27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_3417 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_3417  hypothetical protein  100 
 
 		 72 aa  147  6e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4443  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  93.1 
 
 		 147 aa  112  1.0000000000000001e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2982  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  47.22 
 
 		 327 aa  63.5  0.0000000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000410087 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5540  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  50.82 
 
 		 359 aa  62.4  0.000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.657394  normal  0.0244683 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5453  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  50.82 
 
 		 359 aa  62.4  0.000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04230  transposase  47.76 
 
 		 402 aa  61.2  0.000000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.389305  normal  0.67881 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2060  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  47.3 
 
 		 348 aa  61.2  0.000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000000298499  normal  0.0142271 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0034  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  47.3 
 
 		 348 aa  61.2  0.000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0221  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  47.3 
 
 		 348 aa  61.2  0.000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2006  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  47.3 
 
 		 348 aa  61.2  0.000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00873285  hitchhiker  0.00397123 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00780  transposase  47.76 
 
 		 402 aa  60.5  0.000000009  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2305  hypothetical protein  62.79 
 
 		 172 aa  58.9  0.00000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.876507  normal  0.528766 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4649  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  48.39 
 
 		 370 aa  58.2  0.00000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11860  Transposase IS116/IS110/IS902 family  53.7 
 
 		 356 aa  56.2  0.0000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.378222  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1198  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  54.24 
 
 		 348 aa  55.5  0.0000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0759  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  54.24 
 
 		 348 aa  55.5  0.0000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1275  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  54.24 
 
 		 348 aa  55.5  0.0000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.455752  normal  0.806138 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1872  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  54.24 
 
 		 348 aa  55.5  0.0000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.137932  hitchhiker  0.00933127 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3289  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  54.24 
 
 		 348 aa  55.5  0.0000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000246247  hitchhiker  0.00945293 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20200  transposase  51.85 
 
 		 378 aa  53.9  0.0000008  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.12815 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3141  hypothetical protein  44.26 
 
 		 141 aa  52.4  0.000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1662  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  46.43 
 
 		 297 aa  50.8  0.000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.518265  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1766  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  44.68 
 
 		 354 aa  48.9  0.00002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0961431  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10812  IS1547 transposase  42.86 
 
 		 303 aa  46.6  0.0001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.156779  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13359  transposase  42.86 
 
 		 509 aa  46.2  0.0002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  1.04338e-22  normal  0.800314 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0450  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  51.11 
 
 		 354 aa  46.2  0.0002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0001  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  51.11 
 
 		 352 aa  46.2  0.0002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.546417 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>