22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_0470 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_0470    100 
 
 		 767 bp  1520    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4443  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  96.39 
 
 		 444 bp  706    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3415  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  92.84 
 
 		 528 bp  474  1.0000000000000001e-131  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3417  hypothetical protein  96.2 
 
 		 219 bp  266  8.999999999999999e-69  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20200  transposase  91.11 
 
 		 1137 bp  58  0.000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.12815 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20180    91.11 
 
 		 3818 bp  58  0.000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.0720363 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0426  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  92.31 
 
 		 1092 bp  54  0.00006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0425    92.31 
 
 		 2179 bp  54  0.00006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2085  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  96.67 
 
 		 1095 bp  52  0.0002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000256  normal  0.0160957 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2255  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  96.67 
 
 		 1095 bp  52  0.0002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000526829  normal  0.161762 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2305  hypothetical protein  86.79 
 
 		 519 bp  50.1  0.001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.876507  normal  0.528766 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04230  transposase  91.67 
 
 		 1209 bp  48.1  0.004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.389305  normal  0.67881 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0034  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  91.67 
 
 		 1047 bp  48.1  0.004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0221  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  91.67 
 
 		 1047 bp  48.1  0.004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0759  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  91.67 
 
 		 1047 bp  48.1  0.004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1198  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  91.67 
 
 		 1047 bp  48.1  0.004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1275  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  91.67 
 
 		 1047 bp  48.1  0.004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.455752  normal  0.806138 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1872  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  91.67 
 
 		 1047 bp  48.1  0.004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.137932  hitchhiker  0.00933127 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2006  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  91.67 
 
 		 1047 bp  48.1  0.004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00873285  hitchhiker  0.00397123 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2060  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  91.67 
 
 		 1047 bp  48.1  0.004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000000298499  normal  0.0142271 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3289  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  91.67 
 
 		 1047 bp  48.1  0.004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000246247  hitchhiker  0.00945293 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2982  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  85 
 
 		 984 bp  48.1  0.004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000410087 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>