35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_1662 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_1662  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  100 
 
 		 297 aa  595  1e-169  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.518265  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2861  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  97.49 
 
 		 422 aa  390  1e-107  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0437077  normal  0.0549681 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11860  Transposase IS116/IS110/IS902 family  66 
 
 		 356 aa  136  3.0000000000000003e-31  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.378222  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00780  transposase  59.38 
 
 		 402 aa  125  6e-28  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04230  transposase  55.21 
 
 		 402 aa  117  3e-25  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.389305  normal  0.67881 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2982  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  58.24 
 
 		 327 aa  113  5e-24  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000410087 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3289  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  53.68 
 
 		 348 aa  107  2e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000246247  hitchhiker  0.00945293 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1872  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  53.68 
 
 		 348 aa  107  2e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.137932  hitchhiker  0.00933127 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1275  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  53.68 
 
 		 348 aa  107  2e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.455752  normal  0.806138 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1198  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  53.68 
 
 		 348 aa  107  2e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0759  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  53.68 
 
 		 348 aa  107  2e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4649  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  60.23 
 
 		 370 aa  107  2e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3141  hypothetical protein  49.04 
 
 		 141 aa  105  9e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0221  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  52.63 
 
 		 348 aa  105  1e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0034  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  52.63 
 
 		 348 aa  105  1e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2006  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  52.63 
 
 		 348 aa  105  1e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00873285  hitchhiker  0.00397123 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2060  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  52.63 
 
 		 348 aa  105  1e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000000298499  normal  0.0142271 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4443  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  50 
 
 		 147 aa  102  9e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5453  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  50 
 
 		 359 aa  102  9e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5540  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  50 
 
 		 359 aa  102  1e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.657394  normal  0.0244683 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20200  transposase  60 
 
 		 378 aa  100  2e-20  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.12815 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2085  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  60 
 
 		 364 aa  95.5  9e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000256  normal  0.0160957 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2255  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  60 
 
 		 364 aa  95.5  9e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000526829  normal  0.161762 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1766  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  48.31 
 
 		 354 aa  92  1e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0961431  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0426  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  61.18 
 
 		 363 aa  82.8  0.000000000000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0689  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  40 
 
 		 350 aa  67.4  0.0000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0450  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  40.66 
 
 		 354 aa  63.9  0.000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0001  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  40.66 
 
 		 352 aa  63.9  0.000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.546417 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10812  IS1547 transposase  43.43 
 
 		 303 aa  60.8  0.00000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.156779  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13359  transposase  43.43 
 
 		 509 aa  60.8  0.00000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  1.04338e-22  normal  0.800314 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3415  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  53.06 
 
 		 175 aa  51.6  0.00001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2305  hypothetical protein  54.55 
 
 		 172 aa  51.6  0.00002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.876507  normal  0.528766 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3417  hypothetical protein  46.43 
 
 		 72 aa  50.8  0.00003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0267  transposase IS3/IS911 family protein  34.26 
 
 		 387 aa  49.7  0.00007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.118178  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0276  prophage LambdaW1, IS110 family transposase  31.33 
 
 		 340 aa  42.4  0.009  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.290854  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>