More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_2024 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009012  Cthe_1983  transposase IS116/IS110/IS902  79.95 
 
 
394 aa  696    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2024  transposase IS116/IS110/IS902  100 
 
 
396 aa  827    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000259984  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2850  transposase IS116/IS110/IS902  80.71 
 
 
418 aa  700    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.516093  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2868  transposase IS116/IS110/IS902  80.66 
 
 
418 aa  699    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.666774  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1942  transposase, IS110 family, OrfB  48.84 
 
 
411 aa  389  1e-107  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.245444  normal  0.115147 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3066  transposase  49.1 
 
 
411 aa  387  1e-106  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000892616  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2034  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  48.58 
 
 
411 aa  385  1e-106  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0547551  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1971  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  47.73 
 
 
411 aa  387  1e-106  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0214009  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2223  transposase, IS110 family, OrfA  48.32 
 
 
412 aa  384  1e-105  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.92844e-48 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1995  IS110 family transposase  47.34 
 
 
337 aa  313  2.9999999999999996e-84  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00496148  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2046  IS110 family transposase OrfA  46.44 
 
 
257 aa  223  3e-57  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.599145  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2202  IS110 family transposase orfa  46.44 
 
 
257 aa  223  3e-57  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2047  IS110 family transposase OrfB  53.85 
 
 
154 aa  171  2e-41  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.343569  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2203  IS110 family transposase orfb  53.85 
 
 
154 aa  171  2e-41  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1034  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  27.99 
 
 
402 aa  111  3e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000872071  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2723  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  24.23 
 
 
393 aa  108  1e-22  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0450  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  25.13 
 
 
354 aa  103  5e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0001  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  25.13 
 
 
352 aa  100  6e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.546417 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0076  transposase  21.92 
 
 
416 aa  98.6  2e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0574948  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0577  putative transposase  21.92 
 
 
416 aa  98.6  2e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0235  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  22.79 
 
 
427 aa  97.8  3e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2734  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  22.79 
 
 
427 aa  97.8  3e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2146  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  22.79 
 
 
427 aa  97.8  3e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1544  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  23.75 
 
 
424 aa  96.3  8e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00314291  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0480  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  26.3 
 
 
406 aa  96.3  9e-19  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1925  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  22.25 
 
 
427 aa  93.6  5e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2586  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  22.25 
 
 
427 aa  93.6  5e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0913  transposase IS116/IS110/IS902  23.99 
 
 
406 aa  93.2  7e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1808  transposase IS116/IS110/IS902  23.99 
 
 
406 aa  93.2  7e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1884  transposase IS116/IS110/IS902  24.66 
 
 
429 aa  92  2e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2484  transposase IS116/IS110/IS902  24.66 
 
 
429 aa  92  2e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1259  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  24.61 
 
 
420 aa  90.1  6e-17  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.293497  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1515  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  24.61 
 
 
420 aa  90.1  6e-17  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1558  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  24.61 
 
 
420 aa  90.1  6e-17  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00000508366  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1950  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  24.61 
 
 
420 aa  90.1  6e-17  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1195  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  24.61 
 
 
420 aa  90.1  6e-17  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1049  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  24.61 
 
 
420 aa  90.1  6e-17  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1045  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  24.61 
 
 
420 aa  90.1  6e-17  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0644  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  24.61 
 
 
420 aa  90.1  6e-17  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0527  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  24.61 
 
 
420 aa  90.1  6e-17  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1550  transposase IS116/IS110/IS902  24.66 
 
 
429 aa  90.1  6e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2770  transposase IS116/IS110/IS902  24.66 
 
 
429 aa  90.1  6e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0814  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  22.64 
 
 
433 aa  89.4  1e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00371841  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0488  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  22.64 
 
 
433 aa  89.4  1e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000137882  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3315  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  22.64 
 
 
433 aa  89.4  1e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.579778  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0963  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  24.75 
 
 
427 aa  89  1e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4661  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  24.75 
 
 
427 aa  89  1e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3682  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  23.17 
 
 
408 aa  88.2  2e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0845  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  23.17 
 
 
408 aa  88.2  2e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1520  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  23.17 
 
 
408 aa  88.2  2e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.111852  normal  0.0222251 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0868  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  23.17 
 
 
408 aa  88.2  2e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.0776051 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1574  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  23.17 
 
 
408 aa  88.2  2e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2497  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  23.17 
 
 
408 aa  88.2  2e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.164831  normal  0.0212022 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0650  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  24.4 
 
 
427 aa  86.7  6e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1132  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  24.4 
 
 
427 aa  86.7  6e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1810  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  24.4 
 
 
427 aa  86.7  6e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2160  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  24.4 
 
 
427 aa  86.7  6e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.903868  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2701  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  24.4 
 
 
427 aa  86.7  6e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0754  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  24.4 
 
 
427 aa  86.7  6e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.353125  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1293  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  24.4 
 
 
427 aa  86.7  6e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1019  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  24.4 
 
 
427 aa  86.7  6e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.197197  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2674  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  24.4 
 
 
427 aa  86.7  6e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1353  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  27.37 
 
 
382 aa  85.9  0.000000000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1635  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  27.37 
 
 
382 aa  85.9  0.000000000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10850  transposase  21.15 
 
 
405 aa  85.1  0.000000000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.480792  unclonable  0.00000000306123 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0689  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  24 
 
 
350 aa  85.1  0.000000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0724  transposase  23 
 
 
425 aa  85.1  0.000000000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2193  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  22.92 
 
 
408 aa  85.1  0.000000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000107732 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2200  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  23.16 
 
 
404 aa  84.3  0.000000000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1750  transposase  23 
 
 
425 aa  84.3  0.000000000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.905316  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0349  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  23.16 
 
 
427 aa  83.6  0.000000000000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.248005  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0850  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  23.16 
 
 
427 aa  83.6  0.000000000000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.884754  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0857  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  23.16 
 
 
427 aa  83.6  0.000000000000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1351  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  23.16 
 
 
427 aa  83.6  0.000000000000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000796647  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1449  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  23.16 
 
 
427 aa  83.6  0.000000000000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1826  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  23.16 
 
 
427 aa  83.6  0.000000000000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.508781  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2015  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  23.16 
 
 
427 aa  83.6  0.000000000000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.792556  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2829  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  23.16 
 
 
427 aa  83.6  0.000000000000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4694  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  23.3 
 
 
403 aa  82.4  0.00000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.275408  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2638  transposase IS111A/IS1328/IS1533  21.05 
 
 
407 aa  82  0.00000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0354  transposase IS116/IS110/IS902  23.69 
 
 
420 aa  78.6  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.473452  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2516  transposase IS116/IS110/IS902  23.69 
 
 
420 aa  78.6  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2654  transposase IS116/IS110/IS902  23.69 
 
 
420 aa  78.6  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3689  transposase IS116/IS110/IS902  23.69 
 
 
420 aa  78.6  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.767433  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4714  transposase IS116/IS110/IS902  23.69 
 
 
420 aa  78.6  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4744  transposase IS116/IS110/IS902  23.69 
 
 
420 aa  78.6  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6212  transposase IS116/IS110/IS902  23.69 
 
 
420 aa  78.6  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1867  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  23.69 
 
 
420 aa  78.6  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3649  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  23.69 
 
 
420 aa  78.6  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.229157  normal  0.577395 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3160  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  23.41 
 
 
399 aa  78.6  0.0000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.846497  normal  0.201189 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1756  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  25.62 
 
 
419 aa  77.8  0.0000000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1165  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  25.62 
 
 
419 aa  77.8  0.0000000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.536143  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1190  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  23.69 
 
 
401 aa  77.8  0.0000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.140816  normal  0.0159286 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5636  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  23.69 
 
 
401 aa  77.8  0.0000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3480  putative transposase  23.13 
 
 
420 aa  77  0.0000000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0156  putative transposase  23.13 
 
 
420 aa  77  0.0000000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2763  putative transposase IS110  23.13 
 
 
420 aa  77  0.0000000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1755  ISBma3, transposase  23.13 
 
 
420 aa  76.3  0.0000000000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.00342149  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2836  ISBma3, transposase  23.13 
 
 
420 aa  76.3  0.0000000000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3194  ISBma3, transposase  23.13 
 
 
420 aa  76.3  0.0000000000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>