61 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_5968 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009338  Mflv_3195  integrase catalytic subunit  88.7 
 
 		 858 bp  870    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0240069  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5968    100 
 
 		 821 bp  1628    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5959  integrase catalytic subunit  84.33 
 
 		 858 bp  585  1.0000000000000001e-165  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.637785  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1094  integrase catalytic subunit  84.2 
 
 		 858 bp  577  1.0000000000000001e-162  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0615  transposase subunit  89.41 
 
 		 465 bp  500  1e-139  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5589  integrase catalytic subunit  86.07 
 
 		 828 bp  383  1e-104  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.417807  normal  1 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5990  integrase catalytic subunit  86.07 
 
 		 828 bp  383  1e-104  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000684507 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3178  integrase catalytic subunit  84.49 
 
 		 822 bp  327  3e-87  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3190  integrase catalytic subunit  84.49 
 
 		 822 bp  327  3e-87  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3240  integrase catalytic subunit  84.49 
 
 		 822 bp  327  3e-87  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0604  transposase subunit  83.44 
 
 		 384 bp  206  7e-51  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0625    85.28 
 
 		 396 bp  153  9e-35  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1932  integrase catalytic subunit  83.5 
 
 		 864 bp  139  9.999999999999999e-31  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  decreased coverage  0.00436726  normal  0.0854041 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3351  integrase catalytic subunit  83.5 
 
 		 864 bp  139  9.999999999999999e-31  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.335506  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0603  integrase, catalytic region  83.92 
 
 		 396 bp  133  9.000000000000001e-29  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10270  transposase  81.86 
 
 		 666 bp  109  1e-21  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2595  Integrase catalytic region  84.62 
 
 		 888 bp  109  1e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2569    81.43 
 
 		 513 bp  107  5e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.266812  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23540  transposase  85.6 
 
 		 873 bp  105  2e-20  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4462  Integrase catalytic region  86.09 
 
 		 882 bp  101  3e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3497  Integrase catalytic region  86.09 
 
 		 882 bp  101  3e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000045245  hitchhiker  0.0084988 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2873  Integrase catalytic region  86.09 
 
 		 882 bp  101  3e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000164052  normal  0.0134902 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2066  Integrase catalytic region  86.09 
 
 		 882 bp  101  3e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000236626  normal  0.0115324 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1242  Integrase catalytic region  86.09 
 
 		 882 bp  101  3e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0782123  normal  0.315212 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3645  Integrase catalytic region  84.44 
 
 		 861 bp  101  3e-19  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0628  Integrase catalytic region  86.09 
 
 		 882 bp  101  3e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0131  Integrase catalytic region  86.09 
 
 		 882 bp  101  3e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23470    84.8 
 
 		 844 bp  97.6  5e-18  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21070    84.8 
 
 		 288 bp  97.6  5e-18  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.866093  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20160  transposase  84.8 
 
 		 873 bp  97.6  5e-18  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.204187  normal  0.0283567 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05310    85.34 
 
 		 830 bp  95.6  2e-17  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17800    84 
 
 		 2354 bp  89.7  0.000000000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.750484  normal  0.695499 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10250  hypothetical protein  94.55 
 
 		 147 bp  85.7  0.00000000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2849  Integrase catalytic region  87.65 
 
 		 822 bp  81.8  0.0000000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.413634 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2396  Integrase catalytic region  87.65 
 
 		 822 bp  81.8  0.0000000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18720  transposase  82.4 
 
 		 873 bp  73.8  0.00000000007  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17900    85.57 
 
 		 888 bp  73.8  0.00000000007  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.422177 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2272  Integrase catalytic region  86.42 
 
 		 822 bp  73.8  0.00000000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03410  transposase  90.91 
 
 		 867 bp  69.9  0.000000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3211  integrase catalytic subunit  84.21 
 
 		 867 bp  69.9  0.000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3958  Integrase catalytic region  81.54 
 
 		 900 bp  67.9  0.000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3955  Integrase catalytic region  81.54 
 
 		 900 bp  67.9  0.000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3485    81.54 
 
 		 900 bp  67.9  0.000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3484    81.54 
 
 		 2322 bp  67.9  0.000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2706  Integrase catalytic region  81.54 
 
 		 900 bp  67.9  0.000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.308367  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1485  Integrase catalytic region  81.54 
 
 		 900 bp  67.9  0.000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.110479  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1438  Integrase catalytic region  81.54 
 
 		 900 bp  67.9  0.000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.19479  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1429  Integrase catalytic region  81.54 
 
 		 900 bp  67.9  0.000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1004  Integrase catalytic region  81.54 
 
 		 900 bp  67.9  0.000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.217613  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0384  Integrase catalytic region  81.54 
 
 		 900 bp  67.9  0.000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0378  Integrase catalytic region  81.54 
 
 		 900 bp  67.9  0.000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0300  Integrase catalytic region  81.54 
 
 		 900 bp  67.9  0.000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.522174  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0277  Integrase catalytic region  81.54 
 
 		 900 bp  67.9  0.000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0254  Integrase catalytic region  81.54 
 
 		 900 bp  67.9  0.000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.59969  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0230    81.54 
 
 		 900 bp  67.9  0.000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0648  hypothetical protein  81.45 
 
 		 921 bp  63.9  0.00000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4506  Integrase catalytic region  87.5 
 
 		 867 bp  56  0.00002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.126933 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06570  transposase  84.51 
 
 		 882 bp  54  0.00006  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.246585  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1564  integrase catalytic subunit  100 
 
 		 837 bp  54  0.00006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.403634  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0564  integrase catalytic region  100 
 
 		 837 bp  52  0.0003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.22633  normal  0.244778 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2352  integrase catalytic region  100 
 
 		 837 bp  52  0.0003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.311637  normal  0.149217 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>