More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_4688 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_4704  transposase IS3/IS911 family protein  100 
 
 
95 aa  189  8e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4688  transposase IS3/IS911 family protein  100 
 
 
95 aa  189  8e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.205406  normal  0.571862 
 
 
-
 
NC_013596  Sros_9415  transposase IS3/IS911 family protein  100 
 
 
95 aa  189  8e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3165  transposase IS3/IS911 family protein  65.52 
 
 
105 aa  118  3e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.897924  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3633  transposase IS3/IS911 family protein  66.67 
 
 
112 aa  116  9e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00000000996449  normal 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7354  transposase IS3/IS911 family protein  66.67 
 
 
105 aa  115  9.999999999999999e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.124441 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0617  transposase IS3/IS911 family protein  63.16 
 
 
106 aa  113  7.999999999999999e-25  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.599694  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1726  transposase IS3/IS911  54.74 
 
 
96 aa  94  7e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.110151 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3994  transposase IS3/IS911 family protein  54.26 
 
 
111 aa  91.7  3e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0709  transposase IS3/IS911 family protein  52.75 
 
 
107 aa  89.4  2e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2401  transposase IS3/IS911 family protein  52.75 
 
 
107 aa  89.4  2e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0789235  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2397  transposase IS3/IS911 family protein  52.75 
 
 
107 aa  89.4  2e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.782698  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3354  transposase IS3/IS911 family protein  52.75 
 
 
107 aa  89.4  2e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.548623  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4117  transposase IS3/IS911 family protein  52.75 
 
 
107 aa  89.4  2e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000145771 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3188  transposase IS3/IS911 family protein  52.75 
 
 
107 aa  89.4  2e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0705  transposase IS3/IS911 family protein  52.75 
 
 
107 aa  89.4  2e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.640012  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0513  transposase IS3/IS911 family protein  52.75 
 
 
107 aa  89.4  2e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0520  transposase IS3/IS911 family protein  52.75 
 
 
107 aa  89.4  2e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0692  transposase IS3/IS911 family protein  52.75 
 
 
107 aa  89.4  2e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0703  transposase IS3/IS911 family protein  52.75 
 
 
107 aa  89.4  2e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0800  transposase IS3/IS911 family protein  47.92 
 
 
95 aa  86.7  1e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2226  transposase IS3/IS911  47.96 
 
 
107 aa  86.7  1e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4007  transposase IS3/IS911 family protein  58.51 
 
 
111 aa  84  6e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5597  transposase IS3/IS911 family protein  58.51 
 
 
111 aa  84  6e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1861  transposase IS3/IS911  47.37 
 
 
98 aa  83.6  9e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.566952  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1509  transposase IS3/IS911  46.88 
 
 
95 aa  83.2  0.000000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1532  transposase IS3/IS911 family protein  46.88 
 
 
95 aa  83.2  0.000000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2154  transposase IS3/IS911 family protein  46.88 
 
 
95 aa  80.5  0.000000000000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00432378 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2965  transposase IS3/IS911 family protein  46.07 
 
 
106 aa  76.6  0.0000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.173924  normal  0.0404895 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1148  transposase IS3/IS911 family protein  46.07 
 
 
106 aa  76.6  0.0000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2438  transposase IS3/IS911 family protein  42.39 
 
 
94 aa  74.7  0.0000000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000416756 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2065  transposase IS3/IS911 family protein  42.11 
 
 
95 aa  74.3  0.0000000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000072844  hitchhiker  0.00973796 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2874  transposase IS3/IS911 family protein  42.11 
 
 
95 aa  74.3  0.0000000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000119781  normal  0.0116758 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0629  transposase IS3/IS911 family protein  42.11 
 
 
95 aa  74.3  0.0000000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0130  transposase IS3/IS911 family protein  42.11 
 
 
95 aa  73.9  0.0000000000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4463  transposase IS3/IS911 family protein  42.11 
 
 
95 aa  73.9  0.0000000000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3498  transposase IS3/IS911 family protein  42.11 
 
 
95 aa  73.9  0.0000000000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000201546  hitchhiker  0.0065159 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23460  Transposase  42.22 
 
 
99 aa  73.6  0.0000000000009  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.519967  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18710  Transposase  42.22 
 
 
99 aa  73.2  0.000000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1241  transposase IS3/IS911 family protein  41.05 
 
 
95 aa  72  0.000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0276209  normal  0.427861 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21100  Transposase  41.11 
 
 
99 aa  70.5  0.000000000008  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23530  Transposase  41.11 
 
 
99 aa  70.5  0.000000000008  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20150  Transposase  41.11 
 
 
99 aa  70.5  0.000000000008  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.101753  normal  0.0248852 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06580  Transposase  41.05 
 
 
95 aa  70.5  0.000000000008  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0602807  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17770  Transposase  40 
 
 
99 aa  69.7  0.00000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.894128  normal  0.461539 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17910  Transposase  39.78 
 
 
101 aa  67.8  0.00000000005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.252162 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3737  transposase IS3/IS911 family protein  40.78 
 
 
110 aa  65.5  0.0000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1315  transposase IS3/IS911 family protein  44.83 
 
 
109 aa  66.2  0.0000000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0494436  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0981  transposase IS3/IS911 family protein  44.83 
 
 
109 aa  66.2  0.0000000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.267655  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1774  transposase IS3/IS911 family protein  44.83 
 
 
109 aa  66.2  0.0000000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.985835  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0153  transposase IS3/IS911 family protein  44.83 
 
 
109 aa  66.2  0.0000000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0980  transposase IS3/IS911 family protein  44.83 
 
 
109 aa  66.2  0.0000000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.571542  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3706  transposase IS3/IS911 family protein  40.78 
 
 
110 aa  65.5  0.0000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0302  transposase IS3/IS911 family protein  44.83 
 
 
109 aa  66.2  0.0000000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0520  transposase IS3/IS911 family protein  44.83 
 
 
109 aa  66.2  0.0000000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.455953  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0550  transposase IS3/IS911 family protein  43.82 
 
 
109 aa  66.2  0.0000000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5654  transposase IS3/IS911 family protein  41 
 
 
104 aa  65.9  0.0000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.238743  normal 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5988  transposase IS3/IS911 family protein  41 
 
 
104 aa  65.9  0.0000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000845611 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3646  transposase IS3/IS911 family protein  37.89 
 
 
100 aa  64.3  0.0000000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1933  transposase IS3/IS911 family protein  39.18 
 
 
102 aa  64.3  0.0000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  decreased coverage  0.00315482  normal  0.132738 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3350  transposase IS3/IS911 family protein  39.18 
 
 
102 aa  64.3  0.0000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.315603  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0009  transposase IS3/IS911 family protein  38.3 
 
 
109 aa  64.3  0.0000000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.445184  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0739  transposase IS3/IS911 family protein  38.3 
 
 
109 aa  64.3  0.0000000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0235806  normal  0.101516 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6068  transposase DNA binding site ISRme15  38.3 
 
 
112 aa  64.3  0.0000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.382564 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1827  transposase IS3/IS911 family protein  38.3 
 
 
109 aa  64.3  0.0000000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.601714  normal  0.0105174 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5542  transposase DNA binding site ISRme15  38.3 
 
 
112 aa  64.3  0.0000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13358  transposase  42.42 
 
 
108 aa  62.4  0.000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  1.49743e-39  normal  0.534479 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1203  transposase IS3/IS911 family protein  41.58 
 
 
109 aa  62.8  0.000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11807  transposase  42.42 
 
 
108 aa  62.4  0.000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  7.601339999999999e-45  hitchhiker  0.00672447 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12049  transposase  42.42 
 
 
108 aa  62.4  0.000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  1.40799e-27  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3210  transposase IS3/IS911 family protein  33.33 
 
 
98 aa  62.8  0.000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4507  transposase IS3/IS911 family protein  36.46 
 
 
93 aa  62.4  0.000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.122845 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13131  transposase  42.42 
 
 
108 aa  62.4  0.000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.0000102607  normal  0.123533 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12829  transposase  42.42 
 
 
108 aa  62.4  0.000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  2.40646e-19  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13207  transposase  42.42 
 
 
108 aa  62.4  0.000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  4.838360000000001e-28  normal  0.797381 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6259  transposase IS3/IS911 family protein  40 
 
 
98 aa  62.4  0.000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.523501  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10853  transposase  42.42 
 
 
108 aa  62.4  0.000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  1.71857e-46  hitchhiker  0.0000000080045 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11791  transposase  42.42 
 
 
108 aa  62.4  0.000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  7.324620000000001e-61  hitchhiker  0.00000385538 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11347  transposase  42.42 
 
 
108 aa  62.4  0.000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  3.3772600000000003e-34  normal  0.888349 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11774  transposase  42.42 
 
 
108 aa  62.4  0.000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  5.9098299999999996e-43  hitchhiker  0.00000000075724 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11784  transposase  42.42 
 
 
108 aa  62.4  0.000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  4.00725e-90  hitchhiker  0.0000000133913 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11781  transposase  42.42 
 
 
108 aa  62.4  0.000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  6.66965e-85  hitchhiker  0.000000000569119 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12113  transposase  42.42 
 
 
108 aa  62.4  0.000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  3.72555e-57  normal  0.924844 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12377  transposase  42.42 
 
 
108 aa  62.4  0.000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  8.02474e-28  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11740  transposase  42.42 
 
 
108 aa  62.4  0.000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  1.53193e-56  normal  0.308652 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12380  transposase  42.42 
 
 
108 aa  62.4  0.000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  1.5215000000000001e-31  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12417  transposase  42.42 
 
 
108 aa  62.4  0.000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  1.85202e-36  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17790  Transposase  36.54 
 
 
106 aa  62  0.000000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.837137  normal  0.630679 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5972  transposase IS3/IS911 family protein  39.58 
 
 
114 aa  62  0.000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.540441  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3607  transposase IS3/IS911 family protein  40.19 
 
 
108 aa  61.6  0.000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00876611  normal  0.0408746 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3482  transposase IS3/IS911 family protein  40.19 
 
 
108 aa  61.6  0.000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0265992  hitchhiker  0.00308131 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2529  transposase IS3/IS911 family protein  40.19 
 
 
108 aa  61.6  0.000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000000311757  hitchhiker  0.00296744 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1140  transposase IS3/IS911 family protein  38.95 
 
 
107 aa  61.6  0.000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.816485  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10240  Transposase  35.05 
 
 
97 aa  61.6  0.000000004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3194  transposase IS3/IS911 family protein  37.11 
 
 
102 aa  61.2  0.000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0960855  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4729  transposase IS3/IS911 family protein  47.54 
 
 
105 aa  60.1  0.000000009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1133  ISSod1, transposase OrfA  43.33 
 
 
96 aa  60.1  0.00000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3397  ISSod1, transposase OrfA  43.33 
 
 
96 aa  60.1  0.00000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3569  ISSod1, transposase OrfA  43.33 
 
 
96 aa  60.1  0.00000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1741  transposase IS3/IS911 family protein  43.33 
 
 
96 aa  60.1  0.00000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.26041 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>