273 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_1003 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014158  Tpau_0231  transposase IS3/IS911 family protein  100 
 
 
97 aa  199  9.999999999999999e-51  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1486  transposase IS3/IS911 family protein  100 
 
 
97 aa  199  9.999999999999999e-51  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.089931  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1439  transposase IS3/IS911 family protein  100 
 
 
97 aa  199  9.999999999999999e-51  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0436436  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3957  transposase IS3/IS911 family protein  100 
 
 
97 aa  199  9.999999999999999e-51  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2705  transposase IS3/IS911 family protein  100 
 
 
97 aa  199  9.999999999999999e-51  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.217344  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3954  transposase IS3/IS911 family protein  100 
 
 
97 aa  199  9.999999999999999e-51  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0276  transposase IS3/IS911 family protein  100 
 
 
97 aa  199  9.999999999999999e-51  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0377  transposase IS3/IS911 family protein  100 
 
 
97 aa  199  9.999999999999999e-51  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0385  transposase IS3/IS911 family protein  100 
 
 
97 aa  199  9.999999999999999e-51  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0255  transposase IS3/IS911 family protein  100 
 
 
97 aa  199  9.999999999999999e-51  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.495162  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0301  transposase IS3/IS911 family protein  100 
 
 
97 aa  199  9.999999999999999e-51  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.396168  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1003  transposase IS3/IS911 family protein  100 
 
 
97 aa  199  9.999999999999999e-51  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.912886  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1430  transposase IS3/IS911 family protein  100 
 
 
97 aa  199  9.999999999999999e-51  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3486  transposase IS3/IS911 family protein  98.97 
 
 
100 aa  197  3.9999999999999996e-50  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10240  Transposase  79.38 
 
 
97 aa  160  4.0000000000000004e-39  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2596  transposase IS3/IS911 family protein  78.35 
 
 
97 aa  157  6e-38  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1933  transposase IS3/IS911 family protein  68.04 
 
 
102 aa  144  4.0000000000000006e-34  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  decreased coverage  0.00315482  normal  0.132738 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3350  transposase IS3/IS911 family protein  68.04 
 
 
102 aa  144  4.0000000000000006e-34  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.315603  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3194  transposase IS3/IS911 family protein  65.98 
 
 
102 aa  138  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0960855  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3646  transposase IS3/IS911 family protein  68.04 
 
 
100 aa  134  6.0000000000000005e-31  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2874  transposase IS3/IS911 family protein  65.98 
 
 
95 aa  124  6e-28  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000119781  normal  0.0116758 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0629  transposase IS3/IS911 family protein  65.98 
 
 
95 aa  124  6e-28  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2065  transposase IS3/IS911 family protein  65.98 
 
 
95 aa  124  6e-28  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000072844  hitchhiker  0.00973796 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06580  Transposase  67.35 
 
 
95 aa  122  1e-27  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0602807  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0130  transposase IS3/IS911 family protein  64.95 
 
 
95 aa  122  2e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4463  transposase IS3/IS911 family protein  64.95 
 
 
95 aa  122  2e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3498  transposase IS3/IS911 family protein  64.95 
 
 
95 aa  122  2e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000201546  hitchhiker  0.0065159 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3241  transposase IS3/IS911 family protein  67.01 
 
 
102 aa  121  2e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.680092  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3191  transposase IS3/IS911 family protein  67.01 
 
 
102 aa  121  2e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1241  transposase IS3/IS911 family protein  64.95 
 
 
95 aa  120  4e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0276209  normal  0.427861 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17910  Transposase  60.64 
 
 
101 aa  120  6e-27  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.252162 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0616  transposase IS3/IS911 family protein  64.95 
 
 
102 aa  120  6e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1095  transposase IS3/IS911 family protein  64.95 
 
 
102 aa  119  9.999999999999999e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5960  transposase IS3/IS911 family protein  64.95 
 
 
102 aa  119  9.999999999999999e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.323825  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3179  transposase IS3/IS911  65.98 
 
 
115 aa  119  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5590  transposase IS3/IS911  63.92 
 
 
102 aa  117  6e-26  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.302178  normal 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5991  transposase IS3/IS911 family protein  63.92 
 
 
102 aa  117  6e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000160623 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20150  Transposase  62.77 
 
 
99 aa  115  1.9999999999999998e-25  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.101753  normal  0.0248852 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21100  Transposase  62.77 
 
 
99 aa  115  1.9999999999999998e-25  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23530  Transposase  62.77 
 
 
99 aa  115  3e-25  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23460  Transposase  61.7 
 
 
99 aa  113  1.0000000000000001e-24  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.519967  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18710  Transposase  61.7 
 
 
99 aa  113  1.0000000000000001e-24  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17770  Transposase  61.7 
 
 
99 aa  110  5e-24  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.894128  normal  0.461539 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2438  transposase IS3/IS911 family protein  56.84 
 
 
94 aa  110  6e-24  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000416756 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05320  Transposase  59.79 
 
 
102 aa  109  1.0000000000000001e-23  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3210  transposase IS3/IS911 family protein  56.57 
 
 
98 aa  99  2e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2271  transposase IS3/IS911 family protein  47 
 
 
108 aa  84.7  4e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2848  transposase IS3/IS911 family protein  47 
 
 
108 aa  84.7  4e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.389181 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2395  transposase IS3/IS911 family protein  47 
 
 
108 aa  84.7  4e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4507  transposase IS3/IS911 family protein  51.65 
 
 
93 aa  83.2  0.000000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.122845 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1509  transposase IS3/IS911  45.74 
 
 
95 aa  81.6  0.000000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1532  transposase IS3/IS911 family protein  45.74 
 
 
95 aa  81.6  0.000000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0800  transposase IS3/IS911 family protein  44.21 
 
 
95 aa  80.1  0.000000000000009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2154  transposase IS3/IS911 family protein  44.68 
 
 
95 aa  77.8  0.00000000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00432378 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5969  transposase IS3/IS911 family protein  55 
 
 
115 aa  74.3  0.0000000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1726  transposase IS3/IS911  40.21 
 
 
96 aa  65.9  0.0000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.110151 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2846  transposase IS3/IS911 family protein  35.11 
 
 
105 aa  61.6  0.000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.114826 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2458  transposase IS3/IS911 family protein  35.11 
 
 
105 aa  61.6  0.000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25110  Transposase  37.25 
 
 
106 aa  61.2  0.000000005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2965  transposase IS3/IS911 family protein  34.38 
 
 
106 aa  57.4  0.00000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.173924  normal  0.0404895 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1148  transposase IS3/IS911 family protein  34.38 
 
 
106 aa  57.4  0.00000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0063  transposase IS3/IS911 family protein  32.99 
 
 
109 aa  54.7  0.0000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013596  Sros_9415  transposase IS3/IS911 family protein  31.96 
 
 
95 aa  53.9  0.0000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4688  transposase IS3/IS911 family protein  31.96 
 
 
95 aa  53.9  0.0000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.205406  normal  0.571862 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4704  transposase IS3/IS911 family protein  31.96 
 
 
95 aa  53.9  0.0000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2226  transposase IS3/IS911  29.7 
 
 
107 aa  52.4  0.000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7354  transposase IS3/IS911 family protein  33.71 
 
 
105 aa  52.4  0.000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.124441 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3708  transposase IS3/IS911 family protein  31.58 
 
 
110 aa  52.4  0.000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0112916  normal  0.204081 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2520  transposase IS3/IS911 family protein  31.58 
 
 
110 aa  52.4  0.000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000790886  hitchhiker  0.00717197 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1861  transposase IS3/IS911  28.42 
 
 
98 aa  51.6  0.000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.566952  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6733  transposase IS3/IS911 family protein  32.29 
 
 
108 aa  52  0.000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.975909  normal  0.0498418 
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9837  transposase protein  37.68 
 
 
109 aa  51.6  0.000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9899  hypothetical protein  37.68 
 
 
109 aa  51.6  0.000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3286  transposase IS3/IS911 family protein  38.24 
 
 
109 aa  51.6  0.000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0401  transposase IS3/IS911 family protein  34.41 
 
 
100 aa  51.6  0.000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1285  transposase IS3/IS911 family protein  42.42 
 
 
125 aa  51.2  0.000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.593007  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0513  transposase IS3/IS911 family protein  28.26 
 
 
107 aa  50.8  0.000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0520  transposase IS3/IS911 family protein  28.26 
 
 
107 aa  50.8  0.000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0692  transposase IS3/IS911 family protein  28.26 
 
 
107 aa  50.8  0.000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0703  transposase IS3/IS911 family protein  28.26 
 
 
107 aa  50.8  0.000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0705  transposase IS3/IS911 family protein  28.26 
 
 
107 aa  50.8  0.000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.640012  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0709  transposase IS3/IS911 family protein  28.26 
 
 
107 aa  50.8  0.000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2397  transposase IS3/IS911 family protein  28.26 
 
 
107 aa  50.8  0.000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.782698  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2401  transposase IS3/IS911 family protein  28.26 
 
 
107 aa  50.8  0.000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0789235  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3188  transposase IS3/IS911 family protein  28.26 
 
 
107 aa  50.8  0.000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3354  transposase IS3/IS911 family protein  28.26 
 
 
107 aa  50.8  0.000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.548623  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4117  transposase IS3/IS911 family protein  28.26 
 
 
107 aa  50.8  0.000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000145771 
 
 
-
 
NC_010518  Mrad2831_6464  transposase IS3/IS911 family protein  32.29 
 
 
108 aa  50.4  0.000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010517  Mrad2831_6427  transposase IS3/IS911 family protein  32.29 
 
 
108 aa  50.4  0.000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  0.906991 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0365  transposase IS3/IS911 family protein  31.96 
 
 
105 aa  49.7  0.00001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1221  transposase IS3/IS911 family protein  27 
 
 
108 aa  49.7  0.00001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.774632  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1174  transposase IS3/IS911 family protein  31.96 
 
 
105 aa  49.7  0.00001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2657  transposase IS3/IS911 family protein  31.96 
 
 
105 aa  49.7  0.00001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1740  transposase IS3/IS911 family protein  31.96 
 
 
105 aa  49.7  0.00001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.698666  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2587  transposase IS3/IS911 family protein  31.96 
 
 
105 aa  49.7  0.00001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.771833  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4659  transposase IS3/IS911 family protein  31.96 
 
 
105 aa  49.7  0.00001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2668  transposase IS3/IS911 family protein  31.96 
 
 
105 aa  49.7  0.00001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1178  transposase IS3/IS911 family protein  31.96 
 
 
105 aa  49.7  0.00001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2447  transposase IS3/IS911 family protein  28 
 
 
108 aa  49.7  0.00001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000211632  hitchhiker  0.00944163 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1223  transposase IS3/IS911 family protein  27 
 
 
108 aa  49.7  0.00001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.16285  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>