28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_2305 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_2305  hypothetical protein  100 
 
 		 172 aa  328  2e-89  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.876507  normal  0.528766 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2982  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  62.01 
 
 		 327 aa  179  2e-44  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000410087 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5453  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  37.23 
 
 		 359 aa  82.8  0.000000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5540  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  37.23 
 
 		 359 aa  82.8  0.000000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.657394  normal  0.0244683 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3289  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  36.81 
 
 		 348 aa  72.4  0.000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000246247  hitchhiker  0.00945293 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1872  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  36.81 
 
 		 348 aa  72.4  0.000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.137932  hitchhiker  0.00933127 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1275  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  36.81 
 
 		 348 aa  72.4  0.000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.455752  normal  0.806138 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1198  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  36.81 
 
 		 348 aa  72.4  0.000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0759  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  36.81 
 
 		 348 aa  72.4  0.000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2060  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  36.81 
 
 		 348 aa  72  0.000000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000000298499  normal  0.0142271 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2006  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  36.81 
 
 		 348 aa  72  0.000000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00873285  hitchhiker  0.00397123 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0221  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  36.81 
 
 		 348 aa  72  0.000000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0034  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  36.81 
 
 		 348 aa  72  0.000000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20200  transposase  32.92 
 
 		 378 aa  64.7  0.0000000005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.12815 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4443  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  65.12 
 
 		 147 aa  60.8  0.000000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0426  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  36.25 
 
 		 363 aa  58.5  0.00000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3417  hypothetical protein  62.79 
 
 		 72 aa  58.2  0.00000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04230  transposase  60.53 
 
 		 402 aa  54.7  0.0000006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.389305  normal  0.67881 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00780  transposase  60.53 
 
 		 402 aa  54.3  0.0000009  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1766  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  30.77 
 
 		 354 aa  54.3  0.0000009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0961431  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3141  hypothetical protein  54.55 
 
 		 141 aa  53.1  0.000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4649  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  60 
 
 		 370 aa  52.4  0.000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1662  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  54.55 
 
 		 297 aa  50.8  0.000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.518265  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11860  Transposase IS116/IS110/IS902 family  33.15 
 
 		 356 aa  48.5  0.00005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.378222  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13359  transposase  60.53 
 
 		 509 aa  42.7  0.002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  1.04338e-22  normal  0.800314 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10812  IS1547 transposase  60.53 
 
 		 303 aa  43.1  0.002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.156779  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2085  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  52.27 
 
 		 364 aa  42  0.004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000256  normal  0.0160957 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2255  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  52.27 
 
 		 364 aa  42  0.004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000526829  normal  0.161762 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>