14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ksed_17780 on replicon NC_013169
Organism: Kytococcus sedentarius DSM 20547



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013169  Ksed_17780    100 
 
 		 226 bp  448  1.0000000000000001e-124  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.657265  normal  0.461539 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18720  transposase  98.67 
 
 		 873 bp  416  1e-114  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23540  transposase  98.67 
 
 		 873 bp  416  1e-114  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21090    98.22 
 
 		 693 bp  406  1e-111  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20160  transposase  97.78 
 
 		 873 bp  398  1e-109  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.204187  normal  0.0283567 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23470    97.96 
 
 		 844 bp  349  2e-94  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2437    87.25 
 
 		 249 bp  99.6  3e-19  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000416756 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3211  integrase catalytic subunit  86.21 
 
 		 867 bp  77.8  0.000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10250  hypothetical protein  86.44 
 
 		 147 bp  54  0.00002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2595  Integrase catalytic region  84.62 
 
 		 888 bp  50.1  0.0003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1094  integrase catalytic subunit  86.54 
 
 		 858 bp  48.1  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5959  integrase catalytic subunit  86.54 
 
 		 858 bp  48.1  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.637785  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3195  integrase catalytic subunit  86.54 
 
 		 858 bp  48.1  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0240069  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0625    91.43 
 
 		 396 bp  46.1  0.004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>