53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ksed_21070 on replicon NC_013169
Organism: Kytococcus sedentarius DSM 20547



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013169  Ksed_21070    100 
 
 		 288 bp  571  1e-161  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.866093  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20160  transposase  100 
 
 		 873 bp  567  1e-160  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.204187  normal  0.0283567 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23470    99.3 
 
 		 844 bp  551  1e-155  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23540  transposase  98.95 
 
 		 873 bp  543  1e-153  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18720  transposase  98.6 
 
 		 873 bp  535  1e-150  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17800    98.25 
 
 		 2354 bp  525  1e-147  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.750484  normal  0.695499 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2569    86.86 
 
 		 513 bp  129  5e-28  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.266812  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2849  Integrase catalytic region  85.26 
 
 		 822 bp  127  2e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.413634 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2396  Integrase catalytic region  85.26 
 
 		 822 bp  127  2e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2272  Integrase catalytic region  85.26 
 
 		 822 bp  127  2e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3178  integrase catalytic subunit  86.4 
 
 		 822 bp  113  3e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3190  integrase catalytic subunit  86.4 
 
 		 822 bp  113  3e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3240  integrase catalytic subunit  86.4 
 
 		 822 bp  113  3e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3645  Integrase catalytic region  85.71 
 
 		 861 bp  107  2e-21  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0603  integrase, catalytic region  84.92 
 
 		 396 bp  99.6  4e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5968    84.8 
 
 		 821 bp  97.6  2e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4506  Integrase catalytic region  83.97 
 
 		 867 bp  93.7  3e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.126933 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10270  transposase  84.13 
 
 		 666 bp  91.7  1e-16  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3195  integrase catalytic subunit  84 
 
 		 858 bp  89.7  4e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0240069  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3484    82.86 
 
 		 2322 bp  87.7  0.000000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3958  Integrase catalytic region  82.86 
 
 		 900 bp  87.7  0.000000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0230    82.86 
 
 		 900 bp  87.7  0.000000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0254  Integrase catalytic region  82.86 
 
 		 900 bp  87.7  0.000000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.59969  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0277  Integrase catalytic region  82.86 
 
 		 900 bp  87.7  0.000000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0300  Integrase catalytic region  82.86 
 
 		 900 bp  87.7  0.000000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.522174  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0378  Integrase catalytic region  82.86 
 
 		 900 bp  87.7  0.000000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3955  Integrase catalytic region  82.86 
 
 		 900 bp  87.7  0.000000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3485    82.86 
 
 		 900 bp  87.7  0.000000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0384  Integrase catalytic region  82.86 
 
 		 900 bp  87.7  0.000000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1004  Integrase catalytic region  82.86 
 
 		 900 bp  87.7  0.000000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.217613  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2706  Integrase catalytic region  82.86 
 
 		 900 bp  87.7  0.000000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.308367  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1485  Integrase catalytic region  82.86 
 
 		 900 bp  87.7  0.000000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.110479  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1429  Integrase catalytic region  82.86 
 
 		 900 bp  87.7  0.000000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1438  Integrase catalytic region  82.86 
 
 		 900 bp  87.7  0.000000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.19479  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3497  Integrase catalytic region  81.63 
 
 		 882 bp  77.8  0.000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000045245  hitchhiker  0.0084988 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4462  Integrase catalytic region  81.63 
 
 		 882 bp  77.8  0.000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2873  Integrase catalytic region  81.63 
 
 		 882 bp  77.8  0.000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000164052  normal  0.0134902 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2066  Integrase catalytic region  81.63 
 
 		 882 bp  77.8  0.000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000236626  normal  0.0115324 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1242  Integrase catalytic region  81.63 
 
 		 882 bp  77.8  0.000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0782123  normal  0.315212 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0628  Integrase catalytic region  81.63 
 
 		 882 bp  77.8  0.000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0131  Integrase catalytic region  81.63 
 
 		 882 bp  77.8  0.000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03410  transposase  82.68 
 
 		 867 bp  77.8  0.000000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5589  integrase catalytic subunit  82.54 
 
 		 828 bp  75.8  0.000000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.417807  normal  1 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5990  integrase catalytic subunit  82.54 
 
 		 828 bp  75.8  0.000000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000684507 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2595  Integrase catalytic region  82.54 
 
 		 888 bp  75.8  0.000000000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5959  integrase catalytic subunit  82.35 
 
 		 858 bp  69.9  0.0000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.637785  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1094  integrase catalytic subunit  81.51 
 
 		 858 bp  61.9  0.00000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3351  integrase catalytic subunit  80.95 
 
 		 864 bp  60  0.0000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.335506  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1932  integrase catalytic subunit  80.95 
 
 		 864 bp  60  0.0000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  decreased coverage  0.00436726  normal  0.0854041 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05310    100 
 
 		 830 bp  58  0.000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06570  transposase  82.22 
 
 		 882 bp  52  0.00009  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.246585  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3211  integrase catalytic subunit  100 
 
 		 867 bp  52  0.00009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0604  transposase subunit  96.55 
 
 		 384 bp  50.1  0.0003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>