18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cfla_2437 on replicon NC_014151
Organism: Cellulomonas flavigena DSM 20109



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014151  Cfla_2437    100 
 
 		 249 bp  494  9.999999999999999e-139  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000416756 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20160  transposase  89.11 
 
 		 873 bp  113  2.0000000000000002e-23  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.204187  normal  0.0283567 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21090    91.67 
 
 		 693 bp  111  9.000000000000001e-23  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18720  transposase  88.24 
 
 		 873 bp  107  1e-21  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23540  transposase  90.59 
 
 		 873 bp  105  6e-21  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17780    87.25 
 
 		 226 bp  99.6  4e-19  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.657265  normal  0.461539 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3211  integrase catalytic subunit  87.34 
 
 		 867 bp  77.8  0.000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2595  Integrase catalytic region  89.23 
 
 		 888 bp  73.8  0.00000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4506  Integrase catalytic region  86.15 
 
 		 867 bp  58  0.000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.126933 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23470    91.11 
 
 		 844 bp  58  0.000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0625    92.11 
 
 		 396 bp  52  0.00007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0648  hypothetical protein  92.11 
 
 		 921 bp  52  0.00007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1932  integrase catalytic subunit  92.11 
 
 		 864 bp  52  0.00007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  decreased coverage  0.00436726  normal  0.0854041 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3351  integrase catalytic subunit  92.11 
 
 		 864 bp  52  0.00007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.335506  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3645  Integrase catalytic region  86.79 
 
 		 861 bp  50.1  0.0003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3195  integrase catalytic subunit  86.27 
 
 		 858 bp  46.1  0.005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0240069  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5959  integrase catalytic subunit  86.27 
 
 		 858 bp  46.1  0.005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.637785  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1094  integrase catalytic subunit  86.27 
 
 		 858 bp  46.1  0.005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>