120 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_4649 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009921  Franean1_4649  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  100 
 
 
370 aa  747    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0426  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  55.81 
 
 
363 aa  316  3e-85  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20200  transposase  45.38 
 
 
378 aa  282  6.000000000000001e-75  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.12815 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1766  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  46.45 
 
 
354 aa  279  6e-74  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0961431  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0034  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  48.82 
 
 
348 aa  265  8e-70  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0221  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  49.11 
 
 
348 aa  265  8e-70  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2006  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  49.11 
 
 
348 aa  265  8e-70  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00873285  hitchhiker  0.00397123 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2060  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  49.11 
 
 
348 aa  265  8e-70  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000000298499  normal  0.0142271 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0759  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  48.52 
 
 
348 aa  262  6e-69  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1198  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  48.82 
 
 
348 aa  262  6e-69  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1275  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  48.82 
 
 
348 aa  262  6e-69  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.455752  normal  0.806138 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1872  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  48.82 
 
 
348 aa  262  6e-69  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.137932  hitchhiker  0.00933127 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3289  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  48.82 
 
 
348 aa  262  6e-69  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000246247  hitchhiker  0.00945293 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5540  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  47.06 
 
 
359 aa  259  7e-68  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.657394  normal  0.0244683 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5453  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  46.76 
 
 
359 aa  257  2e-67  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2982  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  48.57 
 
 
327 aa  237  3e-61  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000410087 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00780  transposase  39.77 
 
 
402 aa  198  1.0000000000000001e-49  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04230  transposase  40.23 
 
 
402 aa  194  1e-48  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.389305  normal  0.67881 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2085  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  37.89 
 
 
364 aa  178  1e-43  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000256  normal  0.0160957 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2255  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  37.89 
 
 
364 aa  178  1e-43  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000526829  normal  0.161762 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11860  Transposase IS116/IS110/IS902 family  40.23 
 
 
356 aa  171  1e-41  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.378222  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0267  transposase IS3/IS911 family protein  41.47 
 
 
387 aa  164  2.0000000000000002e-39  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.118178  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4443  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  55.71 
 
 
147 aa  155  2e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3415  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  46.59 
 
 
175 aa  138  2e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3141  hypothetical protein  57.14 
 
 
141 aa  137  2e-31  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2861  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  34.92 
 
 
422 aa  114  3e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0437077  normal  0.0549681 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0450  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  32.68 
 
 
354 aa  109  6e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0001  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  33.24 
 
 
352 aa  107  4e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.546417 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0689  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  29.94 
 
 
350 aa  97.1  4e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1662  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  60.23 
 
 
297 aa  94.7  2e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.518265  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1942  transposase, IS110 family, OrfB  24.38 
 
 
411 aa  79  0.0000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.245444  normal  0.115147 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2034  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  24.38 
 
 
411 aa  78.6  0.0000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0547551  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3066  transposase  24.63 
 
 
411 aa  77.8  0.0000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000892616  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1971  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  25.62 
 
 
411 aa  76.6  0.0000000000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0214009  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13359  transposase  33.73 
 
 
509 aa  75.9  0.0000000000009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  1.04338e-22  normal  0.800314 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10812  IS1547 transposase  33.73 
 
 
303 aa  74.7  0.000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.156779  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2223  transposase, IS110 family, OrfA  25.31 
 
 
412 aa  74.7  0.000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.92844e-48 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2046  IS110 family transposase OrfA  34.42 
 
 
257 aa  68.6  0.0000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.599145  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2202  IS110 family transposase orfa  34.42 
 
 
257 aa  68.6  0.0000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1995  IS110 family transposase  33.77 
 
 
337 aa  66.6  0.0000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00496148  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2850  transposase IS116/IS110/IS902  22.14 
 
 
418 aa  65.9  0.000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.516093  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2868  transposase IS116/IS110/IS902  21.88 
 
 
418 aa  65.9  0.000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.666774  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3417  hypothetical protein  48.39 
 
 
72 aa  58.2  0.0000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0012  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  21.02 
 
 
328 aa  58.5  0.0000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1384  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  20.78 
 
 
328 aa  56.6  0.0000007  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  unclonable  0.0000000000000149924  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1983  transposase IS116/IS110/IS902  22.02 
 
 
394 aa  56.2  0.0000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1120  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  20.78 
 
 
328 aa  55.8  0.000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0932183  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1556  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  21.26 
 
 
328 aa  56.2  0.000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00019648  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1339  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  21.08 
 
 
328 aa  53.9  0.000004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2305  hypothetical protein  63.16 
 
 
172 aa  52.4  0.00001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.876507  normal  0.528766 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1260  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  21.02 
 
 
328 aa  51.6  0.00002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0345  transposase IS116/IS110/IS902  25.7 
 
 
343 aa  50.4  0.00005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.222608  normal  0.211948 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1921  transposase IS116/IS110/IS902  25.7 
 
 
343 aa  50.4  0.00005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.876079  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3076  transposase IS116/IS110/IS902  25.7 
 
 
343 aa  50.4  0.00005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4410  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  24.05 
 
 
397 aa  50.4  0.00005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1205  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  19.88 
 
 
328 aa  50.4  0.00005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000114656  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1224  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  19.88 
 
 
328 aa  50.4  0.00005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000744849  n/a   
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6871  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  22.81 
 
 
334 aa  49.7  0.00007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.896751  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3753  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  22.81 
 
 
334 aa  49.7  0.00007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.410361  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1046  transposase, IS111A/IS1328/IS1533  26.86 
 
 
316 aa  49.7  0.00009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.113216  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1261  transposase, IS111A/IS1328/IS1533  26.86 
 
 
316 aa  49.7  0.00009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.812718 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1426  transposase, IS111A/IS1328/IS1533  26.86 
 
 
316 aa  49.7  0.00009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0372411  normal  0.895779 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2597  transposase, IS111A/IS1328/IS1533  26.86 
 
 
316 aa  49.7  0.00009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3883  transposase, IS111A/IS1328/IS1533  26.86 
 
 
316 aa  49.7  0.00009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.53968  normal  0.241341 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4991  transposase, IS111A/IS1328/IS1533  26.86 
 
 
316 aa  49.7  0.00009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2447  transposase IS116/IS110/IS902  25.7 
 
 
343 aa  49.3  0.0001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.86893  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3074  transposase IS116/IS110/IS902  25.7 
 
 
343 aa  49.3  0.0001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2076  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  24.32 
 
 
426 aa  48.9  0.0001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2182  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  24.32 
 
 
426 aa  48.9  0.0001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2425  transposase IS111A/IS1328/IS1533  21.64 
 
 
399 aa  48.9  0.0001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3002  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  24.32 
 
 
426 aa  48.9  0.0001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0220  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  24.32 
 
 
426 aa  48.9  0.0001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0073  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  24.32 
 
 
426 aa  48.9  0.0001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2099  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  24.32 
 
 
426 aa  48.5  0.0002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2054  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  24.32 
 
 
426 aa  48.5  0.0002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1121  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  23.6 
 
 
426 aa  48.5  0.0002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1111  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  23.6 
 
 
426 aa  48.5  0.0002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2024  transposase IS116/IS110/IS902  19.37 
 
 
396 aa  48.5  0.0002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000259984  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0408  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  19.39 
 
 
326 aa  48.5  0.0002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000108361  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2989  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  24.32 
 
 
426 aa  48.1  0.0002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2349  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  24.32 
 
 
426 aa  48.1  0.0002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0156  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  24.32 
 
 
426 aa  48.5  0.0002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1035  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  23.89 
 
 
426 aa  47.8  0.0003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2089  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  24.32 
 
 
426 aa  47.8  0.0003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000334168  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1112  transposase IS111A/IS1328/IS1533  22.39 
 
 
399 aa  47.4  0.0004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.771118 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3901  transposase IS111A/IS1328/IS1533  29.63 
 
 
404 aa  47.4  0.0004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2078  transposase IS111A/IS1328/IS1533  22.39 
 
 
399 aa  47.8  0.0004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.218145  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2606  transposase IS111A/IS1328/IS1533  22.39 
 
 
399 aa  47.4  0.0004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2886  transposase IS111A/IS1328/IS1533  29.63 
 
 
404 aa  47.4  0.0004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.445924  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0896  transposase IS111A/IS1328/IS1533  29.63 
 
 
404 aa  47.4  0.0004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3253  transposase IS111A/IS1328/IS1533  29.63 
 
 
404 aa  47.4  0.0004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.301306  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0159  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  21.21 
 
 
343 aa  47.4  0.0005  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1021  hypothetical protein  21.21 
 
 
343 aa  47.4  0.0005  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1525  transposase IS111A/IS1328/IS1533  27.72 
 
 
412 aa  47  0.0006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.337763  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3864  transposase IS111A/IS1328/IS1533  27.72 
 
 
412 aa  47  0.0006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00632164  normal  0.931768 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5232  transposase IS111A/IS1328/IS1533  27.72 
 
 
412 aa  47  0.0006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5286  transposase IS111A/IS1328/IS1533  27.72 
 
 
412 aa  47  0.0006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2517  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  23.46 
 
 
322 aa  45.8  0.001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0566277  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2839  transposase IS111A/IS1328/IS1533  26.98 
 
 
412 aa  45.4  0.002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00132212  normal  0.0366179 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0169  transposase IS111A/IS1328/IS1533  20.95 
 
 
399 aa  44.7  0.003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00419214  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>