More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_0001 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009338  Mflv_0450  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  99.44 
 
 
354 aa  703    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0001  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  100 
 
 
352 aa  709    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.546417 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10812  IS1547 transposase  65.94 
 
 
303 aa  334  2e-90  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.156779  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13359  transposase  65.94 
 
 
509 aa  333  4e-90  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  1.04338e-22  normal  0.800314 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0689  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  38.12 
 
 
350 aa  171  2e-41  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11860  Transposase IS116/IS110/IS902 family  34.66 
 
 
356 aa  134  3e-30  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.378222  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1766  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  35.21 
 
 
354 aa  129  1.0000000000000001e-28  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0961431  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20200  transposase  32.57 
 
 
378 aa  110  5e-23  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.12815 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0034  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  34.43 
 
 
348 aa  107  2e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4649  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  33.24 
 
 
370 aa  107  3e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1275  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  34.43 
 
 
348 aa  107  3e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.455752  normal  0.806138 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1872  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  34.43 
 
 
348 aa  107  3e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.137932  hitchhiker  0.00933127 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3289  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  34.43 
 
 
348 aa  107  3e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000246247  hitchhiker  0.00945293 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1198  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  34.43 
 
 
348 aa  107  3e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0759  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  34.43 
 
 
348 aa  107  3e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5540  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  34.1 
 
 
359 aa  107  4e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.657394  normal  0.0244683 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5453  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  34.1 
 
 
359 aa  106  5e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2060  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  34.15 
 
 
348 aa  105  9e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000000298499  normal  0.0142271 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2006  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  34.15 
 
 
348 aa  105  9e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00873285  hitchhiker  0.00397123 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0221  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  34.15 
 
 
348 aa  105  9e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04230  transposase  31.21 
 
 
402 aa  102  9e-21  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.389305  normal  0.67881 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2850  transposase IS116/IS110/IS902  25.58 
 
 
418 aa  102  9e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.516093  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2868  transposase IS116/IS110/IS902  25.39 
 
 
418 aa  100  4e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.666774  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2024  transposase IS116/IS110/IS902  25.13 
 
 
396 aa  100  5e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000259984  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00780  transposase  31.59 
 
 
402 aa  98.6  2e-19  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1942  transposase, IS110 family, OrfB  24.42 
 
 
411 aa  98.2  2e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.245444  normal  0.115147 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0426  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  32.85 
 
 
363 aa  97.4  4e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1983  transposase IS116/IS110/IS902  25.2 
 
 
394 aa  94.7  2e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3066  transposase  23.12 
 
 
411 aa  92  1e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000892616  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2223  transposase, IS110 family, OrfA  24.16 
 
 
412 aa  92  1e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.92844e-48 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2034  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  23.71 
 
 
411 aa  91.7  2e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0547551  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4200  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  27.97 
 
 
401 aa  90.9  3e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1737  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  27.97 
 
 
401 aa  90.9  3e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.670519 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0375  transposase IS116/IS110/IS902  27.97 
 
 
401 aa  90.9  3e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3502  transposase IS116/IS110/IS902  27.97 
 
 
401 aa  90.9  3e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.573808  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4926  transposase IS116/IS110/IS902  27.97 
 
 
401 aa  90.9  3e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5506  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  27.97 
 
 
401 aa  90.9  3e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000281542 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5513  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  27.97 
 
 
401 aa  90.9  3e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  unclonable  0.000000000996402  decreased coverage  0.00000000098172 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5520  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  27.97 
 
 
401 aa  90.9  3e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.240252  hitchhiker  0.0000000689904 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5526  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  27.97 
 
 
401 aa  90.9  3e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.112316  hitchhiker  0.000000304553 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5538  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  27.97 
 
 
401 aa  90.9  3e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.25664  hitchhiker  0.000556456 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4091  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  27.97 
 
 
401 aa  90.9  3e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0416  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  27.97 
 
 
401 aa  90.9  3e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.255193 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2982  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  34.06 
 
 
327 aa  90.1  5e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000410087 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1971  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  23.38 
 
 
411 aa  90.1  6e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0214009  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4410  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  27.42 
 
 
397 aa  89.4  8e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0896  transposase IS111A/IS1328/IS1533  27.47 
 
 
404 aa  88.6  2e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3901  transposase IS111A/IS1328/IS1533  27.47 
 
 
404 aa  88.6  2e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2886  transposase IS111A/IS1328/IS1533  27.47 
 
 
404 aa  88.6  2e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.445924  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3253  transposase IS111A/IS1328/IS1533  27.47 
 
 
404 aa  88.6  2e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.301306  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2861  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  30.75 
 
 
422 aa  86.7  5e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0437077  normal  0.0549681 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2085  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  32.05 
 
 
364 aa  84.7  0.000000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000256  normal  0.0160957 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2255  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  32.05 
 
 
364 aa  84.7  0.000000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000526829  normal  0.161762 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4443  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  42.22 
 
 
147 aa  82.4  0.00000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10811  transposase  73.58 
 
 
72 aa  81.6  0.00000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000142542  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4694  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  25.57 
 
 
403 aa  78.6  0.0000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.275408  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3141  hypothetical protein  38.06 
 
 
141 aa  79  0.0000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4393  transposase, IS111A/IS1328/IS1533  27.39 
 
 
421 aa  73.2  0.000000000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2047  IS110 family transposase OrfB  34.21 
 
 
154 aa  72.4  0.00000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.343569  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2203  IS110 family transposase orfb  34.21 
 
 
154 aa  72.4  0.00000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1635  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  24.58 
 
 
382 aa  68.2  0.0000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1353  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  24.58 
 
 
382 aa  68.2  0.0000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6871  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  23.88 
 
 
334 aa  68.6  0.0000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.896751  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3753  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  23.88 
 
 
334 aa  68.6  0.0000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.410361  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2865  transposase  25.98 
 
 
398 aa  65.5  0.000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12160  transposase  26.99 
 
 
408 aa  65.9  0.000000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.145073  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1034  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  22.87 
 
 
402 aa  64.7  0.000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000872071  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1559  transposase for IS1663  26.17 
 
 
351 aa  65.1  0.000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1016  transposase IS116/IS110/IS902  27.92 
 
 
407 aa  63.9  0.000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3240  transposase IS116/IS110/IS902  27.92 
 
 
424 aa  63.9  0.000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.261485 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4216  transposase IS116/IS110/IS902  27.92 
 
 
424 aa  63.9  0.000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5636  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  28.07 
 
 
401 aa  63.5  0.000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1190  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  28.07 
 
 
401 aa  63.5  0.000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.140816  normal  0.0159286 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2638  transposase IS111A/IS1328/IS1533  34.38 
 
 
407 aa  63.2  0.000000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21750  transposase  26.74 
 
 
408 aa  63.2  0.000000006  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.747437  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4033  transposase  25.33 
 
 
398 aa  62.8  0.000000009  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1104  transposase  25.99 
 
 
398 aa  62.4  0.00000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4876  transposase  25.99 
 
 
398 aa  62.4  0.00000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0142  transposase  25.99 
 
 
398 aa  62.4  0.00000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.784062  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3346  transposase  25.99 
 
 
398 aa  62.4  0.00000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3846  transposase  25.99 
 
 
398 aa  62.4  0.00000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2541  transposase  25.99 
 
 
398 aa  62.4  0.00000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0777967  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0230  transposase  25.73 
 
 
398 aa  62  0.00000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0273  transposase  25.73 
 
 
398 aa  62.4  0.00000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0159  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  24.48 
 
 
343 aa  62  0.00000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1021  hypothetical protein  24.48 
 
 
343 aa  62  0.00000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1289  transposase  27.51 
 
 
420 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1964  transposase  27.51 
 
 
420 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.366861  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0642  transposase  27.51 
 
 
420 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0735  transposase  27.51 
 
 
420 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.924644  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2615  transposase  27.51 
 
 
420 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0243344  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0312  transposase  25.73 
 
 
398 aa  61.2  0.00000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1387  transposase  27.51 
 
 
420 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3816  transposase IS116/IS110/IS902  28.29 
 
 
340 aa  60.8  0.00000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.531906  normal  0.5614 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1755  ISBma3, transposase  27.54 
 
 
420 aa  61.2  0.00000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.00342149  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2836  ISBma3, transposase  27.54 
 
 
420 aa  61.2  0.00000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3194  ISBma3, transposase  27.54 
 
 
420 aa  61.2  0.00000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0345  transposase IS116/IS110/IS902  27.25 
 
 
343 aa  61.2  0.00000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.222608  normal  0.211948 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1921  transposase IS116/IS110/IS902  27.25 
 
 
343 aa  61.2  0.00000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.876079  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1195  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  27.54 
 
 
420 aa  61.2  0.00000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>