94 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_3484 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_3484    100 
 
 		 2322 bp  4603    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1438  Integrase catalytic region  99.89 
 
 		 900 bp  1776    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.19479  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1429  Integrase catalytic region  99.89 
 
 		 900 bp  1776    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1004  Integrase catalytic region  99.89 
 
 		 900 bp  1776    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.217613  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1485  Integrase catalytic region  99.89 
 
 		 900 bp  1776    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.110479  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0384  Integrase catalytic region  99.89 
 
 		 900 bp  1776    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0378  Integrase catalytic region  99.89 
 
 		 900 bp  1776    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2706  Integrase catalytic region  99.89 
 
 		 900 bp  1776    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.308367  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3485    100 
 
 		 900 bp  1784    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0300  Integrase catalytic region  99.89 
 
 		 900 bp  1776    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.522174  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0277  Integrase catalytic region  99.89 
 
 		 900 bp  1776    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0230    100 
 
 		 900 bp  1784    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3955  Integrase catalytic region  99.89 
 
 		 900 bp  1776    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0254  Integrase catalytic region  99.89 
 
 		 900 bp  1776    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.59969  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3958  Integrase catalytic region  99.89 
 
 		 900 bp  1776    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3486  transposase IS3/IS911 family protein  100 
 
 		 303 bp  601  1e-169  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0301  transposase IS3/IS911 family protein  100 
 
 		 294 bp  583  1e-164  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.396168  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0276  transposase IS3/IS911 family protein  100 
 
 		 294 bp  583  1e-164  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0377  transposase IS3/IS911 family protein  100 
 
 		 294 bp  583  1e-164  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0385  transposase IS3/IS911 family protein  100 
 
 		 294 bp  583  1e-164  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0231  transposase IS3/IS911 family protein  100 
 
 		 294 bp  583  1e-164  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1003  transposase IS3/IS911 family protein  100 
 
 		 294 bp  583  1e-164  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.912886  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1430  transposase IS3/IS911 family protein  100 
 
 		 294 bp  583  1e-164  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0255  transposase IS3/IS911 family protein  100 
 
 		 294 bp  583  1e-164  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.495162  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2705  transposase IS3/IS911 family protein  100 
 
 		 294 bp  583  1e-164  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.217344  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1439  transposase IS3/IS911 family protein  100 
 
 		 294 bp  583  1e-164  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0436436  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1486  transposase IS3/IS911 family protein  100 
 
 		 294 bp  583  1e-164  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.089931  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3957  transposase IS3/IS911 family protein  100 
 
 		 294 bp  583  1e-164  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3954  transposase IS3/IS911 family protein  100 
 
 		 294 bp  583  1e-164  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3178  integrase catalytic subunit  86.96 
 
 		 822 bp  131  1e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3190  integrase catalytic subunit  86.96 
 
 		 822 bp  131  1e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3240  integrase catalytic subunit  86.96 
 
 		 822 bp  131  1e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3351  integrase catalytic subunit  83.53 
 
 		 864 bp  115  6e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.335506  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1932  integrase catalytic subunit  83.53 
 
 		 864 bp  115  6e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  decreased coverage  0.00436726  normal  0.0854041 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5959  integrase catalytic subunit  84.85 
 
 		 858 bp  103  2e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.637785  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10270  transposase  87.25 
 
 		 666 bp  99.6  4e-18  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0648  hypothetical protein  82.14 
 
 		 921 bp  95.6  5e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0604  transposase subunit  84.09 
 
 		 384 bp  95.6  5e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2595  Integrase catalytic region  87 
 
 		 888 bp  95.6  5e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1094  integrase catalytic subunit  84.09 
 
 		 858 bp  95.6  5e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3645  Integrase catalytic region  82.89 
 
 		 861 bp  95.6  5e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3195  integrase catalytic subunit  83.33 
 
 		 858 bp  91.7  9e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0240069  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05320  Transposase  87.1 
 
 		 309 bp  89.7  0.000000000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06580  Transposase  88.89 
 
 		 288 bp  89.7  0.000000000000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0602807  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23470    82.86 
 
 		 844 bp  87.7  0.00000000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21070    82.86 
 
 		 288 bp  87.7  0.00000000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.866093  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20160  transposase  82.86 
 
 		 873 bp  87.7  0.00000000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.204187  normal  0.0283567 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0603  integrase, catalytic region  83.33 
 
 		 396 bp  87.7  0.00000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05310    87.37 
 
 		 830 bp  85.7  0.00000000000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10240  Transposase  87.36 
 
 		 294 bp  85.7  0.00000000000005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2596  transposase IS3/IS911 family protein  82.12 
 
 		 294 bp  85.7  0.00000000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2272  Integrase catalytic region  93.1 
 
 		 822 bp  83.8  0.0000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2396  Integrase catalytic region  93.1 
 
 		 822 bp  83.8  0.0000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2849  Integrase catalytic region  93.1 
 
 		 822 bp  83.8  0.0000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.413634 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3646  transposase IS3/IS911 family protein  86.02 
 
 		 303 bp  81.8  0.0000000000008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4463  transposase IS3/IS911 family protein  89.04 
 
 		 288 bp  81.8  0.0000000000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3498  transposase IS3/IS911 family protein  89.04 
 
 		 288 bp  81.8  0.0000000000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000201546  hitchhiker  0.0065159 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2874  transposase IS3/IS911 family protein  89.04 
 
 		 288 bp  81.8  0.0000000000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000119781  normal  0.0116758 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2065  transposase IS3/IS911 family protein  89.04 
 
 		 288 bp  81.8  0.0000000000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000072844  hitchhiker  0.00973796 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1241  transposase IS3/IS911 family protein  89.04 
 
 		 288 bp  81.8  0.0000000000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0276209  normal  0.427861 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0629  transposase IS3/IS911 family protein  89.04 
 
 		 288 bp  81.8  0.0000000000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0130  transposase IS3/IS911 family protein  89.04 
 
 		 288 bp  81.8  0.0000000000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3350  transposase IS3/IS911 family protein  86.9 
 
 		 309 bp  79.8  0.000000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.315603  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23540  transposase  82.14 
 
 		 873 bp  79.8  0.000000000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17800    82.14 
 
 		 2354 bp  79.8  0.000000000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.750484  normal  0.695499 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1061    83.06 
 
 		 234 bp  79.8  0.000000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.807102  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1933  transposase IS3/IS911 family protein  86.9 
 
 		 309 bp  79.8  0.000000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  decreased coverage  0.00315482  normal  0.132738 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5589  integrase catalytic subunit  81.56 
 
 		 828 bp  73.8  0.0000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.417807  normal  1 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5990  integrase catalytic subunit  81.56 
 
 		 828 bp  73.8  0.0000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000684507 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10250  hypothetical protein  87.5 
 
 		 147 bp  71.9  0.0000000008  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1095  transposase IS3/IS911 family protein  85.71 
 
 		 309 bp  71.9  0.0000000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5960  transposase IS3/IS911 family protein  85.71 
 
 		 309 bp  71.9  0.0000000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.323825  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18720  transposase  81.43 
 
 		 873 bp  71.9  0.0000000008  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5968    81.54 
 
 		 821 bp  67.9  0.00000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0626    86.96 
 
 		 294 bp  65.9  0.00000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0616  transposase IS3/IS911 family protein  84.81 
 
 		 309 bp  61.9  0.0000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1002  ABC transporter related protein  100 
 
 		 612 bp  60  0.000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.64184  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0302  Integrase catalytic region  100 
 
 		 912 bp  60  0.000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21100  Transposase  87.72 
 
 		 300 bp  58  0.00001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18710  Transposase  87.72 
 
 		 300 bp  58  0.00001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4550  mannosyltransferase  96.97 
 
 		 1221 bp  58  0.00001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.637141  normal  0.185586 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20150  Transposase  87.72 
 
 		 300 bp  58  0.00001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.101753  normal  0.0248852 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1664  hypothetical protein  80 
 
 		 480 bp  58  0.00001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4506  Integrase catalytic region  87.5 
 
 		 867 bp  56  0.00005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.126933 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3194  transposase IS3/IS911 family protein  83.33 
 
 		 309 bp  56  0.00005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0960855  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03390    88.46 
 
 		 1733 bp  56  0.00005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17900    81.55 
 
 		 888 bp  54  0.0002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.422177 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2569    96.77 
 
 		 513 bp  54  0.0002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.266812  n/a   
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5991  transposase IS3/IS911 family protein  82.93 
 
 		 309 bp  52  0.0007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000160623 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5590  transposase IS3/IS911  82.93 
 
 		 309 bp  52  0.0007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.302178  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3211  integrase catalytic subunit  85.96 
 
 		 867 bp  50.1  0.003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17770  Transposase  85.96 
 
 		 300 bp  50.1  0.003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.894128  normal  0.461539 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23460  Transposase  85.96 
 
 		 300 bp  50.1  0.003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.519967  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23530  Transposase  85.96 
 
 		 300 bp  50.1  0.003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>