49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_0625 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_0625    100 
 
 		 396 bp  785    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2595  Integrase catalytic region  89.5 
 
 		 888 bp  230  2e-58  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5589  integrase catalytic subunit  85.86 
 
 		 828 bp  170  2e-40  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.417807  normal  1 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5990  integrase catalytic subunit  85.86 
 
 		 828 bp  170  2e-40  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000684507 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3351  integrase catalytic subunit  84.49 
 
 		 864 bp  168  6.9999999999999995e-40  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.335506  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1932  integrase catalytic subunit  84.49 
 
 		 864 bp  168  6.9999999999999995e-40  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  decreased coverage  0.00436726  normal  0.0854041 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10250  hypothetical protein  91.13 
 
 		 147 bp  159  7e-37  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3195  integrase catalytic subunit  83.63 
 
 		 858 bp  155  1e-35  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0240069  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5968    85.28 
 
 		 821 bp  153  4e-35  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3190  integrase catalytic subunit  84.69 
 
 		 822 bp  151  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3240  integrase catalytic subunit  84.69 
 
 		 822 bp  151  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3178  integrase catalytic subunit  84.69 
 
 		 822 bp  151  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5959  integrase catalytic subunit  83.19 
 
 		 858 bp  147  3e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.637785  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0648  hypothetical protein  82.68 
 
 		 921 bp  139  7.000000000000001e-31  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1094  integrase catalytic subunit  82.74 
 
 		 858 bp  139  7.000000000000001e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0615  transposase subunit  82.65 
 
 		 465 bp  119  6e-25  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10270  transposase  84.62 
 
 		 666 bp  89.7  6e-16  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1664  hypothetical protein  84.85 
 
 		 480 bp  77.8  0.000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20160  transposase  89.23 
 
 		 873 bp  73.8  0.00000000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.204187  normal  0.0283567 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3645  Integrase catalytic region  85.06 
 
 		 861 bp  69.9  0.0000000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17900    82.73 
 
 		 888 bp  67.9  0.000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.422177 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18720  transposase  87.69 
 
 		 873 bp  65.9  0.000000008  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23540  transposase  87.69 
 
 		 873 bp  65.9  0.000000008  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23470    87.69 
 
 		 844 bp  65.9  0.000000008  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21090    87.1 
 
 		 693 bp  60  0.0000005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03410  transposase  91.11 
 
 		 867 bp  58  0.000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4506  Integrase catalytic region  84 
 
 		 867 bp  54  0.00003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.126933 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2437    92.11 
 
 		 249 bp  52  0.0001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000416756 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1279  hypothetical protein  96.67 
 
 		 1110 bp  52  0.0001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0226415 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1963  hypothetical protein  96.43 
 
 		 240 bp  48.1  0.002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.127719  normal  0.497147 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1182    91.43 
 
 		 1749 bp  46.1  0.007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17780    91.43 
 
 		 226 bp  46.1  0.007  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.657265  normal  0.461539 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4660  Integrase catalytic region  91.43 
 
 		 969 bp  46.1  0.007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2801  Integrase catalytic region  91.43 
 
 		 969 bp  46.1  0.007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0160717  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2669    91.43 
 
 		 3924 bp  46.1  0.007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2658  Integrase catalytic region  91.43 
 
 		 969 bp  46.1  0.007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2656    91.43 
 
 		 2656 bp  46.1  0.007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2588  Integrase catalytic region  91.43 
 
 		 969 bp  46.1  0.007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1739  Integrase catalytic region  91.43 
 
 		 969 bp  46.1  0.007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0682469  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1180    91.43 
 
 		 615 bp  46.1  0.007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1177  Integrase catalytic region  91.43 
 
 		 969 bp  46.1  0.007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1173  Integrase catalytic region  91.43 
 
 		 969 bp  46.1  0.007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0819  Integrase catalytic region  91.43 
 
 		 969 bp  46.1  0.007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0737  Integrase catalytic region  91.43 
 
 		 969 bp  46.1  0.007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0714    91.43 
 
 		 969 bp  46.1  0.007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0712    91.43 
 
 		 2569 bp  46.1  0.007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0710    91.43 
 
 		 5675 bp  46.1  0.007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0367  Integrase catalytic region  91.43 
 
 		 969 bp  46.1  0.007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0364  Integrase catalytic region  91.43 
 
 		 969 bp  46.1  0.007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>