138 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mchl_5453 on replicon NC_011758
Organism: Methylobacterium chloromethanicum CM4



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011758  Mchl_5453  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  100 
 
 
359 aa  720    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5540  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  99.72 
 
 
359 aa  718    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.657394  normal  0.0244683 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2060  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  53.57 
 
 
348 aa  322  9.000000000000001e-87  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000000298499  normal  0.0142271 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2006  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  53.57 
 
 
348 aa  322  9.000000000000001e-87  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00873285  hitchhiker  0.00397123 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0034  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  53.27 
 
 
348 aa  321  9.000000000000001e-87  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0221  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  53.57 
 
 
348 aa  322  9.000000000000001e-87  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1198  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  53.57 
 
 
348 aa  320  1.9999999999999998e-86  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0759  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  53.27 
 
 
348 aa  320  1.9999999999999998e-86  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3289  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  53.57 
 
 
348 aa  320  1.9999999999999998e-86  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000246247  hitchhiker  0.00945293 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1872  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  53.57 
 
 
348 aa  320  1.9999999999999998e-86  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.137932  hitchhiker  0.00933127 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1275  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  53.57 
 
 
348 aa  320  1.9999999999999998e-86  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.455752  normal  0.806138 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1766  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  45.75 
 
 
354 aa  296  3e-79  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0961431  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20200  transposase  45.38 
 
 
378 aa  281  8.000000000000001e-75  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.12815 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2982  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  50.49 
 
 
327 aa  274  2.0000000000000002e-72  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000410087 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4649  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  46.76 
 
 
370 aa  265  8e-70  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0426  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  45.35 
 
 
363 aa  256  6e-67  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3141  hypothetical protein  70.21 
 
 
141 aa  211  2e-53  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04230  transposase  41.3 
 
 
402 aa  202  6e-51  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.389305  normal  0.67881 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00780  transposase  41.42 
 
 
402 aa  201  9.999999999999999e-51  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0267  transposase IS3/IS911 family protein  40.55 
 
 
387 aa  179  7e-44  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.118178  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2085  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  39.66 
 
 
364 aa  170  4e-41  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000256  normal  0.0160957 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2255  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  39.66 
 
 
364 aa  170  4e-41  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000526829  normal  0.161762 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4443  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  57.97 
 
 
147 aa  159  1e-37  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11860  Transposase IS116/IS110/IS902 family  35.48 
 
 
356 aa  143  4e-33  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.378222  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0450  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  34.29 
 
 
354 aa  124  3e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3415  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  45.88 
 
 
175 aa  124  4e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2861  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  37.01 
 
 
422 aa  121  1.9999999999999998e-26  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0437077  normal  0.0549681 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0001  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  34.1 
 
 
352 aa  116  7.999999999999999e-25  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.546417 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0689  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  33.53 
 
 
350 aa  114  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1662  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  50 
 
 
297 aa  87.8  3e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.518265  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0159  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  24.93 
 
 
343 aa  83.6  0.000000000000005  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1021  hypothetical protein  24.93 
 
 
343 aa  83.6  0.000000000000005  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1284  hypothetical protein  23.1 
 
 
333 aa  83.6  0.000000000000005  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.159965 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13359  transposase  34.67 
 
 
509 aa  77.4  0.0000000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  1.04338e-22  normal  0.800314 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10812  IS1547 transposase  34.67 
 
 
303 aa  76.6  0.0000000000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.156779  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2305  hypothetical protein  34.66 
 
 
172 aa  75.9  0.000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.876507  normal  0.528766 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3417  hypothetical protein  50.82 
 
 
72 aa  62.8  0.000000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1271  hypothetical protein  24.92 
 
 
296 aa  59.3  0.00000009  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.238657 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0235  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  30.28 
 
 
427 aa  58.9  0.0000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1925  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  30.28 
 
 
427 aa  58.9  0.0000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2146  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  30.28 
 
 
427 aa  58.9  0.0000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2586  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  30.28 
 
 
427 aa  58.9  0.0000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2734  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  30.28 
 
 
427 aa  58.9  0.0000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0963  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  27.7 
 
 
427 aa  57.4  0.0000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4661  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  27.7 
 
 
427 aa  57.4  0.0000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0728  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  28.04 
 
 
426 aa  56.2  0.0000008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000000210486  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0911  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  28.04 
 
 
426 aa  56.2  0.0000008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000000518715  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1023  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  28.04 
 
 
426 aa  56.2  0.0000008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000543141  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1111  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  33.11 
 
 
426 aa  56.2  0.0000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1035  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  33.11 
 
 
426 aa  55.8  0.000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2850  transposase IS116/IS110/IS902  19.9 
 
 
418 aa  55.8  0.000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.516093  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2076  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  33.11 
 
 
426 aa  55.8  0.000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2054  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  33.11 
 
 
426 aa  55.8  0.000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2099  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  33.11 
 
 
426 aa  55.8  0.000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2989  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  33.11 
 
 
426 aa  55.8  0.000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2349  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  33.11 
 
 
426 aa  55.8  0.000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2182  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  33.11 
 
 
426 aa  55.8  0.000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1971  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  19.24 
 
 
411 aa  56.2  0.000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0214009  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1121  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  33.11 
 
 
426 aa  55.8  0.000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3002  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  33.11 
 
 
426 aa  55.8  0.000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0156  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  33.11 
 
 
426 aa  55.8  0.000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0073  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  33.11 
 
 
426 aa  55.8  0.000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0220  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  33.11 
 
 
426 aa  55.8  0.000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2089  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  33.11 
 
 
426 aa  55.8  0.000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000334168  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0375  transposase IS116/IS110/IS902  25.46 
 
 
401 aa  55.1  0.000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3502  transposase IS116/IS110/IS902  25.46 
 
 
401 aa  55.1  0.000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.573808  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4926  transposase IS116/IS110/IS902  25.46 
 
 
401 aa  55.1  0.000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5506  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  25.46 
 
 
401 aa  55.1  0.000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000281542 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5513  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  25.46 
 
 
401 aa  55.1  0.000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  unclonable  0.000000000996402  decreased coverage  0.00000000098172 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5520  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  25.46 
 
 
401 aa  55.1  0.000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.240252  hitchhiker  0.0000000689904 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5526  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  25.46 
 
 
401 aa  55.1  0.000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.112316  hitchhiker  0.000000304553 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5538  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  25.46 
 
 
401 aa  55.1  0.000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.25664  hitchhiker  0.000556456 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4091  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  25.46 
 
 
401 aa  55.1  0.000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0416  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  25.46 
 
 
401 aa  55.1  0.000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.255193 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1737  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  25.46 
 
 
401 aa  55.1  0.000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.670519 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4200  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  25.46 
 
 
401 aa  55.1  0.000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2868  transposase IS116/IS110/IS902  19.22 
 
 
418 aa  54.7  0.000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.666774  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1942  transposase, IS110 family, OrfB  19.44 
 
 
411 aa  54.3  0.000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.245444  normal  0.115147 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3501  transposase IS111A/IS1328/IS1533  24.54 
 
 
403 aa  54.3  0.000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.487928  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4410  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  31.11 
 
 
397 aa  53.9  0.000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2824  transposase IS111A/IS1328/IS1533  24.54 
 
 
403 aa  54.3  0.000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2034  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  19.7 
 
 
411 aa  53.9  0.000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0547551  n/a   
 
 
-
 
NC_014159  Tpau_4269  transposase IS111A/IS1328/IS1533  24.54 
 
 
403 aa  54.3  0.000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0352  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  27.31 
 
 
426 aa  53.5  0.000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000000129716  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0865  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  27.31 
 
 
426 aa  53.5  0.000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000000503575  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1326  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  27.31 
 
 
426 aa  53.5  0.000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000722082  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1369  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  27.31 
 
 
426 aa  53.5  0.000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000000016519  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1699  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  27.31 
 
 
426 aa  53.5  0.000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000000352786  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2047  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  27.31 
 
 
426 aa  53.5  0.000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000000186467  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2389  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  27.31 
 
 
426 aa  53.5  0.000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000000133705  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1542  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  31.76 
 
 
426 aa  52.8  0.00001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000639136  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1551  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  31.76 
 
 
426 aa  52.8  0.00001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000000273211  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1864  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  31.76 
 
 
426 aa  52.4  0.00001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000939746  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2083  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  31.76 
 
 
426 aa  52.8  0.00001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000000470228  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1046  transposase, IS111A/IS1328/IS1533  27.91 
 
 
316 aa  51.2  0.00003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.113216  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1261  transposase, IS111A/IS1328/IS1533  27.91 
 
 
316 aa  51.2  0.00003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.812718 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1426  transposase, IS111A/IS1328/IS1533  27.91 
 
 
316 aa  51.2  0.00003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0372411  normal  0.895779 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2597  transposase, IS111A/IS1328/IS1533  27.91 
 
 
316 aa  51.2  0.00003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3883  transposase, IS111A/IS1328/IS1533  27.91 
 
 
316 aa  51.2  0.00003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.53968  normal  0.241341 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4991  transposase, IS111A/IS1328/IS1533  27.91 
 
 
316 aa  51.2  0.00003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>