261 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_2861 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009380  Strop_2861  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  100 
 
 
422 aa  835    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0437077  normal  0.0549681 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1662  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  97.49 
 
 
297 aa  391  1e-107  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.518265  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11860  Transposase IS116/IS110/IS902 family  55.68 
 
 
356 aa  332  6e-90  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.378222  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2085  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  42.82 
 
 
364 aa  200  5e-50  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000256  normal  0.0160957 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2255  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  42.82 
 
 
364 aa  200  5e-50  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000526829  normal  0.161762 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20200  transposase  39.01 
 
 
378 aa  180  4.999999999999999e-44  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.12815 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00780  transposase  39.36 
 
 
402 aa  176  6e-43  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3289  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  39.82 
 
 
348 aa  168  1e-40  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000246247  hitchhiker  0.00945293 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0759  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  39.82 
 
 
348 aa  168  1e-40  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1275  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  39.82 
 
 
348 aa  168  1e-40  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.455752  normal  0.806138 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1872  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  39.82 
 
 
348 aa  168  1e-40  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.137932  hitchhiker  0.00933127 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1198  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  39.82 
 
 
348 aa  168  1e-40  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04230  transposase  38.12 
 
 
402 aa  167  2.9999999999999998e-40  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.389305  normal  0.67881 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0034  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  39.53 
 
 
348 aa  166  8e-40  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2006  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  39.53 
 
 
348 aa  165  1.0000000000000001e-39  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00873285  hitchhiker  0.00397123 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2060  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  39.53 
 
 
348 aa  165  1.0000000000000001e-39  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000000298499  normal  0.0142271 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0221  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  39.53 
 
 
348 aa  165  1.0000000000000001e-39  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1766  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  36.26 
 
 
354 aa  157  4e-37  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0961431  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2982  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  41.55 
 
 
327 aa  150  3e-35  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000410087 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4649  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  37.18 
 
 
370 aa  148  2.0000000000000003e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5540  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  36.93 
 
 
359 aa  147  4.0000000000000006e-34  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.657394  normal  0.0244683 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5453  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  37.01 
 
 
359 aa  146  6e-34  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0426  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  35.45 
 
 
363 aa  125  1e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0450  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  31.03 
 
 
354 aa  119  7.999999999999999e-26  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0001  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  30.75 
 
 
352 aa  114  3e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.546417 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4443  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  46.58 
 
 
147 aa  112  1.0000000000000001e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3141  hypothetical protein  44.19 
 
 
141 aa  107  3e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0689  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  30 
 
 
350 aa  97.4  4e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13359  transposase  34.22 
 
 
509 aa  95.1  2e-18  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  1.04338e-22  normal  0.800314 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10812  IS1547 transposase  34.11 
 
 
303 aa  95.1  2e-18  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.156779  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3415  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  39.16 
 
 
175 aa  82  0.00000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1379  hypothetical protein  20.06 
 
 
342 aa  63.2  0.000000009  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0267  transposase IS3/IS911 family protein  30.31 
 
 
387 aa  62.8  0.00000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.118178  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1021  hypothetical protein  19.88 
 
 
343 aa  60.1  0.00000008  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0159  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  19.88 
 
 
343 aa  60.1  0.00000008  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2401  transposase IS110 family protein  29.06 
 
 
343 aa  59.3  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4410  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  29.76 
 
 
397 aa  57.8  0.0000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3160  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  24.54 
 
 
399 aa  57.8  0.0000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.846497  normal  0.201189 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21750  transposase  26.85 
 
 
408 aa  55.8  0.000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.747437  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4694  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  24.3 
 
 
403 aa  55.8  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.275408  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1197  transposase, IS111A/IS1328/IS1533  25.45 
 
 
406 aa  55.5  0.000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.353838  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD0276  prophage LambdaW1, IS110 family transposase  21.9 
 
 
340 aa  54.7  0.000003  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.290854  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12160  transposase  26.85 
 
 
408 aa  54.7  0.000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.145073  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2112  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  29.57 
 
 
325 aa  54.7  0.000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.838809 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3125  transposase, IS111A/IS1328/IS1533  25.8 
 
 
320 aa  53.1  0.000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000618983  unclonable  0.000014067 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0488  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  20.3 
 
 
433 aa  52.8  0.00001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000137882  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3315  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  20.3 
 
 
433 aa  52.8  0.00001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.579778  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0814  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  20.3 
 
 
433 aa  52.8  0.00001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00371841  n/a   
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6452  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  27.68 
 
 
340 aa  52.4  0.00002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.147811  normal  0.356209 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4472  IS621, transposase  24.5 
 
 
326 aa  51.2  0.00003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1601  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  38.14 
 
 
310 aa  51.6  0.00003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.806368  normal  0.405689 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1120  IS621, transposase  24.5 
 
 
326 aa  51.2  0.00003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2554  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  22.41 
 
 
321 aa  51.2  0.00003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.964231  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0375  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  38.14 
 
 
310 aa  51.6  0.00003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3309  transposase, IS111A/IS1328/IS1533  24.92 
 
 
320 aa  51.2  0.00003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4386  IS621, transposase  24.5 
 
 
326 aa  51.2  0.00003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4118  IS621, transposase  24.5 
 
 
326 aa  51.2  0.00003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2558  transposase, IS111A/IS1328/IS1533  24.92 
 
 
320 aa  51.2  0.00003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0803  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  38.14 
 
 
310 aa  51.6  0.00003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.43209  normal  0.389634 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4179  IS621, transposase  24.5 
 
 
326 aa  51.2  0.00003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1228  transposase  24.5 
 
 
326 aa  51.2  0.00003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0655964  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3002  IS621, transposase  24.5 
 
 
326 aa  51.2  0.00003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4039  IS621, transposase  24.5 
 
 
326 aa  51.2  0.00003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4419  IS621, transposase  24.5 
 
 
326 aa  51.2  0.00003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4700  IS621, transposase  24.5 
 
 
326 aa  51.2  0.00003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4815  IS621, transposase  24.5 
 
 
326 aa  51.2  0.00003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2915  transposase, IS111A/IS1328/IS1533  25.24 
 
 
320 aa  51.6  0.00003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2894  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  38.14 
 
 
310 aa  51.6  0.00003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4498  IS621, transposase  24.5 
 
 
326 aa  51.2  0.00003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0005  IS621, transposase  24.5 
 
 
326 aa  51.2  0.00003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.854592  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0891  IS621, transposase  24.5 
 
 
326 aa  51.2  0.00003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.732659  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3720  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  38.14 
 
 
309 aa  51.6  0.00003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0419  IS621, transposase  24.5 
 
 
326 aa  51.2  0.00003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0196  IS621, transposase  24.5 
 
 
326 aa  51.2  0.00003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.878007  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0718  IS621, transposase  24.5 
 
 
326 aa  51.2  0.00003  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000540983  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1035  IS621, transposase  24.5 
 
 
326 aa  51.2  0.00003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.709382  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0878  IS621, transposase  24.5 
 
 
326 aa  51.2  0.00003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1814  IS621, transposase  24.5 
 
 
326 aa  51.2  0.00003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2122  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  38.14 
 
 
310 aa  51.2  0.00003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.382641  normal  0.260587 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1848  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  38.14 
 
 
310 aa  51.6  0.00003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.202718 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2567  IS621, transposase  24.5 
 
 
326 aa  51.2  0.00003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3929  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  38.14 
 
 
310 aa  51.2  0.00003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.613698  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3109  IS621, transposase  24.5 
 
 
326 aa  51.2  0.00003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4131  IS111A/IS1328/IS1533  23.36 
 
 
309 aa  51.2  0.00004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0485642  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3936  transposase IS116/IS110/IS902  28.77 
 
 
343 aa  51.2  0.00004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3457  IS621, transposase  24.5 
 
 
326 aa  50.8  0.00004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0131  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  38.14 
 
 
323 aa  50.8  0.00004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.482202 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0198  IS621, transposase  24.5 
 
 
326 aa  50.8  0.00004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.410947  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3691  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  38.14 
 
 
323 aa  50.8  0.00004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.687432 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5211  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  27.5 
 
 
319 aa  50.8  0.00005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.313194  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2843  transposase, IS111A/IS1328/IS1533  25.56 
 
 
320 aa  50.8  0.00005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2661  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  25.52 
 
 
344 aa  50.4  0.00005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0894966  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3359  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  30.24 
 
 
342 aa  50.4  0.00006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3243  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  22.41 
 
 
321 aa  50.1  0.00007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1462  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  22.41 
 
 
321 aa  50.1  0.00007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2268  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  22.41 
 
 
321 aa  50.1  0.00007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2882  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  22.41 
 
 
321 aa  50.1  0.00007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1633  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  22.41 
 
 
321 aa  50.1  0.00007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0380198  normal  0.28668 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1820  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  22.41 
 
 
321 aa  50.1  0.00007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.161882  normal  0.193325 
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4092  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  27.75 
 
 
343 aa  50.1  0.00008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.293783 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>