88 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_3415 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009921  Franean1_3415  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  100 
 
 
175 aa  343  1e-93  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4443  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  94.51 
 
 
147 aa  169  2e-41  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0426  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  47.43 
 
 
363 aa  140  9.999999999999999e-33  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4649  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  46.59 
 
 
370 aa  138  3.9999999999999997e-32  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1766  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  46.47 
 
 
354 aa  127  1.0000000000000001e-28  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0961431  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0034  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  45.03 
 
 
348 aa  124  7e-28  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3289  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  45.03 
 
 
348 aa  124  7e-28  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000246247  hitchhiker  0.00945293 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0759  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  45.03 
 
 
348 aa  124  7e-28  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1198  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  45.03 
 
 
348 aa  124  7e-28  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1275  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  45.03 
 
 
348 aa  124  7e-28  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.455752  normal  0.806138 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1872  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  45.03 
 
 
348 aa  124  7e-28  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.137932  hitchhiker  0.00933127 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0221  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  45.03 
 
 
348 aa  124  9e-28  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5453  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  45.88 
 
 
359 aa  124  9e-28  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2006  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  45.03 
 
 
348 aa  124  9e-28  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00873285  hitchhiker  0.00397123 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2060  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  45.03 
 
 
348 aa  124  9e-28  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000000298499  normal  0.0142271 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5540  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  45.88 
 
 
359 aa  124  1e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.657394  normal  0.0244683 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20200  transposase  41.67 
 
 
378 aa  119  1.9999999999999998e-26  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.12815 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2982  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  48.21 
 
 
327 aa  108  3e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000410087 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3141  hypothetical protein  61.04 
 
 
141 aa  97.8  7e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04230  transposase  36.59 
 
 
402 aa  87  1e-16  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.389305  normal  0.67881 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00780  transposase  36.97 
 
 
402 aa  87.4  1e-16  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11860  Transposase IS116/IS110/IS902 family  49.07 
 
 
356 aa  76.6  0.0000000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.378222  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2085  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  38.37 
 
 
364 aa  75.5  0.0000000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000256  normal  0.0160957 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2255  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  38.37 
 
 
364 aa  75.5  0.0000000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000526829  normal  0.161762 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0689  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  37.04 
 
 
350 aa  67  0.0000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0267  transposase IS3/IS911 family protein  37.01 
 
 
387 aa  62.8  0.000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.118178  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2861  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  37.13 
 
 
422 aa  62.4  0.000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0437077  normal  0.0549681 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0993  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  34.9 
 
 
341 aa  56.6  0.0000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0995  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  34.9 
 
 
341 aa  56.6  0.0000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.566106  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0711  hypothetical protein  61.7 
 
 
288 aa  52.4  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0001  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  34.81 
 
 
352 aa  51.6  0.000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.546417 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1959  transposase IS116/IS110/IS902  30.77 
 
 
343 aa  51.6  0.000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0132  transposase IS116/IS110/IS902  30.77 
 
 
343 aa  51.6  0.000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.020989  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0109  transposase IS116/IS110/IS902  30.77 
 
 
343 aa  51.6  0.000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.250227  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2306  transposase IS116/IS110/IS902  30.77 
 
 
343 aa  51.6  0.000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2934  transposase IS116/IS110/IS902  30.77 
 
 
343 aa  51.6  0.000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3007  transposase IS116/IS110/IS902  30.77 
 
 
343 aa  51.6  0.000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.107293  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3682  transposase IS116/IS110/IS902  30.77 
 
 
343 aa  51.6  0.000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0450  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  34.81 
 
 
354 aa  51.6  0.000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2401  transposase IS110 family protein  33.54 
 
 
343 aa  50.1  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13359  transposase  33.33 
 
 
509 aa  47.8  0.00008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  1.04338e-22  normal  0.800314 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3936  transposase IS116/IS110/IS902  32.45 
 
 
343 aa  47.4  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10812  IS1547 transposase  33.33 
 
 
303 aa  47.4  0.0001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.156779  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1667  transposase, IS111A/IS1328/IS1533  35.09 
 
 
312 aa  45.8  0.0003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.0305373 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0639  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  31.43 
 
 
348 aa  43.5  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.611621  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7202  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  31.43 
 
 
348 aa  43.5  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3359  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  30.67 
 
 
342 aa  43.9  0.001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0373  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  31.43 
 
 
360 aa  43.5  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0910679  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3240  transposase IS116/IS110/IS902  35.53 
 
 
424 aa  42.7  0.002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.261485 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0880  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  31.33 
 
 
348 aa  42.7  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0133961  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7698  IS1111A/IS1328/IS1533 family transposase  31.33 
 
 
342 aa  43.1  0.002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.951148  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2714  hypothetical protein  31.33 
 
 
342 aa  43.1  0.002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1016  transposase IS116/IS110/IS902  35.53 
 
 
407 aa  43.1  0.002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4216  transposase IS116/IS110/IS902  35.53 
 
 
424 aa  42.7  0.002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5872  transposase IS116/IS110/IS902  31.88 
 
 
341 aa  43.1  0.002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0505  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  31.88 
 
 
341 aa  43.1  0.002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0567  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  31.88 
 
 
341 aa  43.1  0.002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0767  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  31.88 
 
 
341 aa  43.1  0.002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2205  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  31.88 
 
 
341 aa  43.1  0.002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2966  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  31.88 
 
 
341 aa  43.1  0.002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.220936  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7434  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  30.28 
 
 
275 aa  43.1  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.119711  normal 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4362  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  30.5 
 
 
347 aa  43.1  0.002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7964  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  31.33 
 
 
348 aa  42.7  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.00546664  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3701  hypothetical protein  32.3 
 
 
348 aa  42.4  0.003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.921253 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2122  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  30.71 
 
 
337 aa  42.4  0.003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0571042  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2204  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  30.71 
 
 
337 aa  42.4  0.003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0735  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  32.3 
 
 
348 aa  42.4  0.003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6016  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  32.69 
 
 
350 aa  42.4  0.003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.186566  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0181  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  32.69 
 
 
350 aa  42.4  0.003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0473  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  32.69 
 
 
350 aa  42.4  0.003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.214803  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0742  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  32.69 
 
 
350 aa  42.4  0.003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6905  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  32.69 
 
 
350 aa  42.4  0.003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09560  transposase IS116/IS110/IS902  32.03 
 
 
338 aa  42  0.004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.927637  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13560  Transposase IS116/IS110/IS902  32.03 
 
 
338 aa  42  0.004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.682801  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35590  Transposase IS116/IS110/IS902  32.03 
 
 
338 aa  42  0.004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30230  Transposase IS116/IS110/IS902  32.03 
 
 
338 aa  42  0.004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45790  Transposase IS116/IS110/IS902  32.03 
 
 
338 aa  42  0.004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.997681  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4120  transposase IS116/IS110/IS902  31.25 
 
 
374 aa  42  0.004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44660  Transposase IS116/IS110/IS902  32.03 
 
 
338 aa  42.4  0.004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2472  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  30.15 
 
 
344 aa  41.6  0.005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3216  transposase IS116/IS110/IS902  28.95 
 
 
385 aa  42  0.005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.118777  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1569  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  29.14 
 
 
342 aa  41.6  0.006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000196029 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1571  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  29.14 
 
 
342 aa  41.6  0.006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000595927 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2781  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  29.14 
 
 
342 aa  41.6  0.006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1895  ISAfe1, transposase  29.14 
 
 
342 aa  41.6  0.006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4384  transposase IS116/IS110/IS902  39.19 
 
 
339 aa  41.6  0.006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3183  ISAfe1, transposase  29.14 
 
 
342 aa  41.6  0.006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.487441  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4139  transposase IS116/IS110/IS902  30.5 
 
 
349 aa  41.2  0.008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>