226 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_0267 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014158  Tpau_0267  transposase IS3/IS911 family protein  100 
 
 
387 aa  781    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.118178  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1766  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  53.06 
 
 
354 aa  251  2e-65  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0961431  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0278  transposase IS3/IS911 family protein  100 
 
 
109 aa  220  3e-56  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0273  transposase IS3/IS911 family protein  100 
 
 
109 aa  220  3e-56  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.732327  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3219  transposase IS3/IS911 family protein  100 
 
 
109 aa  220  3e-56  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2607  transposase IS3/IS911 family protein  100 
 
 
109 aa  220  3e-56  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2472  transposase IS3/IS911 family protein  100 
 
 
109 aa  220  3e-56  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0303  transposase IS3/IS911 family protein  100 
 
 
109 aa  220  3e-56  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.809623  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1647  transposase IS3/IS911 family protein  100 
 
 
109 aa  220  3e-56  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1667  transposase IS3/IS911 family protein  99.08 
 
 
109 aa  217  2e-55  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.135875  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5453  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  40.55 
 
 
359 aa  171  3e-41  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5540  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  40.55 
 
 
359 aa  170  3e-41  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.657394  normal  0.0244683 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20200  transposase  39.6 
 
 
378 aa  164  2.0000000000000002e-39  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.12815 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4649  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  41.47 
 
 
370 aa  164  2.0000000000000002e-39  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1275  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  42.45 
 
 
348 aa  164  3e-39  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.455752  normal  0.806138 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0759  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  42.04 
 
 
348 aa  164  3e-39  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1872  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  42.45 
 
 
348 aa  164  3e-39  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.137932  hitchhiker  0.00933127 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1198  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  42.45 
 
 
348 aa  164  3e-39  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2006  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  42.45 
 
 
348 aa  164  3e-39  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00873285  hitchhiker  0.00397123 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0034  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  42.04 
 
 
348 aa  164  3e-39  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2060  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  42.45 
 
 
348 aa  164  3e-39  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000000298499  normal  0.0142271 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3289  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  42.45 
 
 
348 aa  164  3e-39  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000246247  hitchhiker  0.00945293 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0221  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  42.45 
 
 
348 aa  164  3e-39  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2982  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  47.8 
 
 
327 aa  155  8e-37  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000410087 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0426  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  40.16 
 
 
363 aa  150  3e-35  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2153  transposase IS3/IS911 family protein  53.66 
 
 
127 aa  119  7.999999999999999e-26  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2085  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  34.94 
 
 
364 aa  102  2e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000256  normal  0.0160957 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2255  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  34.94 
 
 
364 aa  102  2e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000526829  normal  0.161762 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3286  transposase IS3/IS911 family protein  49.54 
 
 
109 aa  97.4  4e-19  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0803  transposase IS3/IS911 family protein  48.62 
 
 
109 aa  95.1  2e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04230  transposase  31.71 
 
 
402 aa  95.1  2e-18  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.389305  normal  0.67881 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0576  transposase IS3/IS911 family protein  47.27 
 
 
110 aa  94.4  3e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3742  transposase IS3/IS911 family protein  47.27 
 
 
110 aa  94.4  3e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1627  transposase IS3/IS911  48.67 
 
 
110 aa  92  2e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.683262  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3190  transposase IS3/IS911  48.67 
 
 
110 aa  92  2e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.39399  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1653  transposase IS3/IS911 family protein  48.67 
 
 
110 aa  92  2e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3252  transposase IS3/IS911 family protein  48.67 
 
 
110 aa  92  2e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0478749  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1669  transposase IS3/IS911 family protein  48.67 
 
 
110 aa  92  2e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0827907  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2247  transposase IS3/IS911 family protein  48.67 
 
 
110 aa  92  2e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.249628  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2584  transposase IS3/IS911 family protein  48.67 
 
 
110 aa  92  2e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2854  transposase IS3/IS911 family protein  48.67 
 
 
110 aa  92  2e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0560  transposase IS3/IS911 family protein  48.67 
 
 
110 aa  91.7  2e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.504625  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0577  transposase IS3/IS911 family protein  48.67 
 
 
110 aa  92  2e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0609  transposase IS3/IS911 family protein  48.67 
 
 
110 aa  91.7  2e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00780  transposase  31.17 
 
 
402 aa  91.3  3e-17  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1999  transposase IS3/IS911 family protein  48.67 
 
 
110 aa  90.1  6e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2229  transposase IS3/IS911 family protein  48.67 
 
 
110 aa  90.1  6e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.505397  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0582  transposase IS3/IS911 family protein  44.09 
 
 
131 aa  75.1  0.000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.312881  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1942  transposase, IS110 family, OrfB  26.07 
 
 
411 aa  70.5  0.00000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.245444  normal  0.115147 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5605  putative transposase  47.56 
 
 
83 aa  69.7  0.00000000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.583232  normal  0.702403 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5825  putative transposase  47.56 
 
 
83 aa  69.7  0.00000000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.280519 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1995  IS110 family transposase  26.07 
 
 
337 aa  68.9  0.0000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00496148  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2046  IS110 family transposase OrfA  31.85 
 
 
257 aa  68.6  0.0000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.599145  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2202  IS110 family transposase orfa  31.85 
 
 
257 aa  68.6  0.0000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3066  transposase  30 
 
 
411 aa  67.4  0.0000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000892616  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11860  Transposase IS116/IS110/IS902 family  30.29 
 
 
356 aa  67  0.0000000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.378222  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2223  transposase, IS110 family, OrfA  25.27 
 
 
412 aa  67  0.0000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.92844e-48 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1971  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  25.62 
 
 
411 aa  66.2  0.0000000009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0214009  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2034  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  31.21 
 
 
411 aa  65.9  0.000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0547551  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3415  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  37.01 
 
 
175 aa  62.8  0.00000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2861  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  29.13 
 
 
422 aa  60.5  0.00000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0437077  normal  0.0549681 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6259  transposase IS3/IS911 family protein  37.74 
 
 
98 aa  59.3  0.0000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.523501  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4601  transposase IS3/IS911 family protein  35.19 
 
 
98 aa  55.5  0.000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1348  transposase and inactivated derivatives  33.64 
 
 
92 aa  54.7  0.000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2554  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  26.63 
 
 
321 aa  54.3  0.000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.964231  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2268  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  26.63 
 
 
321 aa  54.3  0.000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1820  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  26.63 
 
 
321 aa  54.3  0.000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.161882  normal  0.193325 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1462  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  26.63 
 
 
321 aa  54.3  0.000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1633  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  26.63 
 
 
321 aa  54.3  0.000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0380198  normal  0.28668 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3243  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  26.63 
 
 
321 aa  54.3  0.000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2882  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  26.63 
 
 
321 aa  54.3  0.000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1544  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  40.66 
 
 
424 aa  54.3  0.000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00314291  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3127  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  27.54 
 
 
406 aa  53.1  0.000008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1073  IS3 family transposase orfA  30.56 
 
 
93 aa  52.4  0.00001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.604189  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1115  IS3 family transposase orfA  30.56 
 
 
93 aa  52.4  0.00001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1011  IS3 family transposase orfA  30.56 
 
 
93 aa  52.4  0.00001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1014  IS3 family transposase orfA  30.56 
 
 
93 aa  52.4  0.00001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0543  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  27.78 
 
 
402 aa  52  0.00002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4424  transposase IS3/IS911 family protein  35.14 
 
 
97 aa  51.2  0.00003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0891  transposase IS3/IS911 family protein  35.14 
 
 
97 aa  51.2  0.00003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.444213  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3370  transposase IS3/IS911 family protein  36.19 
 
 
98 aa  51.2  0.00003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0030  transposase IS3/IS911  37.14 
 
 
99 aa  50.8  0.00004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5317  transposase IS3/IS911 family protein  37.14 
 
 
98 aa  50.4  0.00005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5972  transposase DNA binding site ISRme3  37.14 
 
 
98 aa  50.4  0.00005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.263153  normal  0.0380102 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6073  transposase DNA binding site ISRme3  37.14 
 
 
98 aa  50.4  0.00005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.391676 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1613  transposase IS3/IS911  37.14 
 
 
98 aa  50.4  0.00005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.322008  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3349  transposase IS3/IS911  37.14 
 
 
98 aa  50.4  0.00005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3770  transposase DNA binding site ISRme3  37.14 
 
 
98 aa  50.4  0.00005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3943  transposase DNA binding site ISRme3  37.14 
 
 
98 aa  50.4  0.00005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.352485 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4658  transposase DNA binding site ISRme3  37.14 
 
 
98 aa  50.4  0.00005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5453  transposase DNA binding site ISRme3  37.14 
 
 
98 aa  50.4  0.00005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5680  transposase DNA binding site ISRme3  37.14 
 
 
98 aa  50.4  0.00005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3927  transposase IS3/IS911 family protein  37.14 
 
 
98 aa  50.4  0.00005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.180463 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3814  transposase IS3/IS911 family protein  37.14 
 
 
98 aa  50.4  0.00005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.339406 
 
 
-
 
NC_010373  M446_6988  hypothetical protein  38 
 
 
110 aa  50.1  0.00006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.828918  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2169  transposase IS3/IS911 family protein  32.38 
 
 
97 aa  50.1  0.00007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.263727  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3328  transposase IS3/IS911 family protein  32.38 
 
 
97 aa  50.1  0.00007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0450  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  27.2 
 
 
354 aa  49.7  0.00008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4708  transposase IS3/IS911 family protein  35.85 
 
 
90 aa  49.7  0.00008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.879601  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2066  transposase IS3/IS911 family protein  33.33 
 
 
97 aa  49.7  0.00008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0227853  normal  0.584452 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>