161882  normal  0.193325 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2268  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  25.41 
 
 
321 aa  50.1  0.00006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2554  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  25.41 
 
 
321 aa  50.1  0.00006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.964231  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2882  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  25.41 
 
 
321 aa  50.1  0.00006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3243  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  25.41 
 
 
321 aa  50.1  0.00006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0045  IS111A/IS1328/IS1533/IS116/IS110/IS902 transposase  23.8 
 
 
318 aa  49.7  0.00008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0046  IS111A/IS1328/IS1533/IS116/IS110/IS902 transposase  23.8 
 
 
318 aa  49.7  0.00008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0094  IS111A/IS1328/IS1533/IS116/IS110/IS902 transposase  23.8 
 
 
318 aa  49.7  0.00008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.05206  hitchhiker  0.00363531 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0132  IS111A/IS1328/IS1533/IS116/IS110/IS902 transposase  23.8 
 
 
318 aa  49.7  0.00008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0760311  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0488  IS111A/IS1328/IS1533/IS116/IS110/IS902 transposase  23.8 
 
 
318 aa  49.7  0.00008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0670  IS111A/IS1328/IS1533/IS116/IS110/IS902 transposase  23.8 
 
 
318 aa  49.7  0.00008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.375238 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0723  IS111A/IS1328/IS1533/IS116/IS110/IS902 transposase  23.8 
 
 
318 aa  49.7  0.00008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0120706  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0958  IS111A/IS1328/IS1533/IS116/IS110/IS902 transposase  23.8 
 
 
318 aa  49.7  0.00008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1143  IS111A/IS1328/IS1533/IS116/IS110/IS902 transposase  23.8 
 
 
318 aa  49.7  0.00008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1718  IS111A/IS1328/IS1533/IS116/IS110/IS902 transposase  23.8 
 
 
318 aa  49.7  0.00008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00396754  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2073  IS111A/IS1328/IS1533/IS116/IS110/IS902 transposase  23.8 
 
 
318 aa  49.7  0.00008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000159022  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2810  IS111A/IS1328/IS1533/IS116/IS110/IS902 transposase  23.8 
 
 
318 aa  49.7  0.00008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2975  IS111A/IS1328/IS1533/IS116/IS110/IS902 transposase  23.8 
 
 
318 aa  49.7  0.00008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3429  IS111A/IS1328/IS1533/IS116/IS110/IS902 transposase  23.8 
 
 
318 aa  49.7  0.00008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2770  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  25.76 
 
 
316 aa  49.3  0.00009  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.175769  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2778  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  25.76 
 
 
316 aa  49.3  0.00009  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.335835  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2757  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  25.76 
 
 
316 aa  48.9  0.0001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  unclonable  0.00000451562  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2486  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  25.08 
 
 
355 aa  48.5  0.0002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  decreased coverage  0.0095339  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1379  hypothetical protein  23.73 
 
 
342 aa  46.6  0.0007  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2112  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  26.41 
 
 
325 aa  45.8  0.001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.838809 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0736  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  25.5 
 
 
317 aa  44.7  0.002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  decreased coverage  0.000627011  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3060  transposase IS116/IS110/IS902  28.79 
 
 
383 aa  45.1  0.002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.137931  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0519  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  23.53 
 
 
320 aa  44.7  0.002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.629332  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0858  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  23.53 
 
 
320 aa  44.7  0.002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1056  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  23.53 
 
 
320 aa  44.7  0.002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3543  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  23.53 
 
 
320 aa  44.7  0.002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.909049 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3848  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  23.53 
 
 
320 aa  44.7  0.002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.206363  normal  0.916901 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4601  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  23.53 
 
 
320 aa  44.7  0.002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5206  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  25.9 
 
 
345 aa  44.7  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0981183  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2024  transposase IS116/IS110/IS902  22.86 
 
 
396 aa  44.7  0.003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000259984  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2238  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  26.21 
 
 
321 aa  44.3  0.004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3440  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  26.21 
 
 
321 aa  44.3  0.004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.830328 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3523  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  26.21 
 
 
321 aa  44.3  0.004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4107  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  26.21 
 
 
321 aa  44.3  0.004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.190664  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2345  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  23.83 
 
 
316 aa  43.9  0.005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0159  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  25.26 
 
 
343 aa  43.5  0.006  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1021  hypothetical protein  25.26 
 
 
343 aa  43.5  0.006  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2425  transposase IS111A/IS1328/IS1533  27.7 
 
 
399 aa  43.1  0.007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3945  IS110 family transposase  27.14 
 
 
344 aa  43.1  0.008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4548  IS110 family transposase  27.14 
 
 
344 aa  43.1  0.008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0419  IS621, transposase  24.86 
 
 
326 aa  42.7  0.009  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0718  IS621, transposase  24.86 
 
 
326 aa  42.7  0.009  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000540983  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0878  IS621, transposase  24.86 
 
 
326 aa  42.7  0.009  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1035  IS621, transposase  24.86 
 
 
326 aa  42.7  0.009  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.709382  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1120  IS621, transposase  24.86 
 
 
326 aa  42.7  0.009  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1814  IS621, transposase  24.86 
 
 
326 aa  42.7  0.009  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3109  IS621, transposase  24.86 
 
 
326 aa  42.7  0.009  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4118  IS621, transposase  24.86 
 
 
326 aa  42.7  0.009  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4179  IS621, transposase  24.86 
 
 
326 aa  42.7  0.009  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4386  IS621, transposase  24.86 
 
 
326 aa  42.7  0.009  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4472  IS621, transposase  24.86 
 
 
326 aa  42.7  0.009  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4498  IS621, transposase  24.86 
 
 
326 aa  42.7  0.009  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0005  IS621, transposase  24.86 
 
 
326 aa  42.7  0.009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.854592  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>